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已上传心脏代谢指数 （CMI）、估计葡萄糖处理率 （eGDR）、肌酐与胱抑素C比值（CCR）、估计肾小球滤过率 （eGFR）、胰岛素抵抗代谢评分（METS-IR）、AIP（动脉粥样硬化指数）、智力活动指数等多个热门变量至R包，发文更easy！
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为了让数据计算和发文更方便、精准，我们建议使用harmonised数据（关于harmonised数据的介绍在这篇推文）进行分析，尤其是以下常规变量：年龄、教育程度、婚姻状态、居住地、BMI、握力、慢病数量、吸烟、饮酒、SBP、DBP、ADL、IADL、生活满意度、抑郁（CESD评分）、认知。
在此基础上，你还可以结合发文热门的二次变量进行深入分析，包括但不限于：
| 名称 | 名称 |
|---|---|
| 贫血 | 血脂异常（根据病史、体检数据、用药情况判断） |
| 心脏代谢指数 （CMI） | 心脏代谢共病（CMM） |
| 估计葡萄糖处理率 （eGDR） | 心脏代谢指数（CMI） |
| 高血压（根据病史、体检数据、用药情况判断） | PEF的实际值占预测值的%多少（PEF%） |
| 糖尿病前期（根据病史、体检数据、用药情况判断） | 严重肺气流受限 |
| 社会活动指数（Social_Score） | 肌酐与胱抑素C比值（CCR） |
| 估计肾小球滤过率 （eGFR） | 胰岛素抵抗代谢评分（METS-IR） |
| 基础代谢率（BMR，Mifflin-St Jeor方程） | 基础代谢率（BMR，哈里斯-班尼迪克特方程） |
| TyG-WHtR（甘油三酯葡萄糖-腰围身高比） | TyG-WC（甘油三酯葡萄糖-腰围） |
| 甘油三酯-葡萄糖指数（TyG） | TyG-BMI（甘油三酯葡萄糖-体质指数） |
| ABSI（体型指数） | 中国人内脏脂肪指数（CVAI） |
| 圆锥性指数 | LAP（脂质累计指数） |
| BRI（身体圆度指数） | VAI（内脏脂肪指数） |
| WHtR（腰围身高比） | AIP（动脉粥样硬化指数） |
| 糖尿病（根据病史、体检数据、用药情况判断） | 智力活动指数 |
| 继续补充中》》》》》》》》》》》》》 | |
如何轻松提取变量？--使用charlsMAX包+配套网站使用
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library(charlsMAX)#运行R包design <- c("Anaemia_preset_2011",#贫血"CMI_preset_2011",#心脏代谢指数"eGDR_preset_2011",#估计葡萄糖处理率"pre-diabetes_preset_2011",#糖尿病前期"Social_Score_w3_preset",#社会活动指数"eGFR_w1_preset",#估计肾小球滤过率"Dyslipidemia_w1_preset",#血脂异常"CMM_w1_preset",#心脏代谢共病"CMI_w1_preset",#心脏代谢指数"PEF_w1_preset",#PEF的实际值占预测值的%多少"Severe_pulmonary_flow_restriction_w1_preset",#严重肺气流受限"CCR_w1_preset",#肌酐与胱抑素C比值"Mets_IR_w1_preset",#胰岛素抵抗代谢评分"BMR_mifflin_w1_preset",#基础代谢率（BMR，Mifflin-St Jeor方程）"BMR_hb_w1_preset",#基础代谢率（BMR，哈里斯-班尼迪克特方程）"TyG_WHtR_w1_preset",#TyG-WHtR（甘油三酯葡萄糖-腰围身高比）"TyG_WC_w1_preset",#TyG-WC（甘油三酯葡萄糖-腰围）"TyG_w1_preset",#甘油三酯-葡萄糖指数（TyG）"TyG_bmi_w1_preset",#TyG-BMI（甘油三酯葡萄糖-体质指数）"CVAI_w1_preset",#中国人内脏脂肪指数（CVAI）"CI_w1_preset",#"LAP_w1_preset",#LAP（脂质累计指数）"BRI_w1_preset",#BRI（身体圆度指数）"ABSI_w1_preset",#ABSI（体型指数）"VAI_w1_preset",#VAI（内脏脂肪指数）"WHtR_W1_preset",#WHtR（腰围身高比）"AIP_w1_preset",#AIP（动脉粥样硬化指数）"Diabete_w1_preset",#糖尿病（根据病史、体检数据、用药情况判断）"Intelligence_Score_w1_preset"#智力活动指数)column_names <- get_descriptions(design)# 获取原始数据df <- fetch_CHARLS_data(design, merge_method ="left",column_names)
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codebook查询功能，目前支持CHARLS, CHNS, CLHLS, ELSA, MHAS, SHARE, HRS数据库。
数据预览功能，根据code预览对应原始数据（速度极快），便于大家理解数据的构成与内容，支持目前的7个数据库。
3. 目前可直接提取二次变量50余个（包含Tyg指数、CVAI、ABSI、动脉粥样硬化指数等等），不断更新中....
4.首发环境数据，内置11余种空气污染物数据信息，对接数据库发高分！
5. 每周一加更多国数据库联合文章复现！目前已更新如下复现文章（五星好评！）
①线性回归--Life satisfaction, depressive symptoms, and blood pressure in the middle-aged and older Chinese population 中科院2区 3.5分
②线性回归+中介分析--The relationship between handgrip strength and cognitive function among older adults in China: Functional limitation plays a mediating role 中科院2区 4.9分
③logistic回归--Dose–response relationship between Chinese visceral adiposity index and type 2 diabetes mellitus among middle-aged and elderly Chinese 中科院2区 3.9分
④charls+环境--Systemic inflammation accelerates the adverse effects of air pollution on metabolic syndrome: Findings from the China health and Retirement Longitudinal Study (CHARLS) 中科院2区 7.7分
⑤轨迹分析+HRS+ELSA--Eight-year total, cognitive-affective, and somatic depressive symptoms trajectories and risks of cardiac events 中科院1区 5.8分
⑥GBTM+轨迹分析--Associations between social and intellectual activities with cognitive trajectories in Chinese middle-aged and older adults: a nationally representative cohort study 中科院1区 7.9分
⑦Cox比例风险回归--Tobacco smoke and all-cause mortality and premature death in China: a cohort study 中科院2区 3.5分
⑧预测模型--Development and validation of a risk prediction model for frailty in patients with diabetes 中科院2区 3.4分
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课程目录
1.R语言基础
2.统计学基础
| 2.1.描述性统计分析（频数表、相关、t检验、非参数检验、趋势性检验） |
| 2.2.处理缺失值（多重插补、其他方法） |
| 2.3.回归分析（logistic回归、泊松回归、简单线性回归、多元线性回归、广义线性模型、LASSO分析） |
| 2.4.主成分分析和因子分析 |
| 2.5.聚类分析 |
| 2.6.生存资料分析 |
| 2.7.纵向数据的轨迹分析 |
| 2.8.预测模型 |
3.CharlsMAX包实操复现教学
3.1.根据文章复现进行实操学习
3.1.1.charlsAMX包使用方法
通过charlsMAX包示例代码演示以及配套网站（charlsMAX search网站）使用
3.1.2.复现文章1-多元线性回归：Life satisfaction, depressive symptoms, and blood pressure in the middle-aged and older Chinese population
3.1.3.复现文章2-线性回归 Bootstrap 中介分析 多重插补 敏感性分析 ：The relationship between handgrip strength and cognitive function among older adults in China: Functional limitation plays a mediating role
3.1.4.复现文章3-多变量回归 限制性立方样条 ROC 交互作用 分层分析Dose–response relationship between Chinese visceral adiposity index and type 2 diabetes mellitus among middle-aged and elderly Chinese
3.1.5.复现文章4-环境污染与charls数据库联合----JCR1区/7.7分Systemic inflammation accelerates the adverse effects of air pollution on metabolic syndrome: Findings from the China health and Retirement Longitudinal Study (CHARLS)
3.1.6.复现文章5-HRS与ELSA数据库联合---JCR1区/5.8分Eight-year total, cognitive-affective, and somatic depressive symptoms trajectories and risks of cardiac events
3.1.7.复现文章6-GBTM+轨迹分析--中科院1区 7.9分Associations between social and intellectual activities with cognitive trajectories in Chinese middle-aged and older adults: a nationally representative cohort study
3.1.8.复现文章7-分段线性--中科院三区3.4分Blood urea nitrogen to creatinine ratio is associated with physical frailty in older-aged Chinese: a cross-sectional study
3.1.9.复现文章8-纵向研究-中科院一区8.5分Association of metabolic syndrome severity with frailty progression among Chinese middle and old-aged adults: a longitudinal study
3.2.charls传统代码学习
3.2.1.charls数据结构探索
3.2.2.关联性分析实操及复现
3.2.3.生存分析实操及复现-Cox比例风险回归--中科院2区 3.5分Tobacco smoke and all-cause mortality and premature death in China: a cohort study
3.2.4.预测模型--中科院2区 3.4分Development and validation of a risk prediction model for frailty in patients with diabetes
4.各国健康数据库学习
4.1.HRS数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理
4.2.ELSA数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理
4.3.SHARE数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理
4.4.MHAS数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理
4.5.CLHLS数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理
4.6.CHNS数据库申请账户、数据结构探索、数据下载及处理
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