Nat Commun | 有机施肥共同选择全球土壤微生物组中遗传相关的抗生素和金属抗性基因

文摘   2024-10-03 09:58   广东  

来源:土壤化学(2024年9月30日)

抗生素抗性基因(ARGs)和金属(类)抗性基因(MRGs)在有机肥料施用的农业生态系统中共存,其丰度相关性已得到证实,但有机施肥共同选择的ARG-MRG基因的遗传连锁证据仍不明确。研究通过对511个全球农业土壤宏基因组的分析发现,与未施有机肥的土壤(22种类型)相比,有机施肥使微生物群落中多种ARG-MRG携带的片段(AMCCs)的数量增加了三倍(63种类型)。宏转录组数据表明,在较高的砷胁迫下,AMCCs的表达增加,ARG-MRG的共调控现象显著。有机施肥通过影响土壤性质以及ARGMRG的丰度,增强了ARG-MRG在基因组元件中的共存性。因此,我们构建了一张全面的全球地图,描绘了在农业土壤中共存的ARG-MRG与毒力因子和可移动基因在宏基因组装配基因组中的分布。该地图揭示了中北美洲、东欧、西亚和中国东北地区共存ARG-MRG的相对丰度和潜在致病风险(风险范围为4-6),相比之下,其他地区的风险范围为1-3。我们的研究结果强调,有机施肥在全球土壤微生物群落中共同选择了遗传连锁的ARGMRG,并强调了减缓这些共抗基因扩散以保护公共健康的重要性。

农业用地抗生素和金属共耐药细菌风险的全球制图
文献题录

Liu, ZT., Ma, RA., Zhu, D. et al. Organic fertilization co-selects genetically linked antibiotic and metal(loid) resistance genes in global soil microbiome. Nat Commun 15, 5168 (2024).

原文链接

https://doi.org/10.1038/s41467-024-49165-5  




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