Immunity(IF=25.5):四川大学等团队解析HIF2α在哮喘中的作用

文摘   2024-12-23 09:39   广东  

辅助性T细胞(Th)在体内发挥关键作用,可协调免疫反应以保护机体免受疾病侵害。其中,Th2细胞产生IL-4和IL-5等细胞因子,介导II型免疫反应,抵御寄生虫感染,并促进组织修复。然而,失调的Th2细胞也会引发过敏性哮喘和组织纤维化。目前临床上主要依靠皮质类固醇来抑制炎症和预防哮喘发作。


尽管针对2型细胞因子(如IL-4和IL-5)的新兴生物制剂在治疗重症哮喘上大有潜力,但相当一部分2型哮喘患者对这些疗法并未产生应答,表明Th2细胞间的异质性可能会影响治疗效果。因此,目前迫切需要解析Th2细胞的异质性,了解何种调控机制驱动了致病性Th2细胞的分化,以便开发更有效的治疗方法。


近日,四川大学华西医院张惠媛教授、胡洪波研究员和陆军军医大学刘新东教授领导的研究团队深入剖析了Th2细胞在2型炎症中的异质性,证明了缺氧诱导因子2α(HIF2α)在干细胞样Th2细胞分化为致病性Th2细胞的过程中发挥关键作用。这项研究成果2024年12月10日发表在《Immunity》杂志上。


图片来源:《Immunity》

(https://doi.org/10.1016/j.immuni.2024.11.001


研究材料与方法

在这项研究中,研究人员将Epas1f/f小鼠与CD4Cre+小鼠杂交,构建出T细胞条件性缺失HIF2α小鼠(CD4Cre+ Epas1f/f小鼠),并利用OVA诱导小鼠哮喘模型。他们对哮喘患者和小鼠的CD4+ T细胞开展了scRNA-seq和scTCR-seq等分析,并利用谱系追踪方法勾勒出从干细胞样Th2到致病性Th2细胞的分化轨迹,将HIF2α缺失的致病性Th2细胞过继转移至Rag1-/-小鼠(由赛业生物提供)。在解析机理时,他们采用了ChIP、CUT&Tag等方法。


技术路线

01

构建T细胞条件性缺失HIF2α小鼠,探究HIF2α在Th细胞分化中的功能

02

利用单细胞分析解析Th2细胞的异质性,并通过谱系追踪方法了解其分化

03

分析HIF2α缺失对干细胞样Th2和致病性Th2细胞的影响,并解析背后机理

04

探究HIF2α抑制剂PT-2385是否具有治疗哮喘相关炎症的潜力


研究结果

1

HIF2α缺失影响Th2细胞分化,并减轻哮喘炎症

缺氧是哮喘患者气道中的一个明显特征,而细胞对缺氧的反应往往涉及到缺氧诱导因子的激活。于是,研究人员探究了HIF2α在Th细胞分化中的功能。在分析哮喘和慢性鼻炎患者的CD4+ T细胞的单细胞转录组数据后,他们发现EPAS1(HIF2α编码基因)在Th2细胞中高表达。同样,在哮喘小鼠中,Epas1也在Th2细胞中高表达。在整合人类和小鼠Th2细胞的scRNA-seq数据后,他们发现Th2细胞可分为6个亚簇。其中,EPAS1/Epas1在C1亚簇中高表达,并与这两个物种的致病性Th2特征基因呈正相关,这表明EPAS1/Epas1在致病性Th2细胞中发挥潜在功能。


为了研究HIF2α在Th细胞分化中的功能,研究人员构建出T细胞条件性缺失HIF2α小鼠(CD4Cre+ Epas1f/f小鼠)。他们发现,HIF2α缺失会显著影响Th2细胞的体外分化,并减轻小鼠哮喘模型的气道炎症。重要的是,在CD4Cre+ Epas1f/f小鼠的支气管肺泡灌洗液和肺部,Th2细胞的比例和数量显著减少,IL-4、IL-5、IL-13以及IgE的水平也下降。他们还将WT小鼠和CD4Cre+ Epas1f/f小鼠的骨髓细胞等量混合后移植到小鼠体内,再次建立哮喘模型。他们同样观察到Th2细胞分化受损,表明HIF2α缺失以T细胞内在方式影响Th2细胞分化,而不是受到不同遗传背景下的炎症状态差异影响。


2

HIF2α对致病性Th2细胞的极化至关重要

为了在单细胞水平上全面表征受HIF2α调控的Th2细胞的特性,研究人员从WT和CD4Cre+ Epas1f/f小鼠哮喘模型中分离出肺泡灌洗液细胞,并开展了scRNA-seq和scTCR-seq分析。他们发现,在CD4Cre+ Epas1f/f小鼠中,Th2细胞比例下降2倍,且HIF2α缺陷型Th2细胞功能受损。此外,Th2细胞可被进一步细分为6个亚群(图1)。与WT对照组相比,CD4Cre+ Epas1f/f小鼠的C1亚群比例显著下降,而C2亚群则几乎增加一倍。


转录组分析表明,C1细胞高水平表达Gata3、Epas1、Il1rl1、Il2ra和Pparg,与致病性Th2细胞非常相似;C2细胞则高水平表达Ikzf2、Foxp3和Ccr5。同时,C0细胞表现出干细胞样表型,其特征是Slamf6、Tcf7和Cd200等基因的表达(图1)。因此,研究人员将C0称为干细胞样Th2,将C1称为致病性Th2。此外,他们在哮喘小鼠的颈部浅表淋巴结和脾脏中也发现了干细胞样、致病性和Ikzf2+ Th2亚群。这些结果表明,Th2细胞的异质性是致病性2型免疫反应的共同特征。


克隆多样性分析表明,C0 Th2中的TCR多样性较高,与其干细胞样特征一致。于是,研究人员以初始CD4+ T细胞作为起点,利用Monocle3进行拟时间排序,重建了从C0到C4的发育轨迹。如预期一致,干细胞样细胞(C0)位于初始T细胞之后,在C3和C4之间形成分支,最终形成致病性Th2(C1)和Ikzf2+ Th2(C2)细胞(图1)。根据WT细胞和HIF2α缺失细胞沿轨迹的分布,他们观察到WT细胞倾向于向C1分化,而HIF2α缺失细胞则更多分化为C2细胞。这些结果显示HIF2α在干细胞样Th2细胞极化为致病性Th2细胞的过程中发挥重要作用。


图1 单细胞RNA测序鉴定出异质性的Th2细胞亚群[1]


研究人员观察到,在哮喘诱导过程中,CD4Cre+ Epas1f/f小鼠肺部和肺泡灌洗液中的致病性Th2细胞显著减少,但干细胞样Th2细胞比例增加,表明在缺乏HIF2α的情况下,干细胞样Th2向致病性Th2的分化可能受损。接下来,通过体外分化和体内移植实验,他们观察到HIF2α缺失会显著影响干细胞样Th2细胞向致病性Th2细胞的分化,还会导致干细胞样Th2细胞的增殖能力下降,表明HIF2α调控了干细胞样Th2细胞的分化和功能。值得注意的是,将HIF2α缺失的致病性Th2细胞过继转移至Rag1-/-小鼠(由赛业生物提供)时,小鼠肺部未观察到免疫细胞浸润,IL-4、IL-5和IL-13的表达也显著降低,表明HIF2α在促进致病性Th2细胞功能方面也起着至关重要的作用。


3

HIF2α和GATA3合作促进致病性Th2细胞的分化

在干细胞样Th2细胞向致病性Th2细胞分化的过程中,Epas1的表达与Gata3的诱导同步,因此研究人员假设这些转录因子在分化过程中起着功能协调作用。他们发现,HIF2α促进了Gata3的转录活性,而GATA3在调控Epas1表达中也发挥了重要作用(图2)。后续CUT&Tag分析证实了Epas1和GATA3之间的转录调控。在HIF2α缺失的干细胞样和致病性Th2细胞中,磷脂酰肌醇代谢物显著减少,表明HIF2α-GATA3转录回路可能参与调节磷脂代谢,而单独受GATA3调控的基因则参与了趋化因子产生、维生素代谢以及PI3K-AKT通路的负调控。这些结果表明,HIF2α通过与GATA3协调在干细胞样Th2向致病性Th2的分化过程中发挥独特作用。


那么,HIF2α缺失是否影响PI3K-AKT通路的激活?他们发现,在缺乏HIF2α的情况下,TCR诱导的AKT、S6K和FOXO1磷酸化减少,表明IL4-HIF2α级联参与了Th2分化过程中PI3K-AKT的激活。在应对TCR或细胞因子刺激时,脂质激酶产生的磷脂酰肌醇对激活PI3K-AKT通路至关重要。他们发现编码肌醇多磷酸激酶(IPMK)的Ipmk基因是受到HIF2α和GATA3共同调控的潜在基因。在CD4Cre+ Epas1f/f小鼠的干细胞样和致病性Th2细胞中,Ipmk表达都显著减少,暗示了PI3K-AKT激活缺陷的机制。在HIF2α缺失的T细胞中过表达IPMK可以挽救Th2分化并促进致病性Th2细胞分化,还可以恢复PIP3的合成并促进AKT及其下游信号级联的激活。相反,IPMK抑制剂限制了AKT-FOXO1激活,因此严重损害了Th2分化。这些结果表明,在致病性Th2分化过程中,HIF2α-GATA3回路主要通过调节IPMK的表达来维持TCR-PI3K-AKT的激活。


图2 HIF2α和GATA3合作促进致病性Th2分化[1]


4

HIF2α抑制剂缓解气道炎症

最后,研究人员评估了HIF2α抑制剂PT-2385在治疗哮喘相关气道炎症上的潜力。他们发现PT-2385能显著抑制Th2的体外分化。哮喘小鼠经过PT-2385治疗后,炎症细胞浸润显著下降,Th2细胞频率和数量显著减少,肺泡灌洗液中的L-4、IL-13和IL-5水平降低。scRNA-seq分析表明,PT-2385治疗降低了致病性Th2细胞的频率,并降低了多个Th2亚群中2型免疫反应、细胞因子产生以及PI3K激活相关通路的富集得分。这些数据凸显了PT-2385在治疗哮喘上的潜力。


研究结论

图3 HIF2α通过调节IPMK表达和磷脂酰肌醇代谢[1]


这些研究证实HIF2α通过调节IPMK表达和磷脂酰肌醇代谢,在干细胞样Th2细胞向致病性Th2细胞的分化中发挥关键作用(图3)。因此,HIF2α促进了致病性Th2细胞反应,加剧了Th2介导的哮喘炎症。抑制HIF2α可减轻这一过程并缓解气道炎症,为治疗Th2介导的哮喘提供一种潜在策略。


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参考文献:

[1]Zou et al., Hypoxia-inducible factor 2a promotes pathogenic polarization of stem-like Th2 cells via modulation of phospholipid metabolism, Immunity (2024), https://doi.org/10.1016/j.immuni.2024.11.001


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