手把手教你用Photoshop进行Western blot的半定量分析

学术   2024-11-01 17:59   山东  
图文撰写 | 小郑老师
介  绍
Western Blot是一种对蛋白进行定性的分析方法,属于常规实验操作,其数据处理是必不可少的一步。目前,发表的实验性文献中大多要求包含WB的半定量分析数据。今天,小编给大家介绍用PS进行灰度分析及之后的数据作图处理。

使用软件



本文中使用的软件为Photoshop CC,其他版本的Photoshop,操作步骤基本相似。

图文教程

1、在PS中打开western blot图片                                                            
2、设置参数,在图像-分析-选择数据点,选择灰度值(平均),其他选项可取消

3、处理图片,图像-调整-反向

4、灰度测量,使用魔棒工具点击要分析的条带,下面会显示出灰度值

5、导出数据,点第一行后按住shift键,点最后一行进行全选数据,导出数据

6、在Excel表格中计算目的蛋白和内参蛋白的平均灰度值,用平均目的蛋白除以平均内参蛋白;得到多组比值后,用GraphPad绘制柱状图(其他软件也可以)

7、GraphPad绘制柱状图的过程,大家可以参考昨天的文章:手把手教你用GraphPad Prism绘制带散点的柱状图。只需将步骤3B中的展示格式选择为如下所示即可:

8、得到柱状图

半定量分析处理后,结果就会更有说服力。

怎么样?学会了吧?
不难吧?赶紧来试试吧!
本文仅限作图过程解析,不涉及软件问题。软件的下载,不属于本公众号,也不属于本文所涉内容!

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GraphPad Prism绘制带散点的柱状图
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