论著|基于5种遗传模型评估亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂相关性的meta分析

学术   2025-01-24 17:03   北京  

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本文引用格式:霍梦月, 梅花, 张钰恒, 等. 基于5种遗传模型评估亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂相关性的meta分析[J]. 中华围产医学杂志, 2024, 27(12): 1024-1034. DOI: 10.3760/cma.j.cn113903-20230725-00046.



霍梦月 梅花 张钰恒 宋丹 新春
(内蒙古医科大学附属医院新生儿科,呼和浩特 010050)
基金信息:内蒙古自治区自然科学基金项目(2023QN08027、2020MS08034);内蒙古自治区科技计划项目(202201291)

摘 要

目的评估亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)A1298C多态性与非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)患病风险的相关性。

方法检索Embase、Web of Science、MEDLINE、PubMed、Cochrane Central Register of Controlled Trials (Central)、护理学全文数据库(CINAHL)、临床试验注册平台(ClinicalTrials.gov),以及中国生物医学文献数据库、维普数据库、中国知网、万方数据库和中华医学期刊全文数据库。中文检索式为“非综合征性唇裂和/或腭裂 OR 唇/腭裂” AND “亚甲基四氢叶酸还原酶 OR 5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶” AND “多态性 OR A1298C OR 1298A>C”,英文检索式为“nonsyndromic cleft lip and/or cleft palate OR nonsyndromic cleft lip with or without palate OR NSCL/P” AND “5,10-methylenetetrahydrofolate reductase OR methylenetetrahydro- folate reductase OR MTHFR” AND “ A1298C OR 1298A>C OR rs1801131 OR polymorphism”。检索建库至2023年2月28日的文献。以NSCL/P患者和对照组为研究对象,收集描述5种遗传模型(等位基因模型、纯合比较模型、杂合比较模型、显性比较模型和隐性比较模型)下MTHFR A1298C多态性与NSCL/P易感性的研究,依据文献纳入及排除标准进行文献筛选和质量评价,采用Review Manager 5.3软件进行meta分析,并根据种族、对照来源和基因分型方法进行亚组分析。

结果共纳入24项符合入选标准的研究,共计8 841例患儿,其中NSCL/P组3 761例,对照组5 080例。在5种遗传模型中,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险均无相关性(等位基因模型:OR=1.07,95%CI:1.00~1.15,I2=49%,P=0.06;纯合比较模型:OR=1.06,95%CI:0.90~1.26,I2=23%,P=0.48;杂合比较模型:OR=1.05,95%CI:0.95~1.15,I2=59%,P=0.36;显性比较模型:OR=1.04,95%CI:0.95~1.14,I2=58%,P=0.34;隐性比较模型:OR=1.04,95%CI:0.89~1.23,I2=22%,P=0.60)。只有在等位基因遗传模型下,亚洲人群中MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间明显相关(OR=1.15,95%CI:1.01~1.31,I2=62%,P=0.04),其余种族及任意遗传模型下,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间均无相关性。在杂合比较遗传模型下,当对照组病例来源于医院时,MTHFR A1298C多态性与人群中NSCL/P发生风险之间存在相关性(OR=1.15,95%CI:1.02~1.30,I2=69%,P=0.03)。无论使用何种基因分型方式,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间均无相关性。所有漏斗图均呈对称性,表明在本次meta分析中不存在明显的发表偏倚。敏感性分析结果显示,没有单项研究会逆转整体研究的结果。

结论MTHFR A1298C多态性与普通人群NSCL/P易感性无关。但在亚洲人中,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P风险升高明显相关。

关键词 唇裂;腭裂;亚甲基四氢叶酸还原酶;多态性;meta分析

唇腭裂是一种常见的颌面部先天性畸形,总发病率约为1/7001。根据是否伴有其他先天性出生缺陷,唇腭裂可分为综合征性唇腭裂(syndromic cleft lip with or without cleft palate, SCL/P)和非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate, NSCL/P),其中NSCL/P占所有唇腭裂病例的70%。NSCL/P的病因较多,且不够明确,但目前认为遗传因素在NSCL/P中起主导作用,遗传力为45%~85%2。一些基因参与了NSCL/P的发生过程,如亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase, MTHFR)、转化生长因子-α(transforming growth factor-α, TGF-α)、肌节同源盒1(muscle segment homeobox 1, MSX1)、小泛素样修饰剂(small ubiquitin-like modifier 1, SUMO1)和干扰素调控因子6(interferon regulatory factor 6, IRF-6)等。因此,筛选并定位NSCL/P的易感基因仍是本病病因学研究的重点和难点。
作为NSCL/P易感候选基因的MTHFR基因定位于染色体1p36.3,编码MTHFR,在生物体叶酸代谢过程中起重要作用。叶酸参与细胞的增殖生长,以及氨基酸及蛋白质的合成等过程。叶酸缺乏或代谢障碍会使DNA低甲基化,进而导致多种神经管缺陷,因此MTHFR基因多态性与多种出生缺陷有关。A1298C是MTHFR研究中一个重要的多态位点,在NSCL/P的遗传过程中有重要作用,但目前关于评估MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险间相关性的研究较少,结果也不尽相同3。本研究拟采用meta分析的方法,基于5种遗传模型,全面评估MTHFR A1298C多态性与NSCL/P的相关性。

资料与方法

一 文献检索

检索Embase、Web of Science、MEDLINE、PubMed、Cochrane Central Register of Controlled Trials(Central)、护理学全文数据库(CINAHL)、临床试验注册平台(ClinicalTrials.gov)、中国生物医学文献数据库、维普数据库、中国知网、万方数据库和中华医学期刊全文数据库等,搜索时间为从数据库或网站建立到2023年2月28日。中文检索式为“非综合征性唇裂和/或腭裂 OR 唇/腭裂” AND “亚甲基四氢叶酸还原酶 OR 5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶” AND “多态性 OR A1298C OR 1298A> C”,英文检索式为“non-syndromic cleft lip and/or cleft palate OR non-syndromic cleft lip with or without cleft palate OR NSCL/P OR Cleft lip/palate” AND “methylenetetrahydrofolate reductase OR 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase OR MTHFR” AND “polymorphism OR A1298C OR 1298A>C”。

二 文献纳入和排除标准

1.纳入标准:(1)研究对象:NSCL/P患者(病例)和对照组。(2)研究类型:病例对照研究。(3)内容:描述MTHFR A1298C多态性与NSCL/P相关性的研究,且对照组基因型分布符合Hardy- Weinberg平衡。(4)结果测量的类型:病例组和对照组提供的每个基因型频数完整,且描述本meta分析中至少一个主要或次要结果指标。
2.排除标准:动物研究;非中英文文献;重复出版的文献;无法获取全文、无法提取充分信息或无法进行合并分析的文献。

三 资料提取

根据纳入及排除标准,由2名研究人员独立筛选文章并提取数据。若存在意见不统一,则由第3名研究人员确定。从纳入的文献中提取以下信息。(1)文献基本特征(作者、年份、国家)。(2)研究对象(对照来源、DNA来源、基因分型方法、病例和对照组的样本量)。(3)主要结果(每个基因型的频率)。

四 质量评估

纳入文献质量评估采用纽卡斯尔-渥太华量表(Newcastle-Ottawa Scale, NOS),主要包括研究人群选择(0~4分)、组间可比性(0~2分)和暴露因素测量(0~3分)等3个方面。NOS满分为9分,总分0~4分为低质量,5~6分为中等质量,≥7分为高质量4

五 统计学分析

使用Review Manager 5.3进行meta分析。首先对所纳入的文献进行异质性检验。当I2≤50%且P≥0.1时,表示各文献间不存在异质性,使用固定效应模型分析;反之表示纳入文献间存在异质性,需通过亚组分析进一步分析异质性的来源。在尽可能排除异质性影响后,采用随机效应模型分析。遗传多态性分析包括5种遗传模型:等位基因模型、纯合比较模型、杂合比较模型、显性比较模型和隐性比较模型,记录各种模型的OR值和95%CIP<0.05为差异有统计学意义。对纳入研究的对照组基因型进行Hardy-Weinberg平衡检验,P>0.05为遵循Hardy-Weinberg平衡定律。最后通过逐项剔除纳入文献的方法观察剔除研究对总合并效应量的影响,以进行敏感性分析。

结 果

一 纳入文献的质量及基本信息

检索获得文献239篇,根据纳入和排除标准,最终24篇文献5-28进入本次meta分析,均为中高质量文献,包括8 841例研究对象,其中NSCL/P组3 761例,对照组5 080例。纳入文献的基本信息和NOS得分见表1,文献筛选流程见图1。

表1   纳入文献的一般特征

注:PCR:聚合酶链反应(polymerase chain reaction);RFLP:限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism);ARMS:扩增阻滞变异系统(amplification refractory mutation system);NSCL/P:非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate);NOS:纽卡斯尔-渥太华量表(Newcastle-Ottawa Scale)


图1   本研究纳入文献筛选流程图

二 meta分析结果

在5种遗传模型中,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险均无相关性(等位基因模型:OR=1.07,95%CI:1.00~1.15,I2=49%,P=0.06;纯合比较模型:OR=1.06,95%CI:0.90~1.26,I2=23%,P=0.48;杂合比较模型:OR=1.05,95%CI:0.95~1.15,I2=59%,P=0.36;显性比较模型:OR=1.04,95%CI:0.95~ 1.14,I2=58%,P=0.34;隐性比较模型:OR=1.04,95%CI:0.89~1.23,I2=22%,P=0.60)。见图2~6。

图2   亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险间相关性的等位基因模型森林图 可见在该遗传模型中,亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险无相关性

注:NSCL/P:非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate)

图3   亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险间相关性的纯合比较模型森林图 可见在该遗传模型中,亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险无相关性

注:NSCL/P:非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate)

图4   亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险间相关性的杂合比较模型森林图 可见在该遗传模型中,亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险无相关性

注:NSCL/P:非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate)

图5   亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险间相关性的显性比较模型森林图 可见在该遗传模型中,亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险无相关性

注:NSCL/P:非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate)

图6   亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险间相关性的隐性比较模型森林图 可见在该遗传模型中,亚甲基四氢叶酸还原酶A1298C多态性与非综合征性唇腭裂发生风险无相关性

注:NSCL/P:非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate)

三 亚组分析

1.根据种族的亚组分析:只有在等位基因遗传模型下,亚洲人群中MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间明显相关(OR=1.15,95%CI:1.01~1.31,I2=62%,P=0.04),其余种族及任意遗传模型下,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间均无相关性(表2)。

表2   5种模型评价不同种族、对照组病例来源和基因分型方法分析的MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险间的相关性

注:PCR:聚合酶链反应(polymerase chain reaction);RFLP:限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism);NSCL/P:非综合征性唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate);MTHFR:亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase)


2.根据对照组病例来源的亚组分析:在杂合比较遗传模型下,当对照组病例来源于医院时,MTHFR A1298C多态性与人群中NSCL/P发生风险之间存在相关性(OR=1.15,95%CI:1.02~1.30,I2=69%,P=0.03)(表2)。
3.根据基因分型方法的亚组分析:无论使用何种基因分型方式,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间均无相关性(表2)。

四 文献偏倚评价

图7为在5种遗传模型下MTHFR A1298C多态性和NSCL/P发生风险间相关性的漏斗图。所有漏斗图均呈对称性,表明在本次meta分析中不存在明显的发表偏倚。

五 敏感性分析

对纳入的文献采用逐一单项剔除的方法进行敏感性分析,结果均未发生方向性改变,表明本次meta分析结果相对稳定和可靠。

讨 论

随着近年来对唇腭裂相关研究的不断深入,已发现唇腭裂,特别是NSCL/P的病因涉及遗传因素、环境因素及其两者间的相互作用,是一种多基因多因素的疾病,具有遗传易感性,因此,多数研究已将其重点着眼于基因的变异及易感基因的筛选与定位。本研究基于5种遗传模型,采用meta分析的方法,全面评估了MTHFR A1298C多态性与发生NSCL/P的相关性,结果发现MTHFR A1298C多态性与人群中NSCL/P发生风险升高之间没有关联。

一 MTHFR A1298C多态性与NSCL/P患病风险的关系

叶酸是一种水溶性B族维生素,是体内重要的甲基供体,其正常代谢不仅有助于维持正常的DNA甲基化,还可促进DNA从头合成及修复,若其代谢途径中相关酶基因发生变异,将会通过影响DNA甲基化,导致染色体畸变,进而引起某些疾病29-30。孕早期叶酸摄入不足可一定程度升高NSCL/P的发生率,但叶酸摄入充足的孕妇所生患儿也会发生NSCL/P,两者没有明显的剂量依赖性。这提示NSCL/P不仅取决于叶酸的摄入量,还与易感基因变异导致叶酸代谢途径异常有关。
MTHFR基因是叶酸代谢途径中重要的酶基因。该基因位于1p36.3,全长27.374 kb,编码656个氨基酸残基组成的蛋白,为机体的正常甲基化过程提供甲基基团。若MTHFR基因发生变异,将严重影响叶酸正常的代谢过程,导致DNA低甲基化、DNA链断裂、染色体重组改变和分离异常,从而干扰DNA合成和DNA损伤修复,致使染色体损伤,最终使机体发生畸形31
MTHFR A1298C是MTHFR基因最常见的单核苷酸多态性变异位点。该基因发生错义变异,碱基C置换A导致编码蛋白质氨基酸序列中谷氨酰胺被丙氨酸替代,进一步导致MTHFR酶活性降低,最终使甲硫氨酸-叶酸代谢出现异常,引起出生缺陷的发生。目前,国内外对MTHFR基因与NSCL/P发生风险的相关性进行了大量的研究,其中C677T是目前较为公认的可升高NSCL/P风险的致病因子,但针对A1298C对NSCL/P的遗传易感性尚存争议。
鉴于目前关于评估MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险间相关性的研究较少,结果也不尽相同,因此,本研究基于5种遗传模型,采用meta分析的方法,全面评估MTHFR A1298C多态性与发生NSCL/P的相关性,为NSCL/P的防治提供理论依据,结果表明,MTHFR A1298C多态性与人群NSCL/P易感性无关。2021年国内一项研究以中国人群为研究对象,对15篇文献进行meta分析,发现MTHFR A1298C多态性可升高中国人群NSCL/P的风险32,与本研究结果不同,考虑可能与本meta分析纳入的研究对象不仅为中国人群,还包括印度、德国、伊朗、泰国、意大利、爱尔兰等多个国家的人群有关。2020年国外一项meta分析以NSCL/P患者和对照组为研究对象,共纳入16项描述MTHFR A1298C多态性与NSCL/P易感性间关系的研究,其中NSCL/P患者2 677例和对照组患儿3 669例,结果显示,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间未见相关3,与本研究结果一致。

二 不同遗传背景对NSCL/P发生风险的影响

在本meta分析中,一些研究具有异质性,因此进一步根据种族、对照来源和基因分型方法进行亚组分析,以确定异质性的来源。按种族划分的亚组分析显示,在亚洲人群中,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间明显相关,但在高加索和混合人群中,在5种遗传模型中的任何一种中,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险之间未见相关性。进一步查阅相关文献发现,2014年一项meta分析为探讨MTHFR A1298C多态性与亚洲人群NSCL/P的关系,共纳入6项病例对照研究,结果显示,无论是东亚或西亚/中亚,MTHFR A1298C多态性与NSCL/P之间均未见相关33。Shu等34对33项研究进行了一项meta分析,其中20项研究描述了MTHFR A1298C多态性与发生NSCL/P的相关性,包括亚洲研究7项,欧洲研究13项,meta分析未发现MTHFR A1298C多态性与NSCL/P发生风险升高之间呈正相关,进一步按种族进行亚组分析,提示在欧洲和亚洲人群中均未检测到MTHFR A1298C多态性与NSCL/P之间的相关性。上述2项研究结果与本研究基于种族的亚组分析结果不同,考虑一方面不除外与纳入研究对象相对有限有关,另一方面可能与本研究的混合人群中不除外包含部分亚洲人群,进而影响结果有关。2021年一项meta分析共纳入22项病例对照研究,其中包括2 814例NSCL/P患者和4 199例对照患儿,结果显示MTHFR A1298C多态性并不会升高NSCL/P的风险,进一步按种族进行亚组分析显示MTHFR A1298C多态性与亚洲人NSCL/P风险升高相关,但在白种人或混合人群中无关,与本研究结果一致35。上述研究提示不同的遗传背景可能是导致人群中相互冲突结果的原因,随后导致对同一疾病的不同遗传易感性。
本研究还根据对照组病例的来源进行了亚组分析,结果表明,当对照组病例来自医院时,MTHFR A1298C多态性与人群中NSCL/P发生风险相关。Niktabar等35的meta分析分层研究显示对照组病例无论是来自社区,还是来自医院,MTHFR A1298C多态性与人群中NSCL/P发生风险之间均未见相关性。Imani等3的meta分析提示MTHFR A1298C多态性与NSCL/P易感性无关,且基于对照病例来源的亚组分析进一步证实了此结果。上述2项研究的结果均与本结果不同,考虑可能与文献纳入对象、文献纳入及排除标准等不同有关,有待进一步研究证实。

三 本研究的优势和局限性

本研究通过大量检索文献,共纳入24项中、高质量文献,基于目前研究证据显示,MTHFR A1298C多态性与5种遗传模型中的任何一种NSCL/P患病风险均无相关性,但按种族进行划分的亚组分析表明,MTHFR A1298C多态性与亚洲人群NSCL/P的发生风险明显相关,提示以种族为切入点,进一步探讨NSCL/P发病机制可能是学者们进一步研究的新方向。尽管本项meta分析包括了目前较新的研究,但仍有一些局限性:(1)虽然本研究已根据种族将研究对象分为高加索、亚洲和混合人群,但混合人群中仍包含很多不同种族患儿,可能影响结果;(2)本研究只纳入了目前已发表的研究和一些正在进行的研究,未发表的研究不包括在内,且有7篇文献经尝试多种方式后仍未获得全文,可能存在偏倚;(3)本研究没有对年龄、性别、家族史、母亲叶酸摄入量、不良嗜好和其他环境暴露因素等数据进行进一步分层研究,导致OR值为未经调整的数据。

四 小结

本研究显示,MTHFR A1298C多态性与增加人群中NSCL/P发生风险之间没有关联,提示MTHFR A1298C多态性可能不是NSCL/P的遗传易感性因素。然而,按种族划分的亚组分析表明,MTHFR A1298C多态性与亚洲人群NSCL/P的发生风险明显相关,这为以后基于种族水平探索NSCL/P发病机制的研究提供了理论依据。同时,期待未来有更多大样本、多中心、设计良好、考虑到基因-基因和基因-环境相互作用的研究进行meta分析,以进一步证实和更新该分析的结果。


利益冲突声明

所有作者声明无利益冲突



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供稿编辑:李晔

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