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写在前面
2021年,AlphaFold2的发布,拉开了“人人皆可做蛋白结构分析”的时代大幕,蛋白质结构预测及相关分析开始走进了普通科研人的电脑、实验乃至文章中。本公众号自2023年起,持续关注蛋白质结构预测&分析&可视化相关技术的更新,并累积发布相关技术贴共 13 篇。2024年,随着AlphaFold3的发布,蛋白质结构预测是否会迎来新的变革尚未可知(这涉及了AlphaFold3不开源引发的种种争议),但借此机会,我们将本公众号已发布的这13篇技术贴根据应用场景进行分类汇总,便于大家收藏检索学习;相信我们,如果你想独立完成蛋白质结构预测&分析&可视化,学这一篇帖子就够了!
结构预测篇
如何利用AlphaFold进行蛋白结构预测?下面的内容值得了解:
结构可视化篇
获得了蛋白结构预测结构,但该如何绘制发表级可视化图片?不要发愁,看看下面的内容:
分子对接篇
获得了蛋白模型,也知道小分子底物,可该如何验证它们之间的相互作用?别慌,分子对接了解一下:
结构比对篇
还在用序列比对?人人都可做蛋白结构预测的时代,何不试试结构比对?
实用工具篇
蛋白质结构预测&分析需要做一些数据处理怎么办?不是问题,实用小工具已为你准备好了!
写在最后
希望这篇汇总贴可以帮到大家,让每个人都可零门槛轻松完成蛋白质结构预测&分析&可视化。日后,我们还会持续追踪蛋白结构领域的新技术,为大家带来更多更好的技术分享!
END
编辑 | Narcissus
供稿 | Deeecade
审核 | 农心生信工作室