基因敲除细胞在疾病研究中至关重要，通过调控目的基因表达，研究人员能借此观察其表型变化以及对于病理过程的影响。近年来，使用KO细胞开展基因功能或信号通路研究的高分文献也越来越多。
如何借助细胞基因编辑模型开展临床前研究？高分文献中有哪些研究思路可以借鉴？我们从过往的客户文献中挑选具有代表性的几篇供大家参考，希望能给你带来启发。
肝细胞癌｜SOX9基因敲除的Huh-7及HEK-293细胞
期刊：（IF=40.8）
Signal Transduction and Targeted Therapy
研究成果：
首次证明了SOX9是驱动YAP核转位的关键调节因子，并提出了通过靶向SOX9-YAP相互作用来治疗YAP驱动癌症的潜在策略。
研究人员委托赛业生物构建了敲除SOX9的Huh-7细胞和HEK-293细胞，并利用过表达SOX9和YAP的慢病毒载体来评估蛋白功能。他们利用免疫共沉淀、体外pull-down分析、邻位连接分析（PLA）和微量热涌动（MST）分析等来探究蛋白之间的相互作用[1]。
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眼部疾病｜iPSC基因敲除
期刊：（IF=14.7）
Nature Communications
研究成果：
探究了一种罕见眼部疾病（中央虹膜发育不全）的遗传基础。他们发现非编码区结构变异通过破坏三维基因组结构导致基因表达发生变化，引发了这种孟德尔遗传病。
研究人员对大家族中的6名患者和6名正常个体进行了全基因组连锁分析，并通过精细定位和单倍型分析确认致病基因的位置。他们还利用增强子敲除的iPSC（由赛业生物提供）和斑马鱼模型来验证APCDD1基因的作用[2]。
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肝癌｜TRIM8基因敲除的HepG2细胞
期刊：（IF=21.8）
Cell Death & Disease
研究成果：
TRIM8通过介导肝细胞核因子1α（HNF1α）泛素化并促进其蛋白降解，在HCC进展过程中发挥了致癌作用。以TRIM8-HNF1α为靶点是一种很有前景的HCC治疗策略。
研究人员构建了TRIM8敲除的HepG2细胞系（由赛业生物提供），他们发现TRIM8基因的敲除显著抑制了HepG2细胞的增殖和克隆形成。并且利用免疫共沉淀和质谱分析等，研究人员确认了TRIM8与HNF1α之间的相互作用及具体机制[3]。
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参考文献：
[1]Qian, H., Ding, CH., Liu, F. et al. SRY-Box transcription factor 9 triggers YAP nuclear entry via direct interaction in tumors. Sig Transduct Target Ther 9, 96 (2024). https://doi.org/10.1038/s41392-024-01805-4
[2] Sun, W., Xiong, D., Ouyang, J. et al. Altered chromatin topologies caused by balanced chromosomal translocation lead to central iris hypoplasia. Nat Commun 15, 5048 (2024). https://doi.org/10.1038/s41467-024-49376-w
[3]Peng, Y., Qian, H., Xu, WP. et al. Tripartite motif 8 promotes the progression of hepatocellular carcinoma via mediating ubiquitination of HNF1α. Cell Death Dis 15, 416 (2024). https://doi.org/10.1038/s41419-024-06819-y
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