Nat Methods | 构建泛基因组图谱

学术   2024-10-22 06:32   法国  

Garrison E, et al. (2024). Building pangenome graphs. Nature Methods, doi: 10.1038/s41592-024-02430-3.


(2024年10月21日发表)


摘要参考翻译:泛基因组图可以表示多个参考基因组之间的所有变异,但现有构建方法排除了复杂序列或基于单一参考基因组。为此,我们开发了PanGenome Graph Builder,一种不会产生偏差或排斥的泛基因组图构建流程。PanGenome Graph Builder通过all-to-all比对构建变异图,我们可以在其中识别变异、测量保守性、检测重组事件并推断系统发育关系。


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