MPB | 林科院袁志林组-​枫香-真菌互作培养体系构建

学术   教育   2024-11-12 07:02   广东  


枫香-真菌互作培养体系构建

Method for Constructing Liquidambar Styraciflua-Root Fungus Interaction System

王玉宸1, 2,彭龙1, 2,潘雪玉3,袁志1, 2 *


1林木遗传育种国家重点实验室,中国林业科学研究院,北京;2中国林业科学研究院亚热带林业研究所,杭州3中国林业科学研究院热带林业研究所,广州


*通讯作者邮箱yuanzl@caf.ac.cn

引用格式:王玉宸, 彭龙, 潘雪玉, 袁志林. (2021). 枫香-真菌互作培养体系构建. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003660. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003660.

How to cite: Yunyun Gao, Kai Peng, Defeng Bai, et al. 2024. The Microbiome Protocols eBook initiative: Building a bridge to microbiome research. iMeta 3: e182. https://doi.org/10.1002/imt2.182


摘要林木可与真菌形成多种不同类型的关系以适应复杂的生存环境。作为林木-真菌互作研究的常见树种之一,北美枫香 (Liquidambar styraciflua) 是一种优良的抗逆树种选育材料,具有耐干旱、耐瘠薄、萌芽能力强、生长速度快等特点,通过播种繁殖易获得实生苗,经消毒处理后可得到无菌苗用于枫香-真菌互作培养体系构建。此外,北美枫香是优良的彩叶树种,叶入秋变红,是极具生态研究价值及观赏经济价值的造林绿化树种。为了探究枫香-真菌的互作机制及促进枫香适应环境胁迫的效应,需要建立标准的实验室体系互作研究方法。本文介绍了枫香-真菌互作培养体系的构建方法,包括育苗体系和接种方法等。

关键词:枫香,真菌,互作体系


材料与试剂

1.泥炭土

2.珍珠岩

3.蛭石

4.有机肥

5.ddH2O

6.超纯水

7.WPM粉末 (EKEAR)

8.改良MS培养基 (见溶液配方)

9.20× 大量元素母液 (见溶液配方)

10.100× 微量元素母液 (见溶液配方)

11.100× 铁盐母液 (见溶液配方)

12.100× 有机化合物母液 (见溶液配方)

13.IBA母液 (见溶液配方)

14.0.85%生理盐水 (见溶液配方)

15.0.1%升汞 (见溶液配方)

16.PDA培养基 (见溶液配方)

17.WPM培养基 (见溶液配方)


仪器设备

1.接种针

2.毛刷

3.纱布

4.剪刀

5.镊子

6.滤纸

7.漏斗

8.锥形瓶

9.封口膜

10.移液枪

11.血球计数板

12.打孔器 (直径7 mm)

13.大试管 (38 mm × 250 mm)

14.大培养皿 (直径15 cm)

15.光学显微镜 (Carl Zeiss, model: Axio Scope A1)

16.光照培养箱 (宁波扬辉model: RDN-1500B)

17.PhytatrayTM培养容器 (sigma, catalog number: P5929)

18.立式压力蒸汽灭菌器 (上海申安model: LDZF-50KB-II)


实验步骤

1.真菌接种剂的准备

1.1菌饼接种剂准备

1)PDA培养基灭菌后取出,室温下放置,待培养基温度约45 °C后,倒入一次性塑料培养皿中,待培养基凝固后,进行接种处理。

2)从纯培养真菌平板菌落边缘用接种针挑取菌块,转移至PDA固体培养基上26 °C黑暗条件下培养。

3)待培养7 d后,自菌落边缘使用打孔器 (直径7 mm) 取菌饼作接种剂。

1.2孢子悬浮液接种剂准备

1)PDA培养基灭菌后取出,室温下放置,待培养基温度约45 °C后,倒入一次性塑料培养皿中,待培养基凝固后,进行接种处理

2)从纯培养真菌平板菌落边缘用接种针挑取菌块,转移至PDA固体培养基上26 °C黑暗条件下培养14 d。

3)制备终浓度为1×106 ml-1的孢子悬浮液。制备方法如下:取上一步骤中培养14 d的真菌,在其表面倒一层无菌生理盐水 (0.85% NaCl溶液) ,用无菌毛刷轻轻刮取菌丝。以四层无菌纱布过滤并收集滤液;取滤液50 ml,沿着盖玻片边缘滴入血球计数板计数室,使用光学显微镜进行计数;用生理盐水稀释至浓度为1×106 ml-1的孢子悬浮液作接种剂。

2.无菌北美枫香幼苗的培育

2.1枫香果实成熟期为10-11月份,果穗由绿色转为黄绿色,果实采集后阴干4-7天,然后暴晒数日,用棍打果实即可获得枫香种子 (种子在0-5 °C条件下可贮存5年左右,在-18 °C时贮存时间超过5年) 将枫香种子播种育苗床。土壤基质及其配比:泥炭土:珍珠岩:蛭石:有机肥=1:2:2:2 (121 °C高压灭菌30 min) ,放置于光照培养箱,保持85%相对湿度,光照条件为14 h光照/10 h黑暗,25 °C恒温培养。

2.221天后,当种子萌发并长成株高3-4 cm的幼苗时 (如图1所示) ,从土壤基质中取出。


1. 北美枫香实生幼苗培育。图为在育苗床中播种繁殖的枫香实生幼苗,实生幼苗培养条件为:25 °C恒温;85%相对湿度;14 h光照/10 h黑暗。


2.3在超净工作台剪去幼苗根部,将剩余地上部分放入0.1%升汞中进行表面消毒约12 min,再用ddH2O清洗4-5次去除表面残留升汞。

2.4林木专用生根培养基——WPM培养基 (Woody Plant Medium) 灭菌后取出,室温下放置,待培养基温度约45 °C后,在超净工作台中倒入无菌大试管 (25 ×240 mm) 中,待培养基凝固后,将表面消毒后的幼苗插入培养基 (如图2所示) 。


2. 枫香幼苗生根培养示意图图为在装有WPM培养基的无菌试管中进行幼苗生根培养,光照培养箱内生根培养条件为25 °C恒温;14 h光照/10 h黑暗。


2.5将培养有枫香实生幼苗的大试管转移到光照培养箱中,25 °C恒温培养,光照条件14 h光照/10 h黑暗。实生幼苗重新生根,苗高达到5-6 cm后,可将苗取出进行继代繁殖。将每一株苗的幼茎剪断,再次插入新的WPM培养基中进行扩繁,转移到光照培养箱中并保持同样的温度和光照条件进行继代繁殖。

2.6选取根系大小、发达程度和株高较一致 (5-6 cm) 的无菌幼苗,进行共培养。

3.实验室体系:枫香无菌幼苗-根系真菌互作体系构建

3.1菌饼接种互作体系构建

1)超净工作台紫外消毒后,无菌PhytatrayTM培养容器 (长宽高:11.4 cm × 8.6 cm × 10.2 cm) 中倒入70 ml改良MS培养基

2)将步骤2挑选的根系和株高较为均一的枫香无菌幼苗用镊子将轻轻取出,放入装有ddH2O的玻璃大培养皿中,洗除幼苗根部的培养基残留,并用无菌滤纸吸干表面水份后,转接至装有改良MS培养基的PhytatrayTM无菌培养容器内。

3)分为对照组和处理组,每组设置至少3个重复,每个重复包含10株无菌苗 (如图3所示) 。将步骤1.1中打孔获得的菌饼随机挑取5个均匀转接至根系周围,对照组接种后的菌饼,用封口膜进行密封,防止污染。而后,转移至光照培养箱中以相同条件继续培养,根据自身实验要求设计共培养时间,然后取样进行生理指标的测定。

3.2孢子悬浮液接种互作体系构建

1)超净工作台紫外消毒后,无菌PhytatrayTM培养容器(长宽高:11.4 cm × 8.6 cm × 10.2 cm) 中倒入70 ml改良MS培养基。

2)将步骤2挑选的根系和株高较为均一的枫香无菌幼苗用镊子将轻轻取出,放入装有ddH2O的玻璃大培养皿中,洗除幼苗根部的培养基残留,并用无菌滤纸吸干表面水份后,转接至装有改良MS培养基的PhytatrayTM无菌培养容器内。

3)分为对照组和处理组,每组设置至少3个重复,每个重复包含10株无菌苗 (如图3所示) 。将步骤1.2中稀释获得的孢子悬浮液用移液枪吸取1 ml接种至根系周围,对照组加入0.85%无菌生理盐水1 ml。而后,转移至光照培养箱中以相同条件继续培养,根据自身实验要求设计共培养时间,然后取样进行生理指标的测定。


 

3. 枫香-真菌共培养体系示意图图为在装有改良MS培养基的PhytatrayTM无菌培养容器中进行枫香-真菌共培养实验a:接种无菌PDA琼脂块作空白对照组;b:接种长满菌丝的菌块作实验处理组


溶液配方

1.PDA培养基

马铃薯             200 g (去皮煮熟后过滤取汁液)

葡萄糖              20 g

琼脂                15 g

加超纯水至1 L,调pH至7.0121 °C高温高压灭菌15 min

2.WPM培养基 (Woody Plant Medium)

WPM粉末         2.78 g

蔗糖                20 g

琼脂粉               7 g

IBA母液           600 μl

加超纯水至1 L,调pH至5.8121 °C高温高压灭菌15 min

3.改良MS培养基

20× 大量元素母液    25 ml

100× 微量元素       10 ml

100× 铁盐母液       10 ml

100× 有机化合物     10 ml

蔗糖                 2 g

琼脂粉               7 g

加超纯水至1 L,调pH至5.8 ,121 °C高温高压灭菌25 min

4.20× 大量元素母液

NH4NO3           33 g

KNO3             38 g

CaCl2·2H2O        8.8 g

MgSO4·7H2O      7.4 g

KH2PO4           3.4 g

加超纯水至1 L

5. 100× 微量元素母液

KI                0.083 g

H3BO3            0.62 g

MnSO4·4H2O      1.69 g

ZnSO4·7H2O       0.86 g

NaMoO4·2H2O   0.0025 g

CuSO4·5H2O     0.0025 g

CoCl2·6H2O      0.0025 g

加超纯水至1 L

6.100× 铁盐母液

FeSO4·7H2O        2.78 g

Na2EDTA·2H2O     3.73 g

加超纯水至1 L

7.100× 有机化合物母液

肌醇                 10 g

IVB 烟酸            0.05 g

盐酸硫胺素          0.01 g

盐酸吡哚醇          0.05 g

甘氨酸               0.2 g

加超纯水至1 L

8.IBA母液

IBA粉末            40 mg

溶于少量无水乙醇,吹打混匀

加60 °C超纯水至80 ml

9.0.1%升汞

升汞                1 g

溶于少量无水乙醇,吹打混匀

加超纯水至1 L

10.0.85%生理盐水

NaCl              8.5 g

加超纯水至1 L,121 °C高温高压灭菌15 min


致谢

本工作的顺利开展得益于国家自然科学基金青年项目 (31901290) 的经费支持。


参考文献

1.秦媛. (2017) . 盐碱地植物共生微生物资源及功能初步研究. (Master's thesis中国林业科学研究院) .

2.潘雪玉. (2018) . 沿海防护林树种促生、耐盐根系真菌筛选及机制初探. (Master's thesis中国林业科学研究院) .

宏基因组推荐
本公众号现全面开放投稿,希望文章作者讲出自己的科研故事,分享论文的精华与亮点。投稿请联系小编(微信号:yongxinliu 或 meta-genomics)

猜你喜欢

iMeta高引文章 fastp 复杂热图 ggtree 绘图imageGP 网络iNAP
iMeta网页工具 代谢组MetOrigin 美吉云乳酸化预测DeepKla
iMeta综述 肠菌菌群 植物菌群 口腔菌群 蛋白质结构预测

10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature

系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树 必备技能:提问 搜索  Endnote

扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图

16S功能预测   PICRUSt  FAPROTAX  Bugbase Tax4Fun

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘  

写在后面

为鼓励读者交流快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”讨论群,己有国内外6000+ 科研人员加入。请添加主编微信meta-genomics带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。高级职称请注明身份,另有海内外微生物PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。

点击阅读原文,跳转最新文章目录阅读

宏基因组
宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强本领域的技术交流与传播,推动中国微生物组计划发展,中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号,目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。
 最新文章