生命科学研究对象都呈现三维立体结构，通过显微镜拍摄生物样品的三维序列图像可以帮助我们了解生物体的微观立体结构。当使用蔡司光学显微镜，如激光共聚焦显微镜、光片显微镜、宽场显微镜等获取到三维序列图像后，如何处理和展示图像结果呢？
在往期“蔡司光学课”中已经介绍过蔡司ZEN Lite软件的基本操作（查看更多），本期蔡司光学课，我们一起来学习使用蔡司ZEN Lite处理三维序列图像。
在获取三维序列图像后，图像的左侧会显示如左图的按钮，其中Gallery、Ortho和3D分别可以实现不同的视图功能。
01
Gallery视图功能
三维序列图像是由多张2D图像重构得来，Gallery视图全景展示所有的2D图像。
（1）
创建排布好的多张2D图像：这个功能可以展示目标蛋白在每一层的分布情况，具体操作：Create image from选择 Gallery View，点击Create即可创建出来。此外，排布图像的横向和纵向还可以个性化选择，如果是四维、五维图像还可获得更多展示效果，大家动手试试吧。
（2）
提取三维序列图像中的部分图像：如果我们只想展示三维序列图像中的一部分，Create image from选择 Range Subset 或 Selection Subset 即可实现，点击Create即可创建。其中Range Subset是直接输入起止的数据， Selection Subset 是通过鼠标在Gallery显示的图像中点击选择。
02
Ortho视图功能
如果想看到两个蛋白在Z方向(轴向)的共定位情况，或者用二维图像展示更多的三维信息，那么Ortho视图就可以帮助大家解决这个问题。
（1）
展示三维图像的截面信息：移动Cut lines滑块设置（X/Y/Z轴）的截面位置（或者在图像区域移动红、绿、蓝切线的位置），即可看到不同位置的截面图像。
（2）
最大强度投影（Maximum Intensity Projection MlP)：是三维序列图像最常用的展示方式，即沿着观察方向显示强度最高的像素，可以把三维序列图像的全部信息投影到一张二维图像上。
（3）
New Image from：无论是三维图像的截面信息，还是MIP的结果，设定及调节后，点击Create即可创建一张新的图像，可以导出TIFF或JPG等格式。
03
3D视图功能
拍摄Z-stacks序列图像后，我们希望更好的观察生物样品的三维结构信息，点击3D视图功能后，切换到3D视图界面。在3D视图界面，通过鼠标滚轮和鼠标左键拖拽可以轻松实现图像的放大、缩小以及切换不同视角，立体地观察样品结构。不同的渲染效果配合角度、位置、zoom的调节可以生成单张图像或视频用来展示三维结构信息。
（1）
3D设定：
• 在3D视图界面下，鼠标左键及滚轮配合图像左侧或下方的“波轮状调节带“和各种功能性图标，实现样品三维结构的展示，利用Create Image直接创建2D图像。
• Depth Coding：自动在图像上用彩虹颜色标记三维序列图像的深度（此时的颜色与荧光标记无关，代表三维样品的空间高度信息）。
（2）
Series设定：
• 自定义创建movie用来动态展示三维结构信息。
• movie模式：可以设定旋转方向（X/Y/Z轴）生成视频，或者通过设定图像的起止位置，自由发挥生成视频。
• 设定完成后，点击Apply创建movie，根据frame中设置的数量生成序列图像，再通过Processing中的Movie Export功能获得该视频。
通过以上内容，我们可以使用蔡司ZEN Lite实现对三维序列图像进行不同方式的可视化展示。
蔡司ZEN Lite软件可免费提供给用户处理蔡司显微镜图像，欢迎点击下载这款软件。如果大家对处理三维序列图像还有什么问题，欢迎留言讨论。
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