PJ | 告别组织培养!全新优化的病毒载体介导高粱体内高效基因编辑,突变效率高达60%!

学术   2024-12-16 10:25   湖北  

高粱作为一种重要的粮食和能源作物,在全球粮食安全和可再生能源领域具有重要地位。然而,高粱的遗传改良面临着转化效率低、组织培养困难等瓶颈,严重阻碍了其优良性状的开发和利用。迫切需要开发一种无需组织培养的体内基因编辑方法,以加速高粱的遗传改良进程。

植物RNA病毒因其复制效率高、表达水平高、系统性移动能力强等特点,成为基因递送的理想载体。然而,目前缺乏高效的单子叶植物病毒载体,限制了病毒诱导的基因编辑技术在单子叶作物中的应用,尤其是在高粱中。

2024年12月11日,The Plant Journal(IF:7.09)在线发表了明尼苏达大学Daniel F. Voytas团队的最新研究进展:‘Rapid and efficient in planta genome editing in sorghum using foxtail mosaic virus-mediated sgRNA delivery’,为了克服高粱面临的基因编辑问题,该研究尝试利用植物RNA病毒作为递送工具,直接在植物体内(in planta)传递CRISPR/Cas9系统中的单链向导RNA(sgRNA),以实现基因组的精准编辑。

该团队优化的狐尾花花叶病毒(FoMV)载体能够直接感染高粱并在全株范围内传播,绕过了组织培养的过程,成功递送sgRNA至体细胞并诱导高频率的基因突变(突变率最高达60%),且产生了明显的表型变化。

作者团队测试了两种病毒载体:三分体大麦条纹花叶病毒 (Barley stripe mosaic virus, BSMV);单分体狐尾草花叶病毒 (Foxtail mosaic virus, FoMV)。
三分体病毒:BSMV 是一种三分体 RNA 病毒,这意味着它的基因组由三个独立的 RNA 分子组成,分别称为 RNA α , RNA β , 和 RNA γ 。
单分体病毒:FoMV 是一种单分体 RNA 病毒,这意味着它的基因组由一个单独的 RNA 分子组成。
Cargo则是外源基因的插入位置。(图1)

图1

BSMV 载体在烟草中表现出良好的感染和外源基因表达能力,成功表达了 AmCyan 荧光蛋白。然而,当尝试将其应用于高粱时,BSMV 载体完全失去了感染能力,无法在高粱植株中复制和移动,更无法表达 AmCyan 蛋白或递送 sgRNA。因此,BSMV 载体在本研究中被证实不适用于高粱的体内基因编辑,无法实现预期的基因编辑目标。

FoMV 载体不仅在烟草中表现出良好的感染和外源基因表达能力,而且成功感染了高粱植株,并在高粱体内系统性移动,表达了 AmCyan 荧光蛋白。(图2)

图2

为了评估 FoMV 病毒载体介导的高粱体内基因编辑效果,作者选择了 MgCh、Lw1 PDS 三个目标基因,设计了特异性 sgRNA,并将其插入到 FoMV 载体中。利用表达 Cas9 和 GFP 的转基因高粱植株,通过摩擦接种或直接注射的方式,将携带 sgRNA 的 FoMV 病毒液或农杆菌导入高粱植株。

结果显示,FoMV 载体能够有效递送 sgRNA,并在高粱体内诱导基因编辑,其中 MgChLw1 基因的平均编辑效率分别达到 40% 和 30%,个别植株甚至高达 53% 和 38%。然而,PDS 基因的编辑导致多数植株死亡,推测是由于基因沉默或双拷贝突变导致。(图3)

直接注射法也成功诱导了基因编辑,且效率与摩擦接种法相当,最高可达 60%,并简化了实验流程。

这些数据表明,FoMV 载体具有高效的高粱体内基因编辑能力。

图3

该研究的病毒载体可以直接感染植株,一种是摩擦接种,将携带 sgRNA 的 FoMV 病毒液直接摩擦到高粱叶片上,病毒通过伤口进入植物细胞,并在体内复制和移动;第二种是直接注射,将携带 sgRNA 的农杆菌直接注射到高粱幼苗的茎部,农杆菌将携带病毒基因组的 T-DNA 转移到植物细胞中,病毒在细胞内复制。整个基因编辑过程都在完整的植株体内进行,无需经过体外培养。
但是也有局限性,未能实现可遗传的基因编辑,此外,该方案是结合转基因植物进行的实验,即病毒载体仅递送sgRNA,Cas9元件是通过转基因手段插入植物基因组中的。
总的来说,本文的创新点大于不足之处,为高粱的基因编辑研究提供了重要的进展,但仍需进一步完善。
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