在微生物研究中,如何更好的展示物种组成一直是广受各位研究者所关注的问题,凌波微课云平台(http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/home)中已有热图、物种堆叠柱状图、气泡图、circos物种关系图和ggplot2进阶版物种组成图等小工具。
Part 1 物种组成可视化分析
工具使用教程:凌波微课|做连连看的堆叠柱状图你见过吗?(https://mp.weixin.qq.com/s/VzCvkczHZsitawDaxUB9TQ)
云平台的在线绘图,依然只需要物种丰度表和分组文件,就能一键出图,搞定绘图和调色,科研绘图一把子拿捏了!
工具使用教程:凌波微课|告别代码,一键绘制带聚类树的堆叠柱状图!
工具使用教程:手把手教你用云平台第二讲之一起来做热图吧!(https://mp.weixin.qq.com/s/EZNYIUCi-brLLUzYuDd_oQ)
在物种组成分析中,气泡图一般用气泡大小表示物种相对丰度大小,展示丰度等信息,用于对比样本与组间的物种组成。
工具使用教程:凌波微课|气泡图,画起来竟然这么easy(https://mp.weixin.qq.com/s/fWMnM7cGZQFxfJ9CGh4JSA)
工具使用教程:凌波微课|微课云系列教程之Circos物种关系图科研绘图小工具(https://mp.weixin.qq.com/s/vlmD1v1pHd84bg9WlwOJ5w)
在进阶版的物种组成图中,除了展示各组样本在特定分类学的组成差异外,还可以展示样本的reads数据,想知道这么酷炫的图是怎么画出来的吗?具体操作方法戳下方链接哦~
工具使用教程:凌波微课|微课云系列教程之ggplot2可视化:进阶版物种组成图,高分文章用起来!(https://mp.weixin.qq.com/s/6QmZHPr6a-R94un3KnK1ZA)
Part 2 文献应用
凌波微课的讲师们,实战经验丰富,旨在通过在线微课程及线下交流,帮助科研学生及科研工作者们由简入繁,掌握科研思路及生信分析的实际操作。倾心打造的高通量测序数据分析平台——凌波微课·云平台(http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/home),无需命令行,零基础玩转数据分析。凌波微课,用心服务科研用户,打造专业教育品牌,助力科研提升。
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