【CosMx 6K一篇看全】中国及全球多个科学团队率先获得CosMx 6K数据,开启创新研究

科技   2024-07-02 11:20   上海  

CosMx™ Human 6K Discovery Panel

单细胞/亚细胞分辨率 + 空间原位 + >6K基因


您是否正在致力于开发绘制单细胞图谱?您是否着眼于鉴定细胞状态并探索其功能?您是否关注于细胞配体-受体相互作用以研究细胞通讯?您是否致力于解析组织微环境表型或进行生物标记物发现?


如果是这样,CosMx™ Human 6K Discovery Panel将以前所未有的深入洞察力,帮助您加速探索发现和转化应用之旅!


自今年CosMx™ Human 6K Discovery Panel正式发布以来,在全球得到了广泛关注和深入应用,已支持全球科学团队在国际学术会议上展示了数篇前沿研究海报(详见文末“传送门”)。值得一提的是,中国科学家团队也已产生中国本土CosMx 6K数据,稳步开展更深入的分析挖掘工作,成为全球最早开展超多靶标单细胞空间原位分析研究的创新领导力量。


产品特征

全面的通路覆盖和稳定可靠的数据质量



1

超多检测靶标:在单张载玻片上分析>6000种RNA靶标,包含>400对配体-受体,全面剖析几乎所有生物学通路;

2

超高分辨率:真正意义的单细胞分辨率,甚至亚细胞分辨率;

3

行业领先的细胞分割算法:实现精确的单细胞边界识别和界定,保证后续单细胞原位转录组分析的可信度;

4

支持灵活定制方案:可定制添加多达200个额外的RNA靶标;

5

高度可信的数据质量:设置多重阴性对照,增强您对数据质量的信心;

6

利用易用的交互式AtoMx™空间信息平台 (SIP)开展数据分析和结果可视化。


CosMx™ Human 6K Discovery Panel能让您在单细胞水平上对几乎整个生物学通路进行空间分析,所涵盖的基因靶标经过了充分验证,并具有简单的样本制备流程直观易用的仪器操作可靠稳定的系统运行等特点优势,全方位加速您的单细胞空间生物学研究。超多靶标的单细胞空间原位表达信息不仅可以实现精细的细胞分型,绘制单细胞空间图谱,对于细胞配受体检测、细胞通讯、细胞状态、细胞微环境表型分析和生物标志物发现也提供了强大的挖掘潜能。


CosMx 6K公共数据集

基于CosMx™ SMI单细胞空间原位分子成像系统,CosMx Human Frontal Cortex FFPE Dataset数据集对人类额叶皮层FFPE样本中的6078个基因进行了单细胞分辨率的空间定位和原位表达分析*。该套数据集展示了CosMx™ SMI在单细胞空间领域领先的数据表现和性能。


扫描二维码或点击文末“阅读原文”进入NanoString官网查看和下载数据。


*本套数据集所使用的6078基因的检测方案是CosMx™ Human 6K Discovery Panel的早期研发版。


CosMx最新应用及CosMx 6K资源“传送门”


基于CosMx 6K RNA单细胞空间原位方案,利用人类多组织FFPE样本构建综合单细胞空间图谱

【CosMx 6K+精准精细的细胞分割】星形胶质细胞胞体和突触的亚细胞分辨率空间转录组分析

【会议回放】中国高分成果一作分享会暨CosMx 6K单细胞空间数据展示

【Nature Medicine】MD Anderson癌症中心研究团队利用CosMx单细胞空间原位技术揭秘肿瘤微环境新细节

【百花齐放 兼听则明】如何科学评估单细胞空间成像技术(客户声音)


CosMx™ SMI 单细胞空间原位成像系统

CosMx™ SMI是一个突破性的单细胞空间原位成像平台,结合了超高分辨率成像技术多靶标检测能力,能够对组织切片中6000+种RNA和64+种蛋白质分子进行单细胞和亚细胞分辨率的原位成像,支持研究人员实现精准透彻的生物学解析。


众所周知,FFPE样本中的RNA和蛋白质通常质量较低,尤其是RNA往往降解严重,使得对于FFPE样本的分子检测分析极具挑战性。CosMx™ SMI系统具有简单的样本制备流程和稳定的原位杂交化学原理,并能够兼容多种组织类型(如新鲜冷冻(FF)、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)、组织芯片(TMA)、类器官等),在单细胞分辨率上实现RNA和蛋白质在组织细胞原位精细的可视化展示和精准的定量分析


超多靶标的单细胞空间原位表达信息不仅可以实现精细的细胞分型,绘制单细胞空间图谱,详细展示细胞邻域组织微环境,同时还支持细胞配受体检测,在真实的组织空间背景下推进您对细胞间相互作用、细胞通讯细胞状态的深刻洞察。


CosMx™ SMI应用包括:

  • 单细胞空间图谱:发现不同细胞类型,绘制其组织空间定位;

  • 差异表达分析:基于空间背景的单细胞转录组差异表达分析;

  • 解析细胞状态和细胞功能;

  • 细胞邻域分析:组织微环境的空间表型;

  • 细胞通讯:配体-受体相互作用;

  • 转录本和蛋白的亚细胞定位;

  • 生物标志物的发现和验证。

NanoString致力于为任何规模、任何阶段的多领域研究提供全面的空间生物学解决方案。GeoMx® DSP是空间全转录组领域的领先平台,主要针对由多细胞组成的功能单元、细胞亚群和特定组织结构等进行空间原位的全转录组或蛋白质组的表达谱分析。而CosMx™ SMI则着重在空间检测分辨率方面进行了突破性提升,可以实现对组织切片中上6000+种RNA和64+种蛋白质在单细胞和亚细胞水平的原位表达进行检测。GeoMx® DSP和CosMx™ SMI共同为空间生物学的新发现和新突破,提供着前所未有的先进科技力量!


NanoString生物技术
多维度空间生物学创新方案:空间全转录组、空间蛋白组(570+蛋白)和单细胞空间原位技术
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