基于ANFI的数据分析基础训练营 | 全年随到随学 | AF01A
文摘
科学
2024-07-20 12:01
浙江
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主办单位
杭州脑海科技有限公司
脑海科技认知神经科学实验室
承办单位
杭州脑呈科技有限公司
杭州脑海科技有限公司下属的认知神经科学实验室（脑海科技认知神经科学实验室）专注于神经影像相关的学术工作，实验室核心团队组建于2018年，为方便实验室同学体系化的掌握脑影像数据分析技术，实验室于2021年成立了脑影像数据分析学习中心。脑海实验室基于学习中心的模式，目前已累积联合培养硕士研究生41名、博士研究生12名。截止目前，实验室成员累积发表SCI文章85篇，其中JCR一区SCI文章28篇，JCR二区SCI文章41篇。
鉴于之前的传统培训班的效果难以达到我们的预期，经过团队慎重的考虑，我们将学习中心内容改进升级后，决定将其对外开放申请，相对于传统的培训模式，有以下优势：1) 随到随学：学习中心全年开放，可根据自己的时间预约学习2) 以小组为单位教学：传统培训班模式每期20~30人，老师很难兼顾不同基础的同学，小组答疑通常一个小组为5人左右，以小组为单位教学及答疑，更高的学习效率3) 完善的硬件体系：每名学员均配置2台高性能工作站（Intel i7或以上配置），一台用于观看教学视频，另一台用于练习数据分析操作4) 完善的课程资料体系：包括体系化的数据分析技术视频、理论课程、学习文档以及完整的案例数据，反复看、重复看、体系化系统的学习5) 支持一对一教学：如有需要，可提供一对一教学及答疑，定制培养方案和学习体系6) 实验室研究团队有着丰富的脑影像研究经验，联合培养了很多优秀的研究生，如：高*艳以主要作者发表SCI文章5篇、郝*奇以主要作者发表SCI文章6篇、李*婷以主要作者发表SCI文章6篇、孙*伟以主要作者发表SCI文章4篇、王*以主要作者发表SCI文章3篇、展*琳以主要作者发表SCI文章3篇等等（鉴于篇幅所限，仅列举部分同学）。7) 学习中心导师及助教团队有着极其丰富的答疑经验：前期我们已经积累大量学术指导经验，目前已有近百余名研究生或医生的联合培养或短期访学的合作经验，截止目前，实验室成员累积发表SCI文章85篇，其中JCR一区SCI文章28篇，JCR二区SCI文章41篇。8) 学习中心核心团队具有丰富的SCI文章审稿经验，担任50余个SCI杂志审稿人，包括：Alzheimer's Research & Therapy、Molecular Autism、IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics、NeuroImage、BMC Psychiatry、Human Brain Mapping、Translational Stroke Research、CNS Neuroscience & Therapeutics、Journal of Affective Disorders、Autism Research等等。9) 脑海科技团队具有高度交叉背景，背景涵盖：计算机、数学、生物医学工程、心理学、英语、认知神经科学以及临床医学。每名成员均受过体系化科研培训，具有扎实的科研背景并专攻1-2个研究方向。脑影像数据分析学习中心即将推出一系列学习方案，每套学习方案具有唯一编号，大家既可以选择已有学习方案报名，也可以自行提出需求，我们将根据您的实际需求推出新的学习方案体系。我们真诚的希望尽可能灵活的满足大家的需求。训练营名称：AF01A|基于AFNI的数据分析基础训练营课程体系：包含2套课程，可反复观看，确保学员学会、学全，实打实地掌握技术。硬件配置：每名学员独享1台用于观看学习视频的电脑，独享1台用于分析数据的工作站（Intel i7或以上配置）助教答疑：3-5人为一组，即1名助教负责3-5人的答疑学习目标： AFNI包含了数百个命令，几乎涵盖了神经影像学研究的各个方面，例如数据格式转换、空间配准、时间序列分析、统计建模、图像可视化等。适用于从数据预处理到高级统计分析的整个流程。通过组合这些命令，可以构建复杂的数据处理和分析pipeline。深入理解AFNI工具箱在静息态功能磁共振领域的多个维度与应用，让学员在实践中锻炼技能，将理论知识转化为实际操作能力，为将来独立开展科研项目奠定坚实基础。![]()
（每名学员有专属导师定期跟进学习进展，协助调整学习计划）
| 时间范围 | 主题 | 学习目标 | 课后作业与学习效果评估 |
第1天 上午 | AFNI软件初识 | LINUX系统基础命令学习 掌握AFNI的基础概念及术语 数据转换学习 AFNI图形界面初步使用
| 使用案例数据进行AFNI图形界面操作练习 |
第1天 下午 | 数据预处理 | 熟悉AFNI图形界面 使用AFNI进行数据预处理分析 学习AFNI预处理使用的命令 学习预处理结果查看
| 使用案例数据进行AFNI预处理，并查看预处理结果 |
第1天 晚上 | 复习 | | 梳理知识点 |
第2天 上午 | AFNI指标计算 | | 使用案例数据进行指标计算 |
第2天 下午 | AFNI命令学习 | | 使用案例数据进行AFNI内置命令的操作练习 |
第2天 晚上 | 复习 | | 梳理知识点 |
第3天 上午 | 统计分析 | AFNI内置命令小工具使用 使用AFNI进行统计分析
| 进行统计分析练习 |
第3天 下午 | AFNI巩固 | | 操作练习 |
第3天 晚上 | 复习 | | 梳理知识点 |
学习说明：导师会根据训练营规划与学员基础，为学员量身推荐相应课程，学员可自主选择回放、倍速、快进等功能，灵活把握学习进度。考虑到不同知识背景的讲师，讲课重点与涵盖细节不同，课程采用冗余性设计，内容充分，通过：导师跟进制度 + 体系化课程视频 + 体系化学习资料 + 数据分析模拟实战训练 + 助教现场指导的方式，确保完整掌握科研需要的所有技术细节。AF01-1：基于AFNI的数据分析-主讲老师 王晴
AF01-2：基于AFNI的数据分析-主讲老师 黄国峰
AF01-1：基于AFNI的数据分析-主讲老师 王晴
AFNI（Analysis of Functional NeuroImages）是一款功能强大的脑功能成像数据分析软件，本课程将介绍AFNI软件的一些核心功能。本课程将从零开始，引导学员掌握在Linux操作系统中常用的命令，这是进行神经影像学数据处理不可或缺的技能。讲解如何使用AFNI进行功能磁共振成像(fMRI)数据的预处理，包括数据校正、配准和其他必要的预分析步骤。课程将教授如何利用AFNI计算几种重要的静息态功能连接指标，包括ALFF、fALFF、ReHo和RSFA，这些都是评估大脑功能组织的重要参数。除了理论讲解，我们还将通过具体的案例演示AFNI内置命令的使用，让您能够在实践中熟悉这些工具，增强数据处理能力。
| 课程编号：AF01-1 |
| 主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 （每课时45分钟） |
| 王晴 | AFNI工具包介绍与数据转换 | Linux基础命令讲解 AFNI基本术语解释 DICOM数据格式转换及批处理 AFNI界面使用演示
| 7课时 |
| AFNI预处理与指标计算 | | 7.5课时 |
| AFNI 内置命令讲解 | | 7课时 |
| AFNI 内置命令讲解与统计分析 | 计算功能连接 制作mask、提取时间序列等具体案例练习 使用AFNI进行统计分析
| 3.5课时 |
AF01-2：基于AFNI的数据分析-主讲老师 黄国峰
本课程旨在通过一系列的复习模块，巩固并深化学员AFNI相关知识与技能。我们将重温Linux环境下的常用命令，确保您能够在操作系统层面自如地管理数据和执行脚本。课程将带领您回顾AFNI软件的核心功能和操作，包括其独特的术语和工作流程，以加深对这款强大工具的理解。我们将再次探索AFNI的图形用户界面，使您更加熟练地使用可视化工具进行数据浏览和分析。复习如何使用AFNI进行fMRI数据的预处理，以及复盘如何计算重要的静息态功能指标，如ALFF、fALFF、RSFA和ReHo。课程将重温AFNI的三维命令，这些命令是进行高级数据分析和可视化所必需的。通过本课程的复习，学员将能够更加自信地应用AFNI进行神经影像学数据分析，无论是预处理、质量控制、功能指标计算还是高级统计分析。| 课程编号：AF01-2 |
| 主讲老师 | 课程名称 | 具体内容 | 课时数 （每课时45分钟） |
黄国峰
| AFNI基础介绍与数据转换巩固 | Linux基础命令复习 AFNI内容回顾 DICOM数据转换 AFNI图像界面复习
| 2课时 |
| AFNI预处理与指标计算-复习 | | 1.5课时 |
| AFNI命令讲解 | | 2课时 |
| AFNI命令讲解与统计分析命令-复习 | | 2课时 |
脑海科技设立于萧山区紫橙国际创新中心3号楼10层，是一家专注于脑影像相关的科研平台研发、技术培训、数据分析技术服务及脑科学相关设备销售的科技型公司，已被认定为“国家级高新技术企业”、“国家级科技型中小企业”、“浙江省创新型中小企业”及“浙江省科技型中小企业”，入选杭州市萧山区高层次人才创业创新“5213”领航类项目，并经杭州市科协审批建立了“博士创新站”。
贾熙泽，博士，杭州脑海科技首席执行官，现任山东第二医科大学附属医院特聘专家、常熟市第二人民医院磁共振脑成像研究中心副主任、特聘研究员、兼任杭州师范大学附属医院认知与脑疾病研究中心副研究员、大连市友谊医院特聘教授、山东第二医科大学医学影像学院硕士生导师、宁波市康复医院医学技术顾问、佳木斯大学信息电子技术学院硕士生导师、中国心理学会积极心理学专委会委员、浙江省数理医学学会放射学专委会委员、浙江省康复医学会神经调控专委会委员及杭州市萧山区青年科技工作者协会会员。主持国自然青年基金项目、浙江省智能教育技术与应用重点实验室开放研究基金重点项目，入选杭州市青年科技人才培育工程项目，作为主要参与人参与 8 项国自然科学基金项目、 1 项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题。目前合作发表 SCI 论文 30 余篇，以主要作者在 Science Bulletin、 Human Brain Mapping、 The Journal of Headache and Pain 及 Journal of Affective Disorders 等杂志发表文章 30 余篇（第一作者或通讯作者），文章被 SCI 杂志引用近968次，h-index =16，担任 40余个SCI杂志的审稿人。根据我们的前期实战，学习中心模式相对于传统培训班模式效果更好。传统的培训班通常在6天内集中式现场短时间内讲授大量知识点，学员很容易跟不上。另一种方法是线上课程，该方式价格也要数千元，根据已有经验而言，由于学员基础不同、背景不同，效果很难达到预期，并且也存答疑不方便等问题。
经过脑海科技核心团队反复沟通及研究，决定在同等的价格下，提供更优质的服务。针对AFNI数据分析学习，AF01A训练营涵盖以下内容：3）独享高性能工作站：1台（配置intel i7以上），不需要自带电脑，高性能的硬件，让学习效率更高4）体系化教学资源：2套由浅入深的课程，一共 32.5课时6）体系化案例数据：一共3套，难度等级不同的实战数据，模拟真实科研遇到的各种问题7）小组答疑：助教现场答疑与指导，每个小组3-5人8）考核与测验：考核与测验评估学习进展，提出改进建议与查漏补缺另外，对于有更高需求的学员，还可以支持一对一答疑等方式，欢迎咨询。
原价：3350元（5人成团）、3450元（3人成团）、4890元（单人购买）限时优惠价：8月31日前报名参加课程可享受优惠价3680元/人（单人购买），转发朋友圈集赞超过28个赞，可享受优惠价3480元/人（单人购买）（1）随到随学，预约制报名。考虑到实验室承载能力有限，采用预约制，目前实验室对外开放10个学习名额。（2）报名流程。报名可先扫描以下二维码添加樊衍孜微信（扫描以下二维码或添加微信号：19906719439），我们将与您电话沟通学习需求及目标，并出具学习计划及对应报价单。完成付款后，即可开始预约学习，随到随学。 （3）关于发票。可开具能够报销的正式发票（如：技术服务费及培训费等）。支持预存，可以现场刷公务卡或银行卡转账，学习期间谢绝录像及录音。电话咨询：0571-2883 4398（请按3号键）邮箱咨询：fanyanzi@brainimaging.cn实验室地址：浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼6楼602室此外，还会陆续推出涵盖更多技术的训练营包含但不限于：1）任务态数据分析：任务态激活分析、心理生理交互效应（PPI）、动态因果模型（DCM）、多体素模式分析（MVPA）......2）定量磁化率成像（QSM）：包含QSM图像的创建与标准化、QSM信号值的提取等3）沿血管周围间隙弥散张量成像分析 (DTI-ALPS)4）基于组水平结构网络分析：包含组水平结构网络的创建、全局指标、节点指标计算，网络攻击性分析、HUB节点识别等5）深度学习在脑影像数据中的应用（如生成对抗网络、强化学习、迁移学习等）如有其他想要学习的内容，欢迎添加樊衍孜的微信反馈（微信号：19906719439），我们将研发新的学习方案。
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