脑影像元分析(META)基础训练营 | 全年随到随学 | ME01A

文摘   科学   2024-07-19 12:01   浙江  

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主办单位

杭州脑海科技有限公司

脑海科技认知神经科学实验室

承办单位

杭州脑呈科技有限公司


















1. 脑海科技脑影像数据分析学习中心介绍


杭州脑海科技有限公司下属的认知神经科学实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,实验室核心团队组建于2018年,为方便实验室同学体系化的掌握脑影像数据分析技术,实验室于2021年成立了脑影像数据分析学习中心。脑海实验室基于学习中心的模式,目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇

鉴于之前的传统培训班的效果难以达到我们的预期,经过团队慎重的考虑,我们将学习中心内容改进升级后,决定将其对外开放申请,相对于传统的培训模式,有以下优势:
1) 随到随学:学习中心全年开放可根据自己的时间预约学习
2) 以小组为单位教学:传统培训班模式每期20~30人,老师很难兼顾不同基础的同学,小组答疑通常一个小组为5人左右,以小组为单位教学及答疑,更高的学习效率
3) 完善的硬件体系:每名学员均配置2台高性能工作站(Intel i7或以上配置),一台用于观看教学视频,另一台用于练习数据分析操作
4) 完善的课程资料体系:包括体系化的数据分析技术视频、理论课程、学习文档以及完整的案例数据,反复看、重复看、体系化系统的学习
5) 支持一对一教学:如有需要,可提供一对一教学及答疑,定制培养方案和学习体系
6) 实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验,联合培养了很多优秀的研究生,如:高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等(鉴于篇幅所限,仅列举部分同学)。
7) 学习中心导师及助教团队有着极其丰富的答疑经验:前期我们已经积累大量学术指导经验,目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验,截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇
8) 学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验,担任50余个SCI杂志审稿人,包括:Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等。
9) 脑海科技团队具有高度交叉背景,背景涵盖:计算机、数学、生物医学工程、心理学、英语、认知神经科学以及临床医学。每名成员均受过体系化科研培训,具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。


2. ME01A训练营介绍


脑影像数据分析学习中心即将推出一系列学习方案,每套学习方案具有唯一编号,大家既可以选择已有学习方案报名,也可以自行提出需求,我们将根据您的实际需求推出新的学习方案体系。我们真诚的希望尽可能灵活的满足大家的需求。
训练营名称:ME01A | 脑影像元分析(META)基础班
训练营编号:ME01A 
课程分类:V
学习时长:2天
课程体系:一共包括5套完整课程,确保大家学会,学全,实打实的掌握技术
总课时数:30.5课时(每课时45分钟)
硬件配置:每名学员独享1台用于观看学习视频的电脑,独享1台用于分析数据的工作站(Intel i7或以上配置)
助教答疑:3-5人为一组,即1名助教负责3-5人的答疑
案例数据:提供参考文献进行元分析实操练习
学习目标:元分析能够系统地汇集和分析来自多个已发表研究的数据,从而识别出在不同研究中可重复的脑区。这一方法尤其有益于那些可能缺乏原始数据的研究者,因为它允许他们即便手头没有直接采集的数据,也能发表高质量的SCI文章。通过元分析,研究者可以评估和确认跨研究的一致性,进而推进我们对大脑功能和结构组织的理解,而无需亲自收集新的实验数据

//训练营日程规划//


每名学员有专属导师定期跟进学习进展,协助调整学习计划

时间范围主题学习目标课后作业与学习效果评估

第1天

上午

元分析整体概述
  • 脑影像元分析的概念与应用

  • 研究问题的提出与确定

  • 文章检索策略与文章纳排标准

  • 元分析注册的方法和注意事项

整理元分析课题的完整流程

第1天

下午

文献检索与元分析软件(AES-SDM)
  • 文献检索技巧

  • 文献检索结果的整

  • 注意事项与技巧

  • AES-SDM的计算原理、提出文献

  • AES-SDM软件下载、安装与设置

整理文献检索技巧

整理AES-SDM工具包的功能与使用注意事项

第1天

晚上

复习
  • 复习当天内容

梳理知识点

第2天

上午

元分析文献解读与元分析软件(GingerALE)
  • 熟悉元分析文献的写作风格

  • 提取写作框架套路

  • 掌握ALE软件的使用

精读课程中的元分析文献案例

第2天

下午
元分析额外分析(AES-SDM)
  • 掌握敏感性分析

  • 掌握异质性分析

  • 掌握亚组分析


使用元分析软件进行额外分析的练习,并整理元分析结果

第2天

晚上
Endnote使用
  • 掌握Endnote在文献管理以及论文写作时的功能使用

操作Endnote软件,熟悉与元分析相关的功能

本期训练营涵盖的课程视频资


学习说明:导师会根据训练营规划与学员基础,为学员推荐相应课程,学员可自主选择回放、倍速、快进等功能,灵活把握学习进度。通过:导师跟进制度 + 体系化课程视频 + 体系化学习资料 +  数据分析模拟实战训练 +  助教现场指导的方式,确保完整掌握科研需要的所有技术细节。



ME01-1:脑影像元分析(META)-主讲老师 赵梦琦

ME01-2:脑影像元分析(META)-主讲老师 王倩倩

ME01-3:脑影像元分析(META)-主讲老师 王倩倩

ME01-4:脑影像元分析(META)-主讲老师 文建洁

ME01-5:脑影像元分析(META)-主讲老师 胡素


ME01-1:脑影像元分析(META)-主讲老师 赵梦琦

本课程专为初学者设计,旨在解析元分析的基本概念及其在神经影像学研究中的应用。我们将探讨元分析的各种方法,并强调文献检索的重要性,这是元分析流程中的关键环节。课程中,我们会特别聚焦于PubMed和Embase两大数据库,传授高效检索文献的策略,以确保研究的全面性和准确性。接下来,课程将围绕AES-SDM这一元分析软件展开,不仅阐述其背后的数学模型与理论依据,还将推荐相关的学术资源。学员将学会如何利用此软件进行主分析、亚组分析、敏感性分析、异质性评估、发表偏倚检测以及元回归分析,这些技能对于提升研究质量和可信度至关重要。在课程的后半段,我们将指导如何撰写脑影像元分析报告,涵盖文献筛选流程图制作、整理纳入分析的文献列表,以及如何有效地展示元分析的结果。最后,通过一系列的实操练习,我们将回顾并巩固整个元分析项目从规划到完成的全过程,帮助学员熟练掌握元分析的每一个步骤,从而能够独立开展高质量的脑影像学研究项目。
课程编号:ME01-1
主讲老师课程名称具体内容

课时数

(每课时45分钟)
赵梦琦01 脑影像元分析入门及流程介绍
  • 脑影像元分析基础概念简介

  • 脑影像元分析的问题提出

  • 脑影像元分析的研究设计

  • 脑影像元分析的数据分析设计

  • 元分析注册

1课时
02 脑影像元分析文献解读
  • 脑影像元分析文献整体结构解读

  • 文献各部分写作逻辑与技巧解读

2课时
03 元分析文献检索
  • 不同数据库文献检索技巧

  • 文献检索结果的整理

1课时
04 AES-SDM原理与软件介绍
  • AES-SDM脑影像元分析原理

  • AES-SDM软件下载与安装

0.5课时
05 AES-SDM元分析基础操作
  • 元分析数据准备

  • 元分析基础操作步骤

  • 元分析结果解读与整理

2课时
06 AES-SDM额外分析操作
  • 亚组分析

  • 敏感性分析

  • 异质性分析

  • 发表偏倚

  • 元回归

2课时
07 脑影像元分析结果图表
  • 搜索流程图

  • 纳入文献信息表

  • 元分析脑区结果表

  • 元分析脑区结果图

1课时
08 项目实战
  • 元分析项目实战

1课时


ME01-2:脑影像元分析(META)-主讲老师 王倩倩

本课程专为初学者设计,旨在引导学员进入脑影像元分析的领域。课程内容全面,不仅教授如何理解元分析相关的学术论文,还将细致讲解论文各部分的阅读技巧,包括摘要的精读、引言的理解、方法论的解析、结果的解读以及如何恰当汇报分析结果。此外,课程还特别强调了元分析注册时应当注意的关键事项,确保学员能够掌握整个元分析流程中的重要细节,从而提升研究的透明度和可重复性。通过本课程的学习,学员将获得系统性的知识和技能,以便在未来的研究中能够独立开展高质量的脑影像元分析工作。
课程编号:ME01-2
主讲老师课程名称具体内容

课时数

(每课时45分钟)
王倩倩元分析与AES-SDM
  • 元分析相关概念讲解

  • 文献检索操作演示

  • 文献纳入参考标准与注意事项

  • 纳入文献信息展示讲解

  • 文献纳排流程图奖金

  • 元分析结果解读

  • 异质性分析讲解

  • 敏感性分析讲解

  • AES-SDM工具包实操

4课时
ALE工具包讲解
  • ALE元分析工具包讲解

  • 输入数据制作规范与注意事项讲解

1课时
Endnote讲解
  • Endnote安装与功能介绍

  • 与PubMed数据库结合使用

  • 文献管理注意事项

  • 论文写作时Endnote使用技巧

2.5课时


ME01-3:脑影像元分析(META)-主讲老师 王倩倩

本课程的内容聚焦于元分析文献的详细解读,包括如何理解与解析文献的摘要、引言、方法论、结果部分,以及在汇报元分析结果时应遵循的最佳实践。此外,课程还将详细讲解在进行元分析项目注册时所需关注的重点事项,确保研究计划的严谨性和透明度。通过本课程的学习,参与者将全面提升对元分析文献的批判性阅读能力和元分析课题研究的规范水平。
课程编号:ME01-3
主讲老师课程名称具体内容

课时数

(每课时45分钟)
王倩倩静息态元分析案例文献讲解
  • 静息态元分析案例文献入门

  • 元分析文章写作思路讲解

  • 具体元分析课题开展注意事项讲解

  • 摘要、引言、元分析方法、结果等拆解讲解

2.5课时
文献检索
  • PubMed数据库使用介绍

  • 文献检索操作讲解

  • 如何确定文献检索关键词

  • 文献检索结果导出与整理

2课时
案例展示
  • 基于一篇具体的元分析练习案例进行探讨

3课时


ME01-4:脑影像元分析(META)-主讲老师 文建洁

本课程的内容,旨在深入教授脑影像元分析的多个关键环节:我们将详细介绍敏感性分析的概念、目的及其在元分析中的作用,并通过实际操作演示如何执行敏感性分析,以评估研究结果的稳定性和可靠性。本课程将重点探讨元分析额外分析:敏感性分析、异质性分析的方法以及元回归分析教学与实践。课程最后,我们将逐步解析使用ALE工具包进行元分析的流程


课程编号:ME01-4
主讲老师课程名称具体内容

课时数

(每课时45分钟)
文建洁基于AES-SDM的额外分析与ALE元分析
  • 敏感性分析讲解与实操

  • 异质性分析讲解与实操

  • 元回归分析讲解与实操

  • ALE元分析步骤解析

2课时


ME01-5:脑影像元分析(META)-主讲老师 胡素

本课程综合脑影像元分析的多个元素,涵盖静息态元分析流程与关键点,从设计阶段到数据分析,同时突出需要注意的细节,以保证研究的严谨性和有效性。学员将学会如何客观评估纳入元分析的文献质量,这是确保元分析结果可靠性的基础。课程将教授坐标文件的标准化制作方法,同时也会分享如何应对特殊情况下数据处理的策略。我们将会讲解开始元分析之前必须完成的准备工作,包括文献检索、数据收集和初步的质量控制,为后续的分析奠定坚实的基础。最后对AES-SDM软件操作复盘。对于已经熟悉AES-SDM软件的学员,本课程将提供一次全面的操作回顾,巩固大家对该软件功能和使用技巧的记忆,进一步提高元分析的效率和精确度。
课程编号:ME01-5
主讲老师课程名称具体内容

课时数

(每课时45分钟)
胡素基于AES-SDM的额外分析
  • 静息态元分析流程与注意事项

  • 文献质量打分表解析

  • 制作坐标文件的规范与特殊情况处理思路

  • 元分析的前期准备工作讲解

  • AES-SDM的操作回顾

3课时

3. 脑海科技相关介绍


脑海科技设立于萧山区紫橙国际创新中心3号楼10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。 

贾熙泽,博士,杭州脑海科技首席执行官,现任山东第二医科大学附属医院特聘专家、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、特聘研究员、兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员、大连市友谊医院特聘教授、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师、宁波市康复医院医学技术顾问、佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师、中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员及杭州市萧山区青年科技工作者协会会员。主持国自然青年基金项目、浙江省智能教育技术与应用重点实验室开放研究基金重点项目,入选杭州市青年科技人才培育工程项目,作为主要参与人参与 8 项国自然科学基金项目、 1 项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题。目前合作发表 SCI 论文 30 余篇,以主要作者在 Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇(第一作者或通讯作者),文章被 SCI 杂志引用近968次,h-index =16,担任 40余个SCI杂志的审稿人。

4. ME01A训练营报名费用及相关说明


根据我们的前期实战,学习中心模式相对于传统培训班模式效果更好。传统的培训班通常在6天内集中式现场短时间内讲授大量知识点,学员很容易跟不上。另一种方法是线上课程,该方式价格也要数千元,根据已有经验而言,由于学员基础不同、背景不同,效果很难达到预期,并且也存答疑不方便等问题。


经过脑海科技核心团队反复沟通及研究,决定在同等的价格下,提供更优质的服务。
目前,磁共振结构数据分析基础训练营涵盖以下内容:
1)学习时长: 2天(时间可续)
2)独享视频电脑:1台
3)独享高性能工作站:1台(配置intel i7以上),不需要自带电脑,高性能的硬件,让学习效率更高
5)专属导师:定期跟进学习进展,协助调整学习方案
6)小组答疑:助教现场答疑与指导,每个小组3-5人
7)考核与测验:考核与测验评估学习进展,提出改进建议与查漏补缺
另外,对于有更高需求的学员,还可以支持一对一答疑等方式,欢迎咨询。


报名费用:
原价:4000元(单人购买)
限时优惠价:8月31日前报名参加课程可享受优惠价3800元/人(单人购买),转发朋友圈集赞超过28个赞,可享受优惠价3580元/人(单人购买)


5. 报名流程及付款方式


(1)随到随学,预约制报名。考虑到实验室承载能力有限,采用预约制,目前实验室对外开放10个学习名额。
(2)报名流程。报名可先扫描以下二维码添加樊衍孜微信(扫描以下二维码或添加微信号:19906719439),我们将与您电话沟通学习需求及目标,并出具学习计划及对应报价单。完成付款后,即可开始预约学习,随到随学。 
(3)关于发票。可开具能够报销的正式发票(如:技术服务费及培训费等)。支持预存,可以现场刷公务卡或银行卡转账,学习期间谢绝录像及录音。
电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)
微信咨询:199 0671 9439
邮箱咨询:fanyanzi@brainimaging.cn
实验室地址:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼6楼602室


6. 更多学习方案敬请期待


以下训练营也将在近期陆续开营,每个训练营包含多名数据分析经验丰富的主讲老师的课程,他们将倾囊相授,帮助学员们掌握数据分析的核心技巧。训练营信息如下,敬请关注“脑影像工坊”公众号:

训练营-01:每课时低至38元 | 全年随到随学 | 静息态数据分析基础训练营 | RS02A点击此处跳转至RS02A训练营,主要内容包含:10套静息态数据分析课程,涵盖静息态功能磁共振基础入门,静息态指标计算(ALFF、fALFF、PerAF、Wavelet-ALFF、KCC-ReHo、Cohe-ReHo、DC、FC、GCA),盲反卷积、统计分析、多重比较校正、静息态文献解读、结果汇报图表制作及注意事项

训练营-02:全年随到随学|弥散张量成像(DTI)数据分析基础训练营|DT01A点击此处跳转至DT01A训练营,主要内容包含:DTI指标计算(FA、AD、RD、MD)与基于白质骨架的统计分析(TBSS)


训练营-03:全年随到随学|基于体素的形态学分析-VBM训练营|AN01A(点击此处跳转至AN01A训练营),主要内容包含:包含横向数据的灰质体积计算、纵向数据的灰质体积计算、ROI区域体积值的提取等。包括理论+数据分析+案例实战。


训练营-04:全年随到随学|大脑复杂网络数据分析基础训练营|GT01A (点击此处跳转至GT01A训练营),主要内容包含:包含功能像数据的全局指标(小世界属性、网络效率、最短路径长度等)、节点指标(度中心、介数等)计算;基于个体形态学网络创建、全局指标(小世界属性、网络效率、最短路径长度等)、节点指标(度中心、介数等)计算等。包括理论+数据分析+案例实战。


训练营-05:全年随到随学|独立成分分析与网络间连接基础训练营(ICA+FNC)|IC01A (点击此处跳转至IC01A训练营),主要内容包含:包含GIFT工具包实操、ICASSO分析、降维、FNC讲解等。包括理论+数据分析+案例实战。


训练营-06:全年随到随学|弥散张量成像(DKI)数据分析基础训练营|DK01A (点击此处跳转至DK01A训练营),主要内容包含:包含DKI指标计算、纤维追踪等。包括理论+数据分析+案例实战。


训练营-07:全年随到随学|白质功能信号数据分析基础训练营|WM01A(点击此处跳转至WM01A训练营),主要内容包含:包含白质信号特殊预处理讲解、白质体素水平的局部指标计算、白质脑网络的构建、聚类方法讲解等。包括理论+数据分析+案例实战。


训练营-08:全年随到随学|基于大脑皮层的数据分析基础训练营|SF01A(点击此处跳转至SF01A训练营),主要内容包含:FreeSurfer基础操作,皮层指标(皮层厚度、曲率、沟深、皮层复杂度)等计算,FreeSurfer组水平分析等。包括理论+数据分析+案例实战。


训练营-09:全年随到随学|基于机器学习技术的脑影像数据分析基础训练营|ML01A(点击此处跳转至ML01A训练营),主要内容包含:包含支持向量机原理、特征空间、核函数讲解、交叉验证方法等讲解与实操。包括理论+数据分析+案例实战。


训练营-10:全年随到随学|基于AFNI的数据分析基础训练营|AF01A ,主要内容包含:AFNI基础概念、AFNI图形界面讲解、使用AFNI进行预处理、指标计算、统计分析讲解等,AFNI内置命令讲解与实操。


此外,还会陆续推出涵盖更多技术的训练营包含但不限于:
1)任务态数据分析:任务态激活分析、心理生理交互效应(PPI)、动态因果模型(DCM)、多体素模式分析(MVPA)......
2)定量磁化率成像(QSM):包含QSM图像的创建与标准化、QSM信号值的提取等
3)沿血管周围间隙弥散张量成像分析 (DTI-ALPS)
4)基于组水平结构网络分析:包含组水平结构网络的创建、全局指标、节点指标计算,网络攻击性分析、HUB节点识别等
5)深度学习在脑影像数据中的应用(如生成对抗网络、强化学习、迁移学习等)
......
如有其他想要学习的内容,欢迎添加樊衍孜的微信反馈(微信号:19906719439),我们将研发新的学习方案。





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