JIPB | 韩国全北国立大学Beum‐Chang Kang团队在生菜中通过体外转录的碱基编辑器实现无DNA的碱基编辑

学术   2024-12-22 07:26   湖北  

传统的CRISPR/Cas9和碱基编辑方法虽然强大。但存在转基因风险;DNA-free的基因编辑新策略为解决这一问题提供了思路。
2024年12月18日,Journal of Integrative Plant Biology在线发表了韩国全北国立大学Beum‐Chang Kang团队的最新研究进展:‘DNA‐free base editing in lettuce via in vitro transcribed base editors’,该研究是关于在生菜中通过体外转录的碱基编辑器实现无DNA的碱基编辑。
简而言之,该团队开发了一种基于RNA的碱基编辑系统,该系统使用T7启动子驱动的质粒,包含工程化的腺嘌呤碱基编辑器(ABE)和胞嘧啶碱基编辑器(CBE),并通过聚乙烯醇(PEG)介导的转染方法将这些编辑器RNA(mRNA)和单导向RNA(sgRNA)传递到生菜的原生质体中,以实现无外源DNA的基因编辑。

构建腺嘌呤碱基编辑器(ABE)和胞嘧啶碱基编辑器(CBE)的mRNA表达载体,通过聚乙二醇 (PEG) 介导的转染将碱基编辑器 RNA (带有 sgRNA 的 ABE 或 CBE 信使 RNA (mRNA)) 递送到生菜的原生质体中,然后通过靶向深度测序分析原生质体、愈伤组织、芽和植物的编辑效率。(图1 A)

通过ABE-sgRNA在生菜开花基因LsFT中诱导A-to-G的转换,以延迟开花时间,延长营养生长期。在原生质体中,ABE-sgRNA诱导的A-to-G转换效率高达6.24%。此外,可在生菜愈伤组织和芽中诱导高达37.6%和50%的A-to-G转换,改变LsFT基因中Y85H氨基酸从而引起晚花表型。

CBE-sgRNA在原生质体中诱导C-to-T的转换(LsALS),效率高达12.6%。在生菜愈伤组织和芽中诱导高达20.8%和14.2%的C-to-T转换,改变LsALS基因中P184F氨基酸从而产生除草剂抗性,除草剂处理可进一步提高编辑效率至96.4%(愈伤中)、51.2%(芽中)。

通过mRNA介导的碱基编辑方法对生菜FTALS基因进行编辑后,再生植株的基因组DNA测序和表型分析表明,ABE和CBE引入的A-to-G和C-to-T转换能像内源基因一样在减数分裂过程中稳定遗传。(图1 B-J)

图1

该研究开发了一种基于mRNA的DNA-free植物碱基编辑新技术,实现了生菜等植物的高效、精准、无转基因组编辑,获得的定点突变类型能稳定遗传,在作物功能基因研究和农艺性状改良方面具有广泛应用前景,为作物精准设计育种提供了新思路和新方法,助力未来农业生产的可持续发展。

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