北化工王振刚教授团队: 利用阳离子肽加速DNA链置换反应以激活DNA纳米器件

学术   2024-09-09 14:05   北京  

研究背景

Toehold 介导的链置换反应(TMSD)是实现DNA纳米结构动态控制和驱动的关键机制。然而,TMSD 反应本身动力学缓慢,制约了需要快速响应和稳定性能的复杂 DNA 纳米器件的发展,限制了其在生物传感、诊断和靶向药物递送等领域的应用。

为克服这一挑战,研究人员一直在探索各种策略以加速 TMSD 反应及 TMSD 驱动的 DNA 纳米器件。优化 toehold 长度和序列是常用的方法,通过提高入侵链与靶链的初始结合速率来加速反应。然而,较长的 toehold 可能在复杂的 DNA 网络中引发不必要的泄漏反应,尤其是在涉及串扰或级联反应的系统中。近年来还发展了其他方法,包括生物加速(如生物催化或蛋白质结合途径)、冻融循环、纳米界面调控、极性有机溶剂、嵌段共聚物、超分子聚合物模板以及主客体相互作用等。然而,这些方法也存在一些问题,如影响 DNA 纳米结构的稳定性、合成过程复杂、成本高、操作繁琐或引发意外副反应,限制了其在复杂 DNA 器件中的应用。

研究内容

近日,北京化工大学王振刚教授团队提出利用阳离子肽(寡聚精氨酸)加速 toehold 介导的链置换反应 (TMSD),实现了在低离子强度条件下对 DNA 纳米机器和逻辑门(AND 和 OR)的操控。阳离子肽如同 DNA 的“伴侣”,通过静电相互作用增强入侵链与靶链之间的结合。这项工作不仅为理解静电相互作用在 DNA 纳米技术中的角色提供了新的见解,还证明了利用简单肽段来调控 DNA 相互作用的可行性,为动态 DNA 纳米器件的设计和开发开辟了新的道路。此外,在低离子强度下操作这些器件的能力,也拓展了其在生物和医学领域的潜在应用前景。
  • Fig. 1. Schematic illustration of the cationic peptide-promoted activation of (A) DNA mechanical and (B) computing devices.

相关成果以“Enhancing DNA-based nanodevices activation through cationic peptide acceleration of strand displacement”(《利用阳离子肽加速DNA链置换反应以激活DNA纳米器件》)为题,发表在英国皇家化学会期刊 Nanoscale Horizons 上。

论文信息

  • Enhancing DNA-based nanodevices activation through cationic peptide acceleration of strand displacement

    Xianxue Zhang, Ruikai Du, Shichao Xu, Xinyue Wang and Zhen-Gang Wang*王振刚,北京化工大学)

    Nanoscale Horiz., 2024, 9, 1582-1586
    https://doi.org/10.1039/D4NH00252K

作者简介

张宪雪 硕士研究生
北京化工大学
本文第一作者,2022 年本科毕业于烟台大学,随后在北京化工大学材料科学与工程学院攻读硕士学位,目前已经以第一作者在 Nanoscale Horizons 期刊发表论文一篇。主要研究方向是超分子组装和仿酶催化剂的设计。





王振刚 教授
北京化工大学
本文通讯作者,北京化工大学材料科学与工程学院教授,博士生导师。已发表 SCI 收录论文 80 余篇,其中以通讯或第一作者署名在 Nat. Mater., Nat. Commun., Acc. Mater. Res. 等期刊发表论文近 60 篇,获六项中国发明专利授权。主持承担或完成国家自然科学基金项目和北京市自然科学基金项目等,曾获得中国科学院卢嘉锡青年科学人才奖,入选中国科学院青年创新促进会会员和中国化学会高级会员。

相关期刊

Urgent short reports of exceptionally high quality & innovative nanoscience & nanotechnology

rsc.li/nanoscale-horizons

Nanoscale Horiz.

2-年影响因子*8.0
5-年影响因子*8.8
JCR 分区*Q1 材料-多科学
Q1 纳米科学技术
Q2 化学-物化
CiteScore 分16.3
中位一审周期41 


Nanoscale Horizons 是纳米科学与技术领域的领导性期刊,发表高质量、高创新性的研究成果。该期刊侧重于原创性研究,强调所发表的论文要提出新的概念或新的思维方式(概念上的进展),而不是以报道技术方面的进展为主。当然,在概念上未有创新但实现了突破性进展的杰出工作(例如材料性能突破已有纪录)也有被发表的机会。另外,该刊要求所发表的论文能引起纳米科学与技术各领域读者的广泛兴趣。该刊由英国皇家化学会同中国国家纳米科学中心共同出版。

Chair
  • Katharina Landfester
    🇩🇪 马克斯普朗克聚合物研究所

Scientific editors
  • Katsuhiko Ariga
    🇯🇵 日本国立材料科学研究所

  • Wenlong Cheng (程文龙)
    🇦🇺 悉尼大学

  • Yves Dufrêne
    🇧🇪 天主教鲁汶大学

  • Anna Fontcuberta i Morral
    🇨🇭 洛桑联邦理工学院

  • Dirk Guldi
    🇩🇪 埃尔兰根-纽伦堡大学

  • Zhiyong Tang (唐智勇)
    🇨🇳 国家纳米科学中心

  • Jinlan Wang (王金兰)
    🇨🇳 东南大学

Editorial board members

  • Miaofang Chi
    🇺🇸 橡树岭国家实验室

  • Jin-Hong Park
    🇰🇷 成均馆大学

  • Miqin Zhang
    🇺🇸 华盛顿大学

* 2023 Journal Citation Reports (Clarivate, 2024)
 CiteScore 2023 by Elsevier
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