问题的提出:现在高考试题总是有部分属于科研情境,同样的,2024年江苏高考试题也出现了相关的试题,第15题是染色质重塑有关的“基因沉默蛋白”,下面主要介绍“基因沉默蛋白(PcG)”有关的染色质重塑。
高中生物学新教材增加了表观遗传学内容,包括DNA甲基化和组蛋白乙酰化修饰,不论是DNA甲基化还是组蛋白乙酰化修饰,最终都是调节染色质的结构来调控基因的表达,因为染色质的基本组成就是DNA和由组蛋白构成的核小体,二者发生变化则直接影响着染色质的结构和功能,这种染色质结构的变化我们称为染色质重塑。除此之外,还有其他相关的酶参与染色质重塑,从而调控基因表达活性。
首先需要了解染色质结构,细胞基因组中的DNA通常并非处于裸露状态,而是与组蛋白一起构成结构致密的染色质,故染色质结构状态的改变会影响基因的表达。
1.染色质重塑与表观遗传学的关系
染色质重塑在表观遗传调控中扮演着至关重要的角色。它能根据细胞内外环境的变化,灵活调整特定基因位点的活跃度,使得细胞在不改变DNA序列的前体下实现不同的功能性表达。例如,在细胞分化过程中,染色质重塑会引导干细胞沿着不同的方向发展为各种特定的成熟细胞;在癌症发生发展中,染色质重塑异常可能会导致抑癌基因沉默或原癌基因激活,从而推动肿瘤的生长和扩散。
(1)染色质重塑与DNA甲基化
DNA甲基化主要发生在CpG岛区域,与基因表达抑制紧密相关。DNA甲基化状态可以影响染色质重塑复合物的结合和功能,反过来,染色质重塑也可以改变DNA甲基化的位置和持久性。
(2)染色质重塑与组蛋白修饰
乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等组蛋白修饰能够改变核小体与DNA的亲和力,进而影响染色质的松紧度以及基因的表达。组蛋白修饰与染色质重塑互为因果,如组蛋白乙酰化通常与开放的染色质结构和基因激活有关,而某些组蛋白甲基化则与沉默的基因状态有关。
2.染色质重塑调控机制
染色体重塑过程由两种蛋白复合体所介导,即ATP依赖型核小体重构复合体和组蛋白修饰复合体。前者通过水解作用改变核小体构型,后者对核心组蛋白N端尾部的共价修饰进行催化,进而沉默或激活基因的表达。
(1)ATP依赖性复合物染色质重塑
真核生物常见的ATP依赖性复合物通过与核小体结合并使其与DNA断开,从而产生短暂的DNA环围绕核小体移动,使核小体得以重新定位,促进转录激活或抑制,结果取决于靶基因是位于开放染色质还是紧凑染色质区。例如,ISWI复合物通过改变核小体间的距离和稳定性影响转录水平。
具体的过程是,ATP依赖的染色质重塑复合物的基本特征是利用ATP水解获得的能量,改变组蛋白与DNA之间的相对位置,使染色质变成开放式的疏松结构,从而便于转录因子等更易接近DNA,使基因得以表达。
(2)PcG蛋白与染色质重塑(试题中出现的这种情况)
PcG蛋白广泛参与细胞分化过程中的基因沉默,它们通过形成多蛋白复合物(PRC)在染色质重塑和表观遗传调控中发挥重要作用。PRC可以催化特定组蛋白修饰来维持基因的沉默状态,例如,催化组蛋白H3K27的三甲基化,H3K37me3是一种强烈的转录抑制标记。
综上所述,染色质重塑是DNA修复和基因表达调控过程中的一个重要环节。染色质重塑使染色质组织结构发生一系列重要的变化,如染色质去凝聚、核小体变成开放式的疏松结构、使转录因子等更易接近并结合核小体DNA,从而调控基因转录等。