是不是很多人都认为中药方向发文很慢、实验-写作-投稿-修回补实验-接受这整个周期很长？
确实只做实验的话会面临这个发文慢的问题，但现在有了网药这个神助攻，大大节省了实验时间，用生信为主、实验为辅的模式就能快速发文，缩短研究周期的同时发文实力也能与纯实验相媲美，所以我们没有理由不选它啊！
今天小仙再带来了一篇发文超快的网药文章，38天接受，Q1区4.8分（这也是个毕业神刊，中医药方向的毕业党赶紧码住），这速度、这性价比，就说厉不厉害吧？分析了下文章，思路设计为UPLC化学成分鉴定+网药+简单实验，算是常规网药的发文模式，如果分析非肿瘤疾病发文难度有点大，但把这套分析放在肿瘤中那就够用了，在网药中选择肿瘤是占优势的，研究量少竞争小！网药思路变化多，到底该选哪一个？小仙日更生信新思路、新方向，只要跟紧我的每日推荐，思路的事就迎刃而解啦！什么？看到新思路不知道怎么复现？直接联系小仙，专业生信团队，个性化思路设计、生信分析都能做，十年经验，包满意的~
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题目：整合UPLC-Q-Exactive Orbitrap/MS、网络药理学和实验验证揭示黑老虎根在结肠癌中的潜在作用机制
杂志：Journal of Ethnopharmacology（IF=4.8）
研究背景
黑老虎根是用于治疗胃肠疾病的传统民间药物，具有抗肿瘤活性。近年来，对黑老虎的研究主要集中在化学成分的分析和活性的筛选上，但很少有采用质谱分析黑老虎根的研究。
研究思路
该研究首先采用UPLC-Q-Exactive Orbitrap/MS对黑老虎根进行化学分析，并通过诊断产物离子、碎片模式、ChemSpider数据库和内部数据库对化合物进行鉴定。利用网络药理学筛选药物和疾病的共同靶点，功能富集分析与药理机制相关的途径。此外，还采用 MTT 法测定了化合物对结肠癌细胞株的抑制活性，并通过流式细胞术和 Western 印迹法评估了其凋亡能力。
主要结果
1. 黑老虎根中成分的鉴定
作者采用 UPLC-Q Orbitrap HRMS 系统，以 MS/dd-MS2 全扫描模式分析了黑老虎根提取物的化学成分。根据正离子和负离子模式下的总离子色谱图（TIC）和标准品对比分析，共鉴定出 54 种化合物（图1-3）。
图1：正离子模式下的总离子色谱图
图2：负离子模式下的总离子色谱图
图3：54种化合物
2. 网络药理学分析
从Swiss Target Prediction数据库中获得54种化合物的726个靶点。从 OMIM 平台、DisGeNET 平台和 GeneCards 数据库中获得1462个结肠癌疾病相关靶点，两者取交集得到153 个共同靶标（图 4）。针对这153个靶点进行PPI网络构建，TP53、AKT1、EGFR、HSP90AA1、CASP3等靶点为关键靶点。对这些靶点进行GO和KEGG富集分析，结果显示在黑老树根对结肠癌调控的各种通路中，最显著富集的通路与癌症有关，在细胞过程相关通路中，最明显富集的通路是细胞凋亡（图5）。
图4：共有靶点的鉴定
图5：功能富集分析
3. 实验验证
以紫杉醇为阳性对照，通过 MTT 生物测定检测4 种化合物对 HCT-116细胞生长的抑制作用。结果表明，Kadsulactone（37）、五味子酸（51）、heilaohuacid G（52）和 seco-coccinic acid F（53）对 HCT-116 细胞株的细胞毒活性最强。接下来，利用V-FITC/PI 染色法评估了五味子酸（51）、heilaohuacid G（52）和 seco-coccinic acid F（53）这三种三萜类化合物对 HCT-116 细胞的凋亡诱导作用。同时用WB检测凋亡蛋白Bax 和 Caspase-3 的表达，结果表明五味子酸（51）、heilaohuacid G（52）和 seco-coccinic acid F（53）在体外诱导 HCT-116 发生剂量依赖性细胞凋亡（图6）。
图6：细胞凋亡检测
小结
这篇文章的网药纯生信分析非常简单吧？纯纯的常规网药分析，生信和实验的工作量都不大，但选择了肿瘤方向后发文就容易了很多，做中药研究的朋友不妨试试肿瘤方向，它比非肿瘤性价比更高！另外，Journal of Ethnopharmacology这个杂志也可以关注一下，还是很适合毕业投稿的，审稿很快。想要在中医药领域追求创新思路的朋友，建议紧跟小仙脚步，生信热点日更不停！想做个性化生信分析？欢迎随时联系小仙！专业团队为你保驾护航，1V1定制创新思路~
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