科级干部与处级干部虽然只是上下级差距，但从职级来看，正科级干部要比正处级干部低2个级别，两者退休后的待遇差距还是非常大的，再加上地区、财政收入等因素的影响，这种差距甚至是成倍的。
以正科级、正处级干部为例，正科级是市级以下乡镇地区一把手，比如乡镇长、县各局局长、乡镇书记等都是正科级干部，对应的公务员级别是16～23级；正处级是县级机关单位一把手，比如县长、县委书记、县各局局长等都是正处级干部，对应的公务员级别是12～18级。
正科级干部与正处级干部的退休待遇主要体现在两个方面。
从目前来看，无论什么类型的公务员，其退休金是在职期间的80%以上，也存在退休工资比在职工资高的现象，具体有多少受职务、工龄、任职年限等因素的影响。
正科级与正处级的基本工资也有不小的差距。正科级干部是16级5档，其中级别工资是969元职务工资是1145元，每个月的基本工资加起来就是2111元；正处级干部是12级5档，其中级别工资是1354元职务工资是1835元吗，每个月的基本工资加起来就是3189元。正科比正处每个月少拿1075元的基本工资。
但是公务员的工资由基本工资+补贴+奖金+津贴四个部分组成。基本工资只占总收入10%到50%不等，越发达的地区比例也就越低。以30%为例，也就是说正科级干部的工资在7000元左右，按50%比例计算只有4200块钱左右，正处级的工资在10600元左右，按50%的比例计算只有6300块钱左右。
退休金按在职期间的90%计算，那么正科级干部的退休金每个月是6300元左右， 而正处级干部的退休金每个月是9500元左右，正科级干部足足比正处级干部少3200元。当然，中西部地区的退休金差距相对较低，可能也就1000元左右，经济越发达这种差距也就越大。
除了退休金方面的差距，待遇方面也有不小的差距。正科级干部在退休后只能享受普通职工的待遇，而正处级干部在退休后却能享受领导干部的待遇，比如医疗补贴、节假日福利等，这些只有正处级干部在退休后才能享受，正科级干部是无法享受的。
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