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嘿，朋友们~近期火爆出圈的的新贵顶流热点——“棕榈酰化”大家用起来了吗？课题师前面也是分享了几篇文章了，不知道你“消化”了没？课题师奉劝大家一句，这波红利还是要抓紧吃上的，毕竟该热点发的文章基本都是Cell Metab、Nat Commun、Science immunology、Autophagy等各大顶刊！！！你还不看看能不能抓紧这波风口去发它两篇文章！

为助力大家理清思路，顺利发文，今天课题师就再带大家看一篇相关文章吧~文章是中山大学附属第三医院肝外科和肝移植中心郑俊以及南方医科大学广东省人民医院胃肠外科李勇、郑佳彬、潘子豪团队合作在Drug Resistance Updates（IF=15.8）发表的题为：CircPDIA3/miR-449a/XBP1 feedback loop curbs pyroptosis by inhibiting palmitoylation of the GSDME-C domain to induce chemoresistance of colorectal cancer的研究论文。该研究表明circPDIA3直接与GSDME-C结构域结合，通过阻断ZDHHC3和ZDHHC17的GSDME-C结构域棕榈酰化，增强GSDME-C结构域的自抑制作用，从而抑制细胞焦亡。亮点满满，一起看看吧~

1.结合了分子生物学、细胞生物学、生物信息学和动物模型等多种实验方法，全面验证了circPDIA3在CRC化疗耐药性中的作用机制；

2.从分子层面到细胞层面，再到动物模型和临床样本，多层面的研究设计增强了研究结果的可靠性和说服力；

3.研究结果不仅在体外细胞实验中得到验证，还在PDX模型和临床样本中得到支持，显示了其在临床转化应用中的潜力，临床意义也直接拉满。

PS：circRNA现在研究并不算太热门，但如果结合上大热的新贵顶流“棕榈酰化”，那真的是可以横扫2025国自然的，如果你有兴趣的话可以戳戳下方找课题师帮你定制相关的思路哦~

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杂志：Drug Resistance Updates

发表时间：2024年9月

研究背景

结直肠癌（CRC）是全球第二大最常见的恶性肿瘤，也是癌症相关死亡的第三大原因。目前奥沙利铂（OXA）是CRC治疗中广泛使用的药物，但由于OXA耐药性，CRC复发仍然常见。OXA耐药性与多种因素相关，包括异常调节的焦亡过程，因此阐明焦亡的调控机制对于治疗CRC至关重要。本研究聚焦于circPDIA3在CRC化疗耐药性中的作用，揭示了其通过抑制焦亡来促进CRC化疗耐药性的新机制。

研究主要方法

RNA测序和数据收集：进行circRNA微阵列分析，鉴定奥沙利铂（OXA）敏感和耐药CRC组织中差异表达的circRNAs。

细胞培养和转染：培养人CRC细胞系和正常结肠细胞系，通过转染特定circPDIA3 siRNA、shRNA和过表达载体来研究circPDIA3的功能。

qRT-PCR：用于测定细胞和组织样本中circRNA和mRNA的表达水平，以及miRNA的纯化和检测。

细胞增殖和凋亡分析：使用CCK-8试剂盒、EdU增殖试剂盒和流式细胞仪（FCM）进行细胞增殖和凋亡检测。

RNA荧光原位杂交（FISH）和免疫荧光（IF）：用于细胞中circPDIA3的亚细胞定位，以及circPDIA3与GSDME蛋白的共定位分析。

RNA免疫沉淀（RIP）和RNA拉下实验：用于研究circPDIA3与特定RNA结合蛋白的相互作用，以及鉴定circPDIA3的潜在结合蛋白。

共免疫沉淀（Co-IP）和质谱分析：用于鉴定circPDIA3直接结合的蛋白质，以及分析circPDIA3与GSDME的直接相互作用。

染色质免疫沉淀（ChIP）实验：用于研究XBP1与PDIA3基因启动子区域的结合情况。

双荧光素酶报告基因实验：用于验证miR-449a与circPDIA3以及XBP1 3'非翻译区（3'UTR）之间的相互作用。    

Acyl-RAC实验：用于检测GSDME-C域的棕榈酰化修饰。

动物实验：在BALB/c裸鼠中建立PDX模型和皮下成瘤模型，评估circPDIA3对奥沙利铂敏感性的影响。

生物信息学分析：使用RPISeq、catRAPID和RNAComposer软件预测circPDIA3与GSDME之间的相互作用和结构。

研究概要

ü发现与验证：通过circRNA微阵列分析，发现circPDIA3在OXA耐药的CRC组织中表达上调，并与CRC患者的不良临床预后密切相关；

ü功能研究：利用细胞培养、转染和一系列细胞生物学实验（CCK-8、EdU、流式细胞仪等），证实circPDIA3能够诱导CRC细胞对OXA的耐药性，并在体外和体内抑制焦亡过程；

ü机制探究：通过RIP、RNA拉下实验、Co-IP和质谱分析等技术，揭示circPDIA3直接与GSDME-C域结合，通过阻断GSDME-C域的棕榈酰化，增强GSDME-C域的自抑制效应，从而抑制焦亡；

ü反馈回路构建：发现circPDIA3/miR-449a/XBP1形成一个正反馈回路，通过增加circPDIA3的表达来诱导化疗耐药性；

ü临床意义：通过分析临床数据和患者衍生的肿瘤异种移植（PDX）模型，结果支持circPDIA3与CRC患者化疗耐药性发展的正相关性。

研究主要结果

1.circPDIA3在CRC中的鉴定

2.CircPDIA3促进体外化疗耐药

3.CircPDIA3促进PDX模型和CRC患者的化疗耐药

4.CircPDIA3以直接结合的方式与GSDME相互作用

5.CircPDIA3增强了GSDME-C结构域的自抑制作用

6.CircPDIA3抑制的GSDME-C棕榈酰化放大了GSDME-C结构域的自抑制作用

7.CircPDIA3在体内外发挥OXA耐药促进作用，依赖于与GSDME的结合

8.circPDIA3在CRC中的表达受XBP1调控

9.CircPDIA3通过海绵化miR-449a形成一个上调XBP1的正反馈回路

10.circPDIA3的抑制增加了体内对OXA的敏感性

文章小结

总的来说，这篇文章可以拆解成两部分，第一部分是circPDlA3的机制研究，揭示了circPDIA3通过直接与GSDME-C域结合，调节GSDME-C域的棕榈酰化，进而影响焦亡过程；第二部分构建了一个新的circPDIA3/miR-449a/XBP1正反馈回路模型，阐释了circPDIA3如何通过miR-449a和XBP1增强自身的表达，从而促进化疗耐药性。“棕榈酰化”近期也是频繁登上顶刊，课题师预测这个热点马上就要开始卷了，趁着发文量还少，可以找课题师帮你设计思路哦~毕竟，课题师团队不仅文章解读的好，科研做得也出色，干湿结合、临床科研、生信分析，都是行家里手！有需要的朋友速速联系吧~

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