新药研究 | 核酸抗体偶联药物(AOC)的表征分析

情感   2024-12-13 12:23   上海  


前言

小核酸药物行业发展迅速,至今已有15款药物获批,成为继小分子和抗体药物后的第三波创新药浪潮。然而受限于递送手段的限制,目前已上市的小核酸药物仅能针对肝脏靶点。小核酸抗体偶联药物(Antibody-oligonucleotide conjugates,AOC)利用抗体将治疗性寡核苷酸递送至特定细胞或组织,将抗体的组织特异性优势,与小核酸的靶点特异性优势相结合,拓展了寡核苷酸药物的组织/细胞靶向性。近年来,诸多公司将注意力和资源集中在开发基于AOC技术的先进药物上,2021年11月,AOC先驱Avidity Biosciences公司的小核酸抗体偶联物AOC1001的I期临床试验完成首例患者给药,标志着全球首款AOC药物进入临床试验。


AOC药物作为具有巨大潜力的新型生物药物,其药物质量的控制对于安全性和有效性至关重要。一方面,每个部分包括抗体的纯度、特异性、亲和力等,小核酸的纯度、稳定性,连接子的稳定性、细胞毒性等需要检测;另一方面,完整AOC药物本身的质量包括抗体和小核酸的偶联比例、游离抗体、游离小核酸的比例等都需要严格监测。

图1. AOC药物的示意图


材料和方法


样品

本实验使用的样品为一种单抗偶联寡核苷酸的AOC药物,浓度为40 mg/mL。IgG的理论分子量为147244 Da,寡核苷酸(oligodeoxynucleotide, ODN)的理论分子量为6581Da,与IgG连接前需先对ODN进行修饰,将ODN的5`-端磷酸骨架与HS-C6结构反应,形成HS-C6修饰的ODN(分子量6777Da)。


IgG和ODN的连接方式为Sulfo-SMCC偶联方式,偶联过程见图2,整个偶联过程分为两步,第一步IgG的游离-NH2与SMCC反应形成马来酰亚胺激活抗体(maleimide-activated IgG),之后再与连接在HS-C6的ODN反应,得到最终的偶联产物。



结果与讨论


1. CZE结果分析

在CZE条件下可有效分离游离IgG,AOC及游离ODN分子。标准品和样品的分离结果见图3。


在CZE中,样品的分离基于分子在电场作用下荷质比的差异。在碱性缓冲液条件下,由于样品中的IgG、ODN以及AOC都带负电荷,在正电场下荷质比越大的分子迁移速度越慢。荷质比主要由电荷数和分子量决定,游离IgG分子量最大,带的负电荷数量比较少,荷质比小,因此会最先出峰。游离ODN由于分子量最小,电荷数最高,因此荷质比最大,会最后出峰。对于AOC来说,其分子量与IgG相比变化不大,而电荷数随着ODN的偶联而增大,因此迁移速度会慢于IgG,且偶联的OND数目越多,电荷增加越多,迁移速度越慢。迁移时间顺序为,IgG < IgG-(n)ODN<odn< span="">。在本次实验中,IgG标准品的迁移时间在6.25 min,ODN标准品的迁移时间在20.95 min,与上述理论推导出峰顺序一致。


AOC样品各峰指认:峰1迁移时间与IgG标准品的一致,推测为游离IgG的峰。峰2,3,4迁移时间6.97-8.52 min,在IgG和ODN之间,根据前述理论推导,推测为IgG上偶联了不同数量ODN分子的峰,且峰2偶联的ODN分子数量最少,峰4偶联的ODN分子数量最多。峰7迁移时间与ODN标准品的一致,推测为游离ODN的峰。峰5和峰6迁移时间比峰7略早,但是紫外吸收光谱图与ODN标准品的一致,推测分别为HS-C6修饰的ODN及其二聚体。


图3. CZE条件下空白对照、AOC样品,IgG标准品及ODN标准品的电泳图。


2. LC-MS结果分析

为了验证CZE中推断的峰2、3、4是否为IgG偶联了不同数量ODN的峰,并确认偶联的数量,我们尝试了HRMS的方法。通过HRMS分别检测了IgG标准品和AOC样品, MS结果见图4。在SCIEX OS软件中对IgG标准品TOF MS图谱进行解卷积,确认IgG的分子量为147244.2Da,在AOC样品TOF MS图谱的解卷积结果中也检测到分子量为147246.3Da的一簇峰,推断是游离IgG的峰,与IgG标准品相比多的2Da可能是由于AOC样品异质性较强导致的解卷积后分子量差异。在AOC解卷积图谱中还检测到比游离IgG分子量多6994.6Da, 13987.8Da以及20847.4Da的峰,鉴定为IgG连接1个ODN(IgG-1ODN),2个ODN(IgG-2ODN)和3个ODN(IgG-3ODN)的峰。增加的6994.6Da为IgG上连接了SMCC linker及HS-C6修饰的ODN分子产生的分子量。


HRMS的结果验证了CZE中峰2,峰3和峰4确实是IgG偶联了不同数量寡核苷酸,而且确认峰2,3,4分别为IgG-1ODN,IgG-2ODN和IgG-3ODN。


在游离IgG的峰簇中还看到分子量加221.8Da的异构体峰,为IgG连上了一个linker,与图2中的AOC偶联过程相符合,偶联物从图2虚线处断开即为IgG加221Da的分子量。


图4. IgG标准品和AOC样品的HRMS图谱。A.总离子流图(TIC图,蓝色为IgG标准品的,红色为AOC样品的)。B. TOF MS图(蓝色为IgG标准品的,红色为AOC样品的)。C. IgG标准品的解卷积结果。D. AOC样品的解卷积结果。


进一步将原始数据上传至SCIEX Biologics Explorer软件进行完整分子量分析,计算IgG,IgG-1ODN,IgG-2ODN及IgG-3ODN各峰的峰面积见图5(Volume),通过峰面积计算各峰的比例分别为32.90%,44.54%,20.52%及2.03%。


CZE与HRMS两种结果计算的各组分比例比较如表2。从表2可以看出,CZE和HRMS两种技术计算的不同组分的比例比较一致。


表1:AOC药物中各组分比例

*注:CZE条件也可以分离检测到游离ODN及ODN与连接肽相连的峰,因为HRMS条件下无法检测到游离的ODN,因此,在与HRMS计算的组分对比时CZE也没有考虑ODN的比例


结论


  • 利用PA800 Plus,采用CZE方法有效分离了AOC药物中的游离IgG,不同ODN偶联数量的AOC以及游离ODN等不同形态的分子,实现AOC药物与游离杂质之间的分离。


  • 利用X500B高分辨质谱,进一步验证了CZE分离得到3个IgG-ODN偶联物相关的峰分别是IgG-1ODN,IgG-2ODN和IgG-3ODN。


  • CZE和LC-MS两种方法计算的各组分比例高度一致,说明两种方法在对AOC药物进行组分分离和结构确认时可以相互佐证,得到更为准确可信的结果。


参考文献

1. Lin Shen, et al. Chemical Biology Approaches toward Precise Structure Control of IgG-Based Antibody-Oligonucleotide Conjugates. Chembiochem.2023 May 2;24(9)


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