真核细胞中蛋白质的分选大致可以分为两条途径。
（1）翻译后转运途径：蛋白质在游离核糖体合成后，转运至细胞核、过氧化物酶体、线粒体及细胞质基质的其他部位；
（2）共翻译转运途径：蛋白质在内质网上的核糖体合成后，转入粗面内质网中，随后经膜泡运输至高尔基体再分选至溶酶体、细胞膜或分泌到细胞外。
细胞必须具有精确有效的机制，确保各种蛋白质在高尔基体TGN区通过形成不同的膜泡以不同的途径被分选、转运到特定的部位。小分子和离子可以顺浓度梯度扩散，或者消耗ATP逆浓度梯度运输，而膜泡这种“大家伙”的运输不仅消耗ATP，还需要马达蛋白的拖拽。
完成细胞内的膜泡运输需要10多种运输小泡，每种小泡表面有特殊的标志以保证运输的准确性。
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