公立医院是我国医疗卫生服务体系的主体，其服务和绩效表现直接关系大多数群众的看病就医感受。深化公立医院改革的重点是，加快健全维护公益性、调动积极性、保障可持续的公立医院运行机制，大力推进投入政策、编制政策、价格政策、薪酬分配政策等方面改革，加强行业综合监管。
公益性是导向，调动积极性、保障可持续是基础。需要各级政府落实财政补助政策，合理增加投入，解决公立医疗机构长期债务，减轻财务运行压力。建立编制动态调整机制，重点向专业技术人员倾斜，让更多医疗卫生工作者更加有保障。健全目标统一、政策衔接、信息联通、监管联动等医疗、医保、医药协同机制，加强党委政府领导，由一名领导统管医疗、医保、医药工作。建立以医疗服务为主导的收费机制，定期评估、动态调整。
维护公立医院公益性，价格和收费也是一个重要方面。当前的医疗服务价格尤其是技术劳务价格相对偏低。一些新的技术发展很快，但没有及时纳入医保支付体系。群众在治疗疾病的过程中，迫切希望有更多可以报销的诊疗服务项目。要协同有关部门，着力推进新疗法、新技术纳入医保报销范围，就是把临床当中不断创新并且验证成熟的这些技术，能够及时作为医保的可支付的项目来进行补偿。同时也要体现对于短板学科和专业的支持，在价格政策上有所倾斜。
完善薪酬制度，是公立医院改革的一个重要部分。目前公立医院薪酬分配在医院内各个专业各个科室之间不平衡，社会所需要的一些短板学科和专业，长期难以得到加强和发展，如儿科、感染科、麻醉科、病理科、精神卫生科、护理专业等。这就需要从制度上来解决，通过薪酬分配机制的调整补齐短板，推动医疗机构不同科室、不同岗位薪酬更加合理。同时，我们还要在医院的医务人员的收入结构当中进行结构性的调整，也就是要相应地加大固定收入的这种比例。
