珂珂老师最近收到的资讯私信五花八门啊，其中很大一部分就是，我想做xx分析，我应该用哪个文件啊？
相信这个问题也是刚接触报告和云平台的老师同学们最困惑的。
锵锵！看这里！
各项目常用数据及位置！
有了数据文件怎么用呢？
先来做个分组文件吧！统共分4步。
● 第一步，打开excel
● 第二步，输入两个表头，第一列sample第二列group
● 第三步，输入样本名和对应分组名（样本名可以复制后转置粘贴）
● 第四步，另存为制表符分隔的txt文件
从项目上来说——
注释信息表 + 分组文件+ Circos物种关系图 = 物种组成圈图
注释信息表 + 分组文件+ LEFSE2.0工具 = 差异基因分析，筛选LDA值寻找biomaker
各分类学物种丰度表 + 饼图 = 各分类学物种饼图
各分类学物种丰度表 + 堆积冲击图工具 = 各分类学物种堆积冲击图
表达量统计表 + 分组文件 + edgeR差异分析 =差异基因分析，可选择不同FC及FDR阈值
差异基因GO富集信息 + 饼图 = 差异基因GO多级分类注释分布饼图
差异基因信息 + 背景基因文件 = GO\KEGG富集分析
富集结果文件 + 富集气泡图 = 富集气泡图
从小工具上来说——
OTU丰度表 + 热图 = 微生物丰度聚类热图
表达量统计表 + 热图 = 表达量丰度聚类热图
样本两两间距离矩阵+ 热图 = 相关性距离热图
差异代谢物信息 + 热图 = 差异代谢物丰度热图
TOP2-聚类分析 PCA & PCOA & NMDS
OTU丰度表 + 分组文件 + PCA & PCOA & NMDS = beta多样性分析
表达量统计表 + 分组文件 + PCA & PCOA & NMDS = 样品关系分析
基因表达量表 + 理化指标表型现象 = 基因表达关联分析
代谢物丰度表 + 理化指标表型现象 = 代谢关联分析
OTU丰度表 + 理化指标环境因子 = 微生物环境关联分析
当然还有很多基础绘图，比如盒形图、线性回归图、相关性组合图、带箭头的PCA图等等……
总结下来，any数据 + any工具 = 你想要的结果！（注意要按照工具的示例格式来哦）
除上述的这些工具以外，还有好多好多小工具分析等你发掘~
今天的分享就到这里喽~
欢迎大家来探索数据的奥妙吧~
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