第五届 | 12.08-12.12 | 复杂网络分析实训 | 杭州

文摘   科学   2024-11-02 17:07   浙江  

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主办单位

杭州脑海科技有限公司

脑海科技认知神经科学实验室

承办单位

杭州脑呈科技有限公司


















1. 课程简介

复杂网络已被应用于探究脑网络的基本属性以及脑区间潜在的拓扑关系,从而为窥探人脑内部的神经活动规律以及各种神经精神疾病的发病机理等重大神经科学问题提供全新的视角,为回馈广大医生及脑科学研究者,并助力大家迅速掌握静息态复杂网络分析技术(Graph Theory)的相关知识,本次课程特别设计,旨在帮助每位学员快速具备独立进行数据分析的能力。采用课程+答疑的教学方式,确保每位学员都能够轻松上手。

课程亮点包括

多模态交叉:复杂网络分析技术的应用广泛,可结合多种模态研究患者与对照组之间的大脑差异,例如功能像复杂网络分析个体结构复杂网络分析弥散像复杂网络分析

已发表案例详解:精选多角度的已发表研究案例,深入剖析实际应用中的分析方法和技术要点,帮助学员了解前沿进展,并启发创新思维。

绘图技巧精讲:教授专业绘图技巧,提升数据可视化水平,让您的研究成果更加生动、直观,易于传播。

通过本次课程的学习,您将不仅能够掌握扎实的理论知识,还能在实战演练中提升技能,为您的科研之路增添强大的动力。无论您是初学者还是有一定经验的研究人员,我们都将为您提供最贴心、最有效的指导和支持,让您在静息态功能磁共振研究领域迅速成长!选择我们,开启一段精彩纷呈的学习旅程吧!

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2.学习内容

功能复杂网络分析

(1)fMRI基础回顾

静息态fMRI基础知识回顾

脑影像图像查看与参数

数据扫描的注意事项

数据预处理讲解

(2)大脑功能网络

静息态功能脑网络整体介绍

功能脑网络构建讲解与实操

稀疏度网络创建讲解与实操

(3)图论分析

GRETNA工具包介绍

图与节点定义讲解

稀疏度定义讲解

小世界属性讲解与实操

全局效率讲解与实操

富人俱乐部讲解与实操

聚类系数讲解与实操

最短路径长度讲解与实操

节点效率讲解与实操

局部效率讲解与实操

度中心性讲解与实操

介数中心性讲解与实操

(4)基于图论指标的统计分析

基于图论指标的双样本T检验讲解与实操

使用代码对统计结果整理

BrainNet作图讲解

(5)功能复杂网络案例实战

复杂网络原理讲解

文献方法解读

查看扫描参数与数据预处理原理

数据预处理操作

子网络构建与图论指标计算

NBS工具箱的使用

基于图论指标的统计分析与偏相关分析

结果可视化-功能连接图

结果可视化-节点图

结果可视化-条形图

结果可视化-散点图

(6)基于BRANT的复杂网络分析

BRANT工具包介绍

基于BRANT的预处理

基于BRANT的功能连接矩阵构建

基于BRANT的图论指标计算

基于BRANT的统计分析

BRANT生成结果讲解


结构复杂网络分析

(1)个体结构复杂网络分析

结构像形态学分析

基于KLS算法的个体结构网络创建

全局指标计算(小世界属性、全局效率、局部效率)

节点指标计算(节点效率、度中心性、介数中心性)

基于图论指标的单因素方差分析

基于图论指标与临床量表的相关性分析

图论指标结果可视化-折线图的制作

图论指标结果可视化-箱型图的制作

图论指标结果可视化-节点分布图的制作

相关分析结果可视化-散点图的制作


多模态复杂网络分析

(1)多模态复杂网络分析

功能像数据预处理

PANDA工具包功能介绍

弥散像数据预处理(涡流与头动校正)

弥散张量指标解算

全脑纤维追踪计算

功能网络矩阵构建

结构网络矩阵构建

功能图论指标计算

结构图论指标计算

功能-结构网络耦合分析

图论结果可视化-矩阵图与球棍图的制作

图论结果可视化-阴影(shade)图的制作

图论结果可视化-条形图的制作


3.图论指标分析的SCI应用案例


静息态功能磁共振研究之所以能够产出大量的研究成果,其中一个关键原因在于,通过对多批次数据集应用不同的研究思路与方法,可以衍生出多样化的研究课题。由此可见,分析思路对于课题的成功至关重要。本课程将涵盖多个已发表成果的实际案例讲解,帮助您掌握多样化的分析方法。

(1)功能复杂网络分析已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词 默认模式网络(DMN)、额顶叶网络(FPN)、扣带盖网络(CON)、功能图论分析、基于网络的统计分析(NBS)

课程主要内容 

默认模式网络(DMN)、额顶叶网络(FPN)和扣带盖网络(CON)是重要的静息状态功能网络,广泛涉及正念干预。具体来说,DMN与多种复杂的自我参照过程有关,FPN和CON负责自上而下的认知控制。在图论的背景下,复杂的大脑网络可以通过节点和边的定义抽象为一个简化的图,从而可以在图结构中进行进一步的拓扑分析。


(2)个体结构复杂网络分析已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词  结构像、个体结构复杂网络、KL散度

课程主要内容: 

结构像数据具有易于获取、高信噪比和对伪影(例如头部运动)相对不敏感的明显优势。因此,基于结构像的网络方法有望成为表征健康和病理条件下网络级大脑组织的另一种思路,个体结构网络基于KL散度,并有研究证明这种方法在有够有效揭示长期睡眠剥夺后丘脑形态连接的纵向变化。


(3)多模态复杂网络分析已发表SCI案例讲解+手把手解决操作问题+课程答疑

课程关键词 功能像数据、弥散像分析、纤维追踪、图论分析、功能-结构耦合分析

课程主要内容

越来越多的证据表明,人类大脑可以被描述为一个大规模的综合功能和结构网络。基于图的网络方法不仅为全脑网络的架构,而且为各种认知缺陷的潜在机制提供了有价值的见解。在众多的神经成像方式中,静息状态功能磁共振成像和弥散张量成像(DTI)是两种很有前途的工具来绘制人类大脑的内在功能和结构网络。结合这两种技术可以为神经网络对各种神经心理学障碍的反应的内在调控提供新的见解。


4.脑影像绘图(多工具)


基础绘图

在SCI论文中,图表的美化不仅是视觉上的提升,更是对研究结果的有效传达和专业展现。美观的图表可以帮助读者更快速地理解数据和研究结果,美观的图表能够吸引读者的注意力,增加论文的可读性和吸引力,高质量的图表反映了作者对研究工作的认真态度,提升了论文的整体专业形象。

课程关键词:MRICRON、RESTplus、BrainNet、GRETNA、GraphPad等


进阶绘图

R 语言作为一种强大的统计计算和图形生成工具,在数据可视化方面有着诸多优势。R 语言提供的绘图库(如 ggplot2, lattice, ggvis, plotly 等)允许用户高度定制图表的各个方面,包括颜色、字体、轴标签、图例等。


注:基础绘图与进阶绘图课程(原价1500/人),现限时免费赠送:成功报名复杂网络分析实训后,免费赠送基础绘图与进阶绘图课程

以上课程均支持培训期间反复观看

5. 脑海科技相关介绍


脑海科技核心团队组建于2018年,公司位于萧山区紫橙国际创新中心3号楼6层及10层,是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司,已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”,入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目,并通过ISO9001质量管理体系认证,并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。

2021年脑海科技成立了下属的研究实验室(脑海科技认知神经科学实验室)专注于神经影像相关的学术工作,脑海实验室目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前,实验室成员累积发表SCI文章85篇,其中JCR一区SCI文章28篇,JCR二区SCI文章41篇。实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验,目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验,联合培养了很多优秀的研究生,如:高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等(鉴于篇幅所限,仅列举部分同学)。学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验,担任50余个SCI杂志审稿人,包括:Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等。

贾熙泽,博士,杭州脑海科技有限公司创始人、浙江师范大学心理学院特聘教授、主要研究方向为静息态功能磁共振方法学及焦虑障碍的神经机制。自2013年起,师从臧玉峰教授从事静息态功能磁共振方法学研究,RESTplus软件包的开发人,负责REST-meta-PD 国际多中心项目。现兼任山东第二医科大学附属医院特聘专家、大连市友谊医院特聘教授、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师及佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师等。现为中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员,主持国自然青年基金项目1项、入选杭州市青年科技人才培育工程项目,目前以主要作者在Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇(第一作者或通讯作者),文章被 SCI 杂志引用1057次,h-index =16,担任 40余个SCI杂志的审稿人。


6.报名及费用说明


(1)学习内容复杂网络分析实训

(2)学习模式:学习规划 + 导师制+ 小组答疑(5人以内)+  体系化视频课程 + 定期进度跟进 + 学习效果评估 + 完整案例数据

(3)硬件资源每名学员配备2台电脑,1台用于观看学习视频,1台用于分析数据(Intel i7或以上配置)

(4)学习周期5天

(5)答疑方式:每天下午固定16点进行小组答疑,数据分析遇到报错,助教随时响应并协助解决问题

(6)学习费用

2024年12月08日-12月12日期间到场学习,可享受优惠价3100元/人(原价4500元/人),转发朋友圈,集赞超过28个,立减200元(即2900元/人

注 交通及食宿费用自理

7. 报名流程及付款方式

报名可扫描以下二维码添加樊衍孜微信联系报名(扫描以下二维码或添加微信号:19906719439)

可开具能够报销的正式发票(如:技术服务费及培训费等)。支持预存,可以现场刷公务卡或银行卡转账,学习期间谢绝录像及录音。

电话咨询:0571-2883 4398(请按3号键)

微信咨询:199 0671 9439

邮箱咨询:fanyanzi@brainimaging.cn

实验室地址:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼6楼602室


8.FAQ

Q:课程具体是什么形式?
A:脑海科技团队录制了完整的讲课视频,并且整理了相应的数据分析工具、代码以及技术文档,报名的学员会有一份学习规划,可根据学习规划观看对应教学视频。操作问题助教随时响应,理论以及科研问题每天下午16:00进行小组答疑(5人以内)


Q:与传统培训班相比,学习效果怎么样?

A:远比传统培训班学习效果好, 1)学习时间集中且充足,每天包括9小时的学习时间(9:00 ~ 18:00),方便请假和安排时间。2)答疑及时,操作问题可以随时响应,解决问题效率高。 3)视频课程经过反复设计和打磨,可以根据自己的进度灵活调整,由浅入深,不怕跟不上。4)有导师定期跟进进度,确保能够跟上。目前来访的学员都可以掌握相应的技术,并且满意度都很高。


Q:价格及优惠活动

A:我们会推出在固定时间段内的优惠价格,具体以当期通知为准,在此基础上,可参加朋友圈集赞等优惠活动。

9.更多学习方案欢迎详询


以下学习方案现已开启,火热报名中!敬请关注“脑海科技学习中心”公众号:

实训  | 第四届 | 11.23-11.27 | 动态分析实训 | 杭州(点击跳转至链接)
实训 | 第三届 | 11.23-11.27 | 白质信号分析实训 | 杭州(点击跳转至链接)
实训 第二届 | 11.15-11.19 | 结构像数据分析实训 | 杭州(点击跳转至链接)
实训 | 第一届 | 11.15-11.19 | 静息态数据分析基础实训 | 杭州(点击跳转至链接)
一对一 大脑白质功能信号数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 静息态数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 磁共振结构数据分析(VBM)基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 弥散张量成像(DTI)数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 基于结构协变网络的格兰杰因果分析(CaSCN) | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 独立成分分析与网络间连接(ICA+FNC)基础训练 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 基于大脑皮层分析基础训练 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 共波动分析(Cofluctuation analysis) | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 脑影像元分析(META)基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 基于机器学习的脑影像数据分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 基于结构协变网络的网络攻击分析、模块化与拓扑属性(GAT)| 随到随学(点击跳转至链接)
一对一 | 基于滑动时间窗的动态分析基础培训 | 随到随学(点击跳转至链接)
如有其他想要学习的内容,欢迎添加樊衍孜的微信反馈(微信号:19906719439),我们将研发新的学习方案。





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