求臻医学x戴尔科技:如何让数智化基因检测造福更多肿瘤患者?

文摘   2024-06-27 14:02   北京  
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在当今社会,癌症(恶性肿瘤)已经成为令人闻之色变的疾病,每年全球都有超过900万人因此而失去生命。但值得庆幸的是,基因检测技术为人类尽早发现肿瘤和治疗肿瘤提供了可能,精准医疗的愿景正在逐步成为实,而人工智能(AI)技术的加入,无疑为这个过程注入了一针加速剂。

相信大家都有目共睹,自从2022年底ChatGPT引领新一轮技术变革热潮以来,AI正在全球范围内成为推动社会生产力和生产效率变革的新动力。然而,AI该如何有效融入各行各业,为极具有行业特色的业务深度赋能,已成为众多企业亟须解决的问题。

有这样一家公司,早在这波通用AI热潮兴起之前就成立了人工智能部门,探索将AI融入医疗健康领域--这家企业就是求臻医学。

据求臻医学市场产品总监李建基博士介绍,自2017年成立以来,求臻医学一直依托新一代基因测序技术和先进的信息挖掘技术,深度融合基因检测与人工智能技术,专注于肿瘤液态活检领域的诊断产品开发和智能迭代升级。其业务范围广泛,包括肿瘤早期筛查、伴随诊断、动态监测、预后评估等多场景应用,并不断探索适合中国人的肿瘤基线及特异性生物标志物,以促进抗肿瘤药物的研发。

求臻医学市场产品总监李建基博士使用戴尔OptiPlex一体机办公

求臻医学人工智能部总监徐全表示,在通过基因检测服务受检者的过程中,求臻医学会尽可能在每一个环节中都利用信息技术和戴尔的IT设备来提升效率。

小而美的OptiPlex小型机,助力实验室工作安全可靠

在实验室中,实验员接收到受检者的样本后,会提取出受检者的核酸,并进行实验,随后将实验数据录入智能化实验室信息管理系统中,实现样本和实验数据的全面信息化。

由于这些数据关系到受检者后续所有的基因检测过程和结果,关系到受检者的身体健康情况,甚至会影响到一个家庭的幸福,容不得出现半点失误,必须确保数据的安全性和准确性。正所谓“工欲善其事必先利其器”,实验员必须使用可靠的IT设备来处理数据。

所以,求臻医学选用了戴尔OptiPlex小型机,它的可靠性高,而且机身小巧,在拥挤的实验室中尤为适用。

求臻医学实验员在实验室里使用戴尔OptiPlex小型机

戴尔提供的解决方案:
Dell OptiPlex小型机
· 可选英特尔第13代酷睿i9处理器,性能提升约27%
· 内置Dell Optimizer智能调优软件,提高工作效率
· 统一芯片组和BIOS,方便管理维护
· 7.9L,机箱精巧,安全易用

稳定强大的PowerEdge服务器,支撑高并发测序数据分析

在测序环节,实验人员会使用高通量测序仪对样本进行测序,并将测序数据上传至戴尔服务器中。生物信息部门会利用AI技术对这些测序数据进行质量控制、比对和变异检测,以更高的精度和更高的效率识别出基因变异情况。

由于求臻医学的业务密集,测序数据量非常庞大,经常会出现大量样本数据并行分析的情况。为了满足数据量大、计算量密集的需求,求臻医学利用多台服务器构建了一个高性能计算集群,以提供超强的算力和高性能的存储,并为此选择了以稳定性和安全性著称的戴尔PowerEdge系列服务器。

求臻医学机房中的戴尔PowerEdge服务器

戴尔提供的解决方案:
Dell PowerEdge系列服务器
· 采用英特尔可扩展处理器,为各种工作负载提供强大算力
· 密集的外形尺寸,提供更高的性能和配置灵活性
· 灵活的容量和性能资源,满足日益增长的数据存储和分析需求

Precision7960高性能塔式工作站,满足高效流畅的研发需求

基于多年积累的医疗健康数据和AI技术,求臻医学陆续自主研发了智能化报告系统、iChosenGPT平台、知识库和知识图谱,以及智能化的受检者服务平台等20多个系统。

其中,智能化报告系统可以调用后台知识库,对生信分析结果数据和智能化实验室信息管理系统的实验数据进行智能分析,自动生成标准化肿瘤基因检测报告;

iChosenGPT平台能够对该报告进行智能化解读,自动生成易懂的解读报告;

知识库和知识图谱不仅能够支持检测报告的生成和解读,还能为iChosenGPT的持续预训练和微调提供基础,使它能够处理医疗健康文本,进行文档对话和图片对话;

求臻医学人工智能部总监徐全使用戴尔显示器查看iChosenGPT测试情况

基于iChosenGPT构建的智能化受检者服务平台则能够为用户提供报告查询、临床试验申请、个性化肿瘤资讯等服务,并配有7*24小时在线的AI客服。

据徐全介绍,这些系统研发的过程需要进行复杂的生物信息学数据分析、处理大量的基因测序数据,还要经常并行多个软件,同时处理多项复杂任务,所以需要IT设备配备大容量内存和存储,具备强大的高性能计算和数据处理能力,以及卓越的图形和图像处理能力。

于是求臻医学采用了戴尔Precision 7960高性能塔式工作站,它可以满足稳定、高效的研发需求,而且还拥有独特的散热设计,可以保障机器流畅地并行多个软件,提高工作效率。

求臻医学技术人员使用戴尔Precision7960工作站进行研发

戴尔提供的解决方案:
Dell Precision 7960 Tower 高性能塔式工作站
· 最多可支持4个300W (NVIDIA RTX 5000 Ada)双宽图形专业显卡,提高工作效率
· 最高可配 56 核英特尔至强W-3400系列处理器,提升数据处理能力
· 4TB DDR5内存,保障运行稳定
· 10个2.5“/3.5”HDD硬盘或8个M.2 NVMe Gen 4驱动器,扩展性强

根据最新预测,2023至2027年将是医疗健康AI快速发展和广泛应用的关键时期。李建基博士表示,在肿瘤伴随诊断领域,AI将成为强有力的辅助工具,能够为研究人员、临床医生和受检者提供更快捷、精确和个性化的专业建议和报告解读,显著提高医疗服务效果和患者满意度。他还强调:“任何优秀的应用都需要可靠的IT基础设施来支撑,而求臻医学的系统都运行在戴尔的IT设备上,为求臻医学提供了强大的后盾,这让求臻医学对未来的发展充满了信心。”

展望未来,求臻医学希望与戴尔继续合作,借助戴尔先进的IT设备,在不断升级迭代的基因检测技术和信息技术的支持下,能够提供从早期筛查到伴随诊断的、全链条的精准诊疗检测服务,使更多肿瘤患者能够受益于这种更加精准、更具有个性化的医疗服务。

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