点击上方 环境微生物组学 关注我们
2024年8月26日，Nature communications在线发表University of Georgia Skidaway Institute of Oceanography&Woods Hole Oceanographic Institution Natalie R. Cohen等人的研究论文：Microeukaryote metabolism across the western North Atlantic Ocean revealed through autonomous underwater profiling。
北大西洋西部包含多样化的生态系统，包括亚热带环流、大陆边缘和富饶的沿海水域，它们的温度、营养物有效性和有机碳含量各不相同。温暖的亚热带环流水域与寒冷、富饶的亚极地水域大致被西边界墨西哥湾流隔开，混合发生在锋面上（图1） 。这些独特的海洋学特性决定了存在的微生物类型及其功能能力，其中距离海岸和温度是影响微生物群落的关键因素。在北大西洋贫营养环流水域中，氮 (N) 限制是自下而上控制浮游植物丰度的主要因素，磷 (P) 和铁 (Fe) 也限制或共同限制生长。人们对亚热带环流和大陆架之间过渡水域微生物群落的代谢状况以及不同的营养供应和物理动力学如何影响这一梯度上的浮游植物生理学了解甚少。
微真核生物是海洋碳循环的关键贡献者。在近海生态系统，尤其是深海中，人们对它们的生理学、生态学以及与化学环境的相互作用了解甚少。利用自主水下航行器Clio，对北大西洋西部 1050 公里横断面上的微生物群落以 10-200 米的垂直深度增量进行了调查，以捕捉横跨贫营养、大陆边缘和生产性沿海生态系统的代谢特征。使用配对的宏转录组学和宏蛋白质组学方法检查微真核生物。文章展示了一个多样化的表面组合，由原生藻菌、甲藻和纤毛虫组成，它们在转录本和蛋白质部分都有所代表，有foraminifera, radiolaria, picozoa, 和discoba蛋白在>200 m 处富集，真菌蛋白出现在 >3000 m 的水域。在广泛的微真核生物群落中，沿海地区发现了氮胁迫生物标志物，而近海地区发现了磷胁迫生物标志物。这个多组学数据集拓宽了我们对微真核生物类群及其功能过程如何沿着温度、光照和营养物质的环境梯度构建的理解。
Composition of eukaryotic RNA and proteins.
Eukaryotic protein network analysis highlighting associations between depth zones.
参考文献
Cohen, N.R., Krinos, A.I., Kell, R.M. et al. Microeukaryote metabolism across the western North Atlantic Ocean revealed through autonomous underwater profiling. Nat Commun 15, 7325 (2024). https://doi.org/10.1038/s41467-024-51583-4
Cohen, N. R. et al. Dinoflagellates alter their carbon and nutrient metabolic strategies across environmental gradients in the central Pacific Ocean. Nat. Microbiol. 6, 173–186 (2021).
更多图形图例、研究内容，推荐阅读原文 ！
如若侵犯到原作者任何相关利益，请告知删除！翻译过程存在不准确或表述不清，以及任何疏漏，欢迎大家后台留言指正。
