CHARLS研究中的数据新视角:分段线性回归深度复现

文摘   2024-11-14 09:53   美国  

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    错过后悔!捕捉非线性趋势的变化--分段线性回归

    首先给大家介绍一下分段线性回归模型它是一种回归模型,允许数据在某些拐点(breakpoints)之后展示不同的线性关系,它通过在不同区间中使用不同的线性模型来捕捉非线性趋势的变化
关键特点:数据的不同段可以具有不同的斜率。②分段的拐点(breakpoints)是模型中的一个关键参数。③与多项式回相比,分段线性回归在处理数据的不同趋势时更加灵活。
基本形式
对于给定的自变量:假设存在一个或多个拐点,分段线性回归模型可以表示为:
接下来给大家带来一篇应用分段线性回归的典型文章。
关键词中国健康与养老追踪调查(CHARLS)血肌酐与尿素氮比值(BUN/Cr)身体虚弱(标准化握力;椅子站立时间);分段线性回归模型

2023年3月,温州医科大学某团队在Aging clinical and experimental research(JCR 2区,IF: 3.4)上发表了题为:Blood urea nitrogen to creatinine ratio is associated with physical frailty in older‑aged Chinese: a cross‑sectional study 研究论文,调查了血肌酐与尿素氮比值(BUN/Cr)身体虚弱(标准化握力;椅子站立时间)的风险之间的关联。

研究背景:老年患者血尿素氮与肌酐比值(BUN/Cr)身体虚弱的关系仍不清楚。本研究旨在调查中国老年人群中BUN/Cr比值与身体虚弱之间的关系。

方法:在这项横断面分析中,2015年5213名参与者的临床数据选自中国健康与养老追踪调查(CHARLS)。测量人口统计学变量(包括年龄和性别)健康行为(包括吸烟和饮酒史)人体测量(包括收缩压和舒张压、腰围(WC)等)身体表现(即握力、重复椅子站立等)生化指标(即血尿素氮(BUN)、肌酐(Cr)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)等),分析了BUN/Cr比值与身体虚弱之间的关系。
结果:校正潜在混杂因素后,平滑曲线拟合(smooth curve fitting)显示BUN/Cr比值与握力呈线性关系BUN/Cr比值与重复椅子时间呈非线性关系
完全校正的线性回归(fully adjusted linear regression)结果显示BUN/Cr比值与握力呈负相关

多变量分段线性回归(multi-variate, piecewise linear regression)中,当BUN/Cr比值大于18.60时,重复椅子时间随着BUN/Cr比值的增加而增加(β=0.046,95%CI 0.025,0.066;p<0.001);然而,当BUN/Cr比值小于18.60时,我们没有观察到显著的相关性(β=-0.007,95%CI-0.046,0.032;p=0.717)。

结论:本研究表明,BUN/Cr比值可能与中国老年人的身体虚弱有关,这种相关性需要进一步研究。

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线性回归--Life satisfaction, depressive symptoms, and blood pressure in the middle-aged and older Chinese population 中科院2区 3.5分

②线性回归+中介分析--The relationship between handgrip strength and cognitive function among older adults in China: Functional limitation plays a mediating role 中科院2区 4.9分

logistic回归--Dose–response relationship between Chinese visceral adiposity index and type 2 diabetes mellitus among middle-aged and elderly Chinese 中科院2区 3.9分

charls+环境--Systemic inflammation accelerates the adverse effects of air pollution on metabolic syndrome: Findings from the China health and Retirement Longitudinal Study (CHARLS) 中科院2区 7.7分

轨迹分析+HRS+ELSA--Eight-year total, cognitive-affective, and somatic depressive symptoms trajectories and risks of cardiac events 中科院1区 5.8分

GBTM+轨迹分析--Associations between social and intellectual activities with cognitive trajectories in Chinese middle-aged and older adults: a nationally representative cohort study 中科院1区 7.9分

Cox比例风险回归--Tobacco smoke and all-cause mortality and premature death in China: a cohort study 中科院2区 3.5分

预测模型--Development and validation of a risk prediction model for frailty in patients with diabetes 中科院2区 3.4分

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课程目录

1.R语言基础

2.统计学基础

2.1.描述性统计分析(频数表、相关、t检验、非参数检验、趋势性检验)
2.2.处理缺失值(多重插补、其他方法)
2.3.回归分析(logistic回归、泊松回归、简单线性回归、多元线性回归、广义线性模型、LASSO分析)
2.4.主成分分析和因子分析 
2.5.聚类分析 
2.6.生存资料分析 
2.7.纵向数据的轨迹分析 
2.8.预测模型  

3.CharlsMAX包实操复现教学

3.1.根据文章复现进行实操学习

3.1.1.charlsAMX包使用方法

通过charlsMAX包示例代码演示以及配套网站(charlsMAX search网站)使用

3.1.2.复现文章1-多元线性回归:Life satisfaction, depressive symptoms, and blood pressure in the middle-aged and older Chinese population

3.1.3.复现文章2-线性回归  Bootstrap  中介分析  多重插补  敏感性分析 :The relationship between handgrip strength and cognitive function among older adults in China: Functional limitation plays a mediating role

3.1.4.复现文章3-多变量回归  限制性立方样条 ROC  交互作用 分层分析Dose–response relationship  between Chinese visceral  adiposity index and type 2  diabetes mellitus among  middle-aged and elderly Chinese

3.1.5.复现文章4-环境污染与charls数据库联合----JCR1区/7.7分Systemic inflammation accelerates the adverse effects of air pollution on metabolic syndrome: Findings from the China health and Retirement Longitudinal Study (CHARLS)

3.1.6.复现文章5-HRS与ELSA数据库联合---JCR1区/5.8分Eight-year total, cognitive-affective, and somatic depressive symptoms trajectories and risks of cardiac events

3.1.7.复现文章6-GBTM+轨迹分析--中科院1区 7.9分Associations between social and intellectual activities with cognitive trajectories in Chinese middle-aged and older adults: a nationally representative cohort study

3.1.8.复现文章7-分段线性--中科院三区3.4分Blood urea nitrogen to creatinine ratio is associated with physical frailty in older-aged Chinese: a cross-sectional study

3.1.9.复现文章8-纵向研究-中科院一区8.5分Association of metabolic syndrome severity with frailty progression among Chinese middle and old-aged adults: a longitudinal study

3.2.charls传统代码学习

3.2.1.charls数据结构探索

3.2.2.关联性分析实操及复现

3.2.3.生存分析实操及复现-Cox比例风险回归--中科院2区 3.5分Tobacco smoke and all-cause mortality and premature death in China: a cohort study

3.2.4.预测模型--中科院2区 3.4分Development and validation of a risk prediction model for frailty in patients with diabetes

4.各国健康数据库学习

4.1.HRS数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理

4.2.ELSA数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理

4.3.SHARE数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理

4.4.MHAS数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理

4.5.CLHLS数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理

4.6.CHNS数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理

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