最近孟德尔随机化(MR)属实有点“火”呀!网传MR被Frontiers无情封杀!那以后还敢做吗?答案是肯定的!说到底,MR只是一个分析工具,用的好依然能够发高分!
今天小仙分享的这篇药靶孟德尔就是一个很好的例子,将中医药和孟德尔完美结合,并且成功发表在了柳叶刀子刊EBioMedicine上!这本期刊小仙碰到过很多次了,仔细研究下发现真不简单!该刊为中科院一区TOP,IF=9.7,创刊10周年,影响因子一路飙升,连续多年双一区Top,国人、生信友好,发文量大,自引率极低!妥妥的“黑马期刊”!除了版面费有点小贵,几乎没什么缺点(PS:有投稿需求的小伙伴记得收藏一下哦~)
这篇上海交通大学今年8月发表在该刊上的药靶MR研究,采用了多样本MR分析、基于汇总数据的MR分析和共定位分析探讨了抗糖尿病药物靶点作为治疗骨关节炎(OA)的潜在疾病修饰药物的作用。本文思路清晰,快来尝鲜~
(PS:思路送到眼前啦,下一步就是复现它!什么?你说不知道如何把自己的课题与这类思路进行有机结合?那还等什么,找小仙来帮你啊,咱有专业团队,为您精准提供个性化服务~)
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l题目:探索抗糖尿病药物靶点作为骨关节炎中潜在的疾病调节剂
l杂志:EBioMedicine
l影响因子:IF=9.7(中科院一区TOP)
l发表时间:2024年8月
(友情提示:文末可获取文献的DOI号哦~)
骨关节炎是导致残疾的主要原因,目前尚无有效阻止疾病进展的药物。研究发现,抗糖尿病药物可能作为疾病修饰性骨关节炎药物(DMOADs),影响与关节健康相关的途径,为治疗提供新的可能性。本研究通过遗传学方法探索抗糖尿病药物靶点与骨关节炎表型之间的因果关系,以期为开发针对性的DMOADs提供依据。
本研究采用两样本孟德尔随机化(MR)、基于汇总数据的MR(SMR)和共定位分析方法,评估抗糖尿病药物靶点与12种骨关节炎表型的因果关系,使用来自最大范围的全基因组关联分析(GWAS)和eQTLGen联盟的基因表达数据。
1、五种降糖药靶点对12种骨关节炎表型的影响
采用随机效应IVW法进行MR主分析,辅以固定效应IVW、加权中位数、加权模式等敏感性分析,结合MR质量控制标准,发现11个药物靶点与至少一种骨关节炎表型显著相关。磺脲类药物靶点ABCC8/KCNJ11与多部位骨关节炎风险增加相关,而TZDs的PPARG靶点则显示保护作用。二甲双胍和GLP1-RA靶点与降低膝、手指骨关节炎风险相关(图1)。
图1五种降糖药靶点对12种骨关节炎表型的影响
2、降糖药物靶向基因表达与骨关节炎
初步SMR分析显示,eQTLGen中KCNJ11、CPT1A、PPARD、IGF1R和GANAB基因表达与骨关节炎表型显著关联。KCNJ11表达增加与多种骨关节炎表型风险降低相关,而GANAB表达增加则与风险增加相关。PPARD表达显示对骨关节炎的保护作用(图2)。
图2 抗糖尿病药物靶点与骨关节炎的基因表达分析
研究中,KCNJ11、GANAB、ABCA1和GSTP1基因在不同组织(血液、大脑、骨骼肌)的表达与骨关节炎风险的关联在多个数据集中得到复制。KCNJ11在大脑中的表达与多种骨关节炎表型呈负相关,而骨骼肌中的表达也与降低骨关节炎风险相关(图3)。
图3 KCNJ11和GANAB基因在血液(来自eQTLGen)、大脑(来自PsychENCODE)和骨骼肌(来自GTEx)中的表达与12种骨关节炎表型的关系的SMR分析结果
3、骨关节炎推定蛋白的共定位
共定位分析揭示KCNJ11、ESRRA、RXRB、INSR和GANAB等基因与骨关节炎表型强烈共定位,而ABCA1、CPT1A等基因呈现中度共定位。KCNJ11在多分析中与广泛骨关节炎表型一致关联,RXRB和INSR在特定表型组中亦显示中度共定位,扩展了对骨关节炎遗传基础的理解(图4)。
图4 抗糖尿病药物基因表达与骨关节炎的共定位结果
本研究通过MR、SMR、共定位分析探讨了抗糖尿病特定药物靶点与骨关节炎间的显著相关性,为骨关节炎治疗提供了新视角。文章的设计思路清晰明了,是不可多得的药靶MR范文了,小伙伴们记得点个“收藏+在看”细细品读吧!选题拿不准、思路搞不定都可以找小仙评估设计哦,小仙可是专业的,尽量让你的发文少走点弯路!
文献信息:PMID: 39153411 DOI: 10.1016/j.ebiom.2024.105285
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