Science Bulletin对标PNAS,却成“原住民”自留地?高福院士挂帅的18.8分“神刊”冲顶之路还有多远?来看这一篇

文摘   2024-11-02 10:00   上海  


说到PNASIF:9.4),先不说分数,有多少人能说出一长串的全称呢?诶,馆长可以:就是Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America。别看IF虽然没上10+,但它仍是除了CNS外,圈子内广泛认可的四大顶刊之一呢!这本百年期刊的国际声誉不容小觑~

那你问咱中国有没有和它对标的期刊?还真有!国产期刊《Science Bulletin了解过没?它由中科院和国自科基金委(NSFC)共同主办的(熬油,这个背景强大的嘞),此外,先前国人诺奖获得者屠呦呦教授那篇发现“Artemisinin”的论文也曾刊登在该期刊上,这含金量馆长不必多说了吧。

近年来Science Bulletin影响因子增长迅猛,2022 年IF一度达到 20.577,2024 年影响因子为 18.8,为非预警期刊,在多学科领域JCR 分区为 Q1,虽有波动但仍远超PNAS

关于口碑问题,咱就是说,确实也有点一言难尽...以往发文量中国人占比较高,馆长也看到过一些争议,比如质疑存在 “国内自娱自乐” 的情况,认为应该争取更多的外国学者投稿。到底是真正的顶刊,还是所谓的“原住民自留地”呢?看看大家咋说的:    

那么Science Bulletin的发展到底如何,是虚高还是确有实力?刚好,馆长这就有一篇该期刊文章在手上,前两天刚详细解读了一番,在这分享给大家,咱们一探究竟!

这篇来自复旦大学郁金泰、冯剑锋、程炜研究团队,他们直接挖掘了UKBB数据库46165名成人参与者与抑郁症相关的蛋白质和通路,除了蛋白质组分析,还应用Cox比例风险回归模型、多态性风险评分、孟德尔随机化分析、PPI网络分析等方法,单看分析量确实有两把刷子,看来拿下这18分实力是很在线的!PS:大数据时代,挖掘临床数据库发文,主要就是关注选题,选的好就好发,分析方法搞不定,没关系,馆长可以帮你,很适合临床医生。对数据挖掘和生信分析感兴趣的朋友欢迎联系馆长噢~

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²题目:血浆蛋白质组学鉴定了46,165名成年人与抑郁症相关的蛋白质和途径

²影响因子:IF=18.8

²发表时间:2024年9



研究背景



抑郁症是全球关注的健康问题,目前对其发病机制了解有限。蛋白质组学分析有助于深入了解疾病病理生理过程。以往研究存在样本量小、蛋白质覆盖范围有限和设计缺陷等问题,需要进行大规模纵向研究,并考虑多种生物和环境因素。



数据来源和研究方法



数据来源:来自英国生物银行的 46,165 名参与者数据,包括血液样本用于蛋白质组学分析、定期更新的健康记录、影像数据和问卷调查等。 



研究结果



1.蛋白质与抑郁症发病的关联

确定 157 种与抑郁症发病显著相关的蛋白质,其中 143 种呈正相关,14 种呈负相关。GDF15、PLAUR 与抑郁症风险增加相关,LRRN1、ITGA11 与风险降低相关。在不同敏感性分析和验证分析中,这些蛋白质的相关性仍然显著。

2.抑郁症相关蛋白质与脑结构的关联

50 种蛋白质与至少一种全球脑结构测量指标相关,较高水平的抑郁症风险蛋白质与总灰质体积减少、白质高信号体积增加有关。64 种蛋白质与至少一种脑区域测量指标显著相关,涉及多个与抑郁症相关的脑区。    

3.抑郁症相关蛋白质与多基因风险评分的关联

23 种蛋白质与 PRS 有名义上的显著关联,但经多重校正后无显著关联,50 种蛋白质与重度抑郁症有显著遗传相关性    

4.抑郁症相关蛋白质与应激相关事件的关联

所有 14 项应激相关事件与至少一种蛋白质相关,8 种蛋白质与至少 5 项事件显著相关。应激相关事件与抑郁症状态的关联由 157 种蛋白质介导

5.抑郁症相关蛋白质的表达和功能分析

不同蛋白质在不同组织中的表达水平存在差异,部分蛋白质通过孟德尔随机化分析显示基因表达水平与血浆蛋白质水平有因果关系。157 种蛋白质富集在免疫相关类别,如白细胞激活调节、MAPK 级联调节等,还确定 9 种转录因子参与调节。PPI 网络分析确定关键蛋白质如 EGFR、TNF,以及三个密集连接的网络组件,涉及细胞因子活性、溶酶体和 ECM - 受体相互作用等通路。 

6.药物靶点分析

双向两样本孟德尔随机化分析显示 BTN3A2 与抑郁症有因果关系,其他蛋白质未发现显著因果关联。39 种编码抑郁症相关蛋白质的基因是药物靶点,TNF、EGFR 等与多种疾病相关。



文章小结



研究确定 157 种与抑郁症相关的蛋白质,蛋白质改变可能是应激事件与抑郁症之间的潜在中介,免疫反应通路在抑郁症中具有重要作用研究存在局限性,如队列种族受限,使用医疗记录诊断抑郁症可能存在误差,缺乏脑脊液 / 脑蛋白数据等,但研究优势包括长期随访、多种敏感性分析、广泛的蛋白质分析以及整合多维度因素等。PS:馆长团队除了可以为您提供方案设计和个性化分析,还有课程和服务器供您选择,心动不如行动!最近还有免费课程和服务器试用相送噢,快来了解吧~  

馆长有话说

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