国人友好期刊+1,中国学者用MR一周发了10篇JAD期刊 | 孟德尔随机化周报(12.29-1.4)

文摘   健康   2025-01-17 23:00   浙江  

孟德尔随机化,Mendelian Randomization,简写为MR,是一种在流行病学领域应用广泛的一 种实验设计方法,利用公开数据库就能轻装上阵写文章,甚至是高质量的论文。


通过PubMed数据库“ Mendelian randomization”检索发现,12.29-1.4共发表145相关主题论文,其中共13医学1区,16篇医学2区文章,部分文章介绍如下。


中国学者:


1.国学者文章介绍(一)

文章题目:肠道微生物组和中风:东亚和欧洲人群的双向孟德尔随机化研究
研究目的:观察性研究表明肠道微生物组参与中风发展。相反,中风可能会破坏肠道微生物组平衡,可能导致全身感染,加剧脑梗塞。然而,因果关系仍然存在争议或未知。为了调查双向因果关系和潜在的种族差异,我们在东亚 (EAS) 和欧洲 (EU) 人群中进行了一项双向双样本孟德尔随机化 (MR) 研究。
研究方法:利用来自 MiBioGen 联盟 (n=18 340, EU) 和 BGI (n=2524, EAS) 的迄今为止最大的肠道微生物组全基因组关联研究 (GWAS) 摘要数据,来自 GIGASTROKE 联盟的中风 GWAS 数据(264 655 EAS 和 1 308 460 EU),我们分别对 EAS 和 EU 人群进行了双向 MR 和敏感性分析。

研究结果: 我们确定了 EAS 中的 85 个肠道微生物组分类群与 EU 中的 64 个肠道微生物组分类群与中风或其亚型之间的名义上显着关联。经过多次测试,我们观察到遗传决定的 Bacteroides pectinophilus 物种相对丰度增加 1 SD 使心源性栓塞性卒中发作的风险降低 28% (OR 0.72 (95% CI 0.62 至 0.84);p=4.22e-5),遗传决定的 Negativicutes 类增加 1 SD 导致 EAS 中小血管卒中的风险增加 0.76%。在 EU 人群和反向 MR 分析中未发现显着的因果关系。

结论:我们的研究揭示了 EAS 和 EU 人群肠道微生物组与中风风险之间的亚型特异性和人群特异性因果关系。已确定的因果关系有望开发新的中风预防策略,需要进一步的机制验证,并且需要临床试验研究。


2.国学者文章介绍(二)

文章题目确定瘢痕疙瘩的潜在药物靶点:一项孟德尔随机化研究
研究目的:瘢痕疙瘩是一种皮肤纤维化疾病,其特征是症状复杂、复发程度不同以及治疗不可避免的副作用。因此,确定他们的药物靶点是必要的。
研究方法:使用来自 deCODE 数据库交叉点的蛋白质进行 2 样本孟德尔随机化分析,并将“药物开发中可成药基因组和对靶标识别和验证的支持”作为暴露变量。结果变量基于最近发表的瘢痕疙瘩 GWAS。采用基于汇总数据的孟德尔随机化和共定位分析来区分多效性和连锁。对候选靶点进行药物靶点分析。通过单细胞 RNA 测序数据、Western Blot 和瘢痕疙瘩免疫荧光染色验证了主要发现。
研究结果:7 种蛋白质被确定为瘢痕疙瘩的潜在药物靶点。在这些蛋白中,Hedgehog 相互作用蛋白、 neurotrimin [NTM] 、 KLKB1 和 CRIPTO 与瘢痕疙瘩呈正相关,而 PLXNC1 、 SCG3 和 PDGFD 呈负相关。结合单细胞 RNA 测序数据,发现 NTM 、 PLXNC1 和 PDGFD 在成纤维细胞中高表达。与正常疤痕相比,NTM 显示瘢痕疙瘩显着增加。根据分析,与正常皮肤相比,观察到瘢痕疙瘩中 NTM 的蛋白质表达水平更高。
结论:鉴定出的蛋白质可能是治疗瘢痕疙瘩的有吸引力的药物靶点,特别强调 NTM。


3.国学者文章介绍(三)

文章题目:精神疾病与肠易激综合征之间的关联:一项双向孟德尔随机化研究
研究目的: 先前的研究表明,肠易激综合征 (IBS) 与精神疾病密切相关。然而,目前尚不清楚这种关联是因果关系、伴随关系还是偶然关系。因此,我们进行了孟德尔随机化 (MR) 分析,以评估几种精神疾病对 IBS 的因果影响。
研究方法: 全基因组关联研究 (GWAS) 的汇总数据主要来自精神病基因组学联盟 (PGC) 关于欧洲血统个体的个体和最近关于 IBS 的 GWAS。我们使用了三种 MR 方法,即逆方差加权 (IVW) 、加权中位数 (WM) 和 MR-Egger 回归 (MR-Egger)。此外,另外两个指标,即 MR-IVW Cochran 的 Q 统计量和 MR-Egger 截距,分别用于评估异质性和检测方向水平多效性。
研究结果 : 双相情感障碍 (81.18 %,95 % CI = 73.18-148.18 %)、精神分裂症 (33.88 %,95 % CI = 33.57-38.19 %) 和恐慌症 (30.66 %,95 % CI = 20.74-40.58 %)的遗传性很高。对于其他疾病,重度抑郁症 (MDD) (0.67 %,95 % CI = 0.61-0.73 %)、焦虑障碍 (7.63 %,95 % CI = 1.67-13.59 %)、PTSD (0.96 %,95 % CI = 0.12-1.8 %) 和 IBS (2.44 %,95 % CI = 2.13-2.75 %)。我们还观察到,根据 MR-IVW,精神分裂症对 IBS 有显着的因果影响。值得注意的是,MDD 和精神分裂症的遗传仪器的个体因果估计是异质性的,但没有观察到多效性效应。
结论: 我们的分析揭示了 MDD 和精神分裂症对 IBS 的因果影响,这一问题已经争论了几十年,并且还表明 IBS 对 MDD 有因果影响。


4.国学者文章介绍(四)

文章题目:社会经济地位、个体行为和焦虑症风险:一项孟德尔随机化研究
研究目的: 社会经济地位与个人行为 (SES/IB) 与焦虑症之间的关联引起了越来越多的关注,但 SES/IB 对焦虑症的影响仍不清楚。因此,我们采用孟德尔随机化 (MR) 设计来评估 SES/IB 与焦虑障碍之间的因果关系。
研究方法: 我们进行了一项双样本 MR 研究,以评估 SES 和 IB (吸烟行为、饮酒行为、睡眠行为、习惯性身体活动、休闲久坐行为和生殖行为) 对焦虑症的因果影响。采取了一系列过滤步骤来选择与每个性状紧密相关的合格遗传工具。采用逆方差加权进行初步分析,采用多种方法进行敏感性检验。
研究结果经过 Bonferroni 校正和严格的质量控制,我们发现受教育程度 (比值比 [OR]:0.75;95% 置信区间 [CI]:0.69-0.81;P = 9.21E-12),每周饮酒量(OR:1.62;95 % CI:1.33-1.97;P = 1.80E-06)、失眠 (OR:1.68;95 % CI:1.43-1.97;P = 1.45E-10),首次生育年龄 (OR:0.59;95 % CI:0.50-0.68;P = 1.31E-11)和性伴侣数量 (OR:2.19;95 % CI:1.71-2.80;P = 6.64E-10) 与焦虑障碍有因果关系。
结论:MR 研究提供了强有力的证据表明,某些因素会影响焦虑症。


5.国学者文章介绍(五)

文章题目:线粒体功能与精神疾病之间的因果关系:来自双向双样本孟德尔随机化研究的见解
研究目的: 先前的观察性研究表明,线粒体功能与精神疾病之间似乎存在密切关联,但是否存在因果关系尚不清楚。
研究方法: 我们从公开可用的全基因组关联研究中提取了 67 种线粒体相关蛋白和 10 种精神疾病的遗传仪器,并采用 5 种不同的 MR 方法和错误发现率校正来检测它们之间的因果关系。此外,我们进行了一系列敏感性测试和额外的模型分析,以确保结果的稳健性。对于潜在的因果关系,我们进一步进行了反向 MR 分析以评估反向因果关系的影响。
研究结果: 我们总共确定了 2 个重要的因果关联和 24 个提示性的因果关联。具体来说,发现苯丙氨酸-tRNA 连接酶会增加患阿尔茨海默病的风险,而线粒体谷氨酸载体 2 可降低自闭症谱系障碍的风险。此外,没有证据表明存在显著的多效性、异质性或反向因果关系。
结论:本研究为线粒体与精神疾病之间的关系以及精神疾病的发病机制和治疗策略提供了新的见解。


6.国学者文章介绍(六)

文章题目:精神障碍与脑血管疾病之间的因果关系:来自孟德尔随机化研究的证据
研究目的:观察性研究表明,精神障碍和脑血管疾病 (CVD) 可能是彼此的危险因素,但仍然缺乏因果关系的遗传证据。我们使用孟德尔随机化 (MR) 研究从遗传角度探讨了精神障碍与 CVD 之间的因果关系。
研究方法:基于公开的全基因组关联研究 (GWAS) 数据,使用双样本双向 MR 分析,探讨重度抑郁症 (MDD)、焦虑、注意力缺陷/多动障碍 (ADHD)、双相情感障碍和精神分裂症五种精神障碍与 CVD 之间的因果关系。我们采用与精神障碍和 CVDs 密切相关的单核苷酸多态性 (SNP) 作为工具变量 (IVs),采用 MR-IVW 、MR-Egger 法、MR-PRESSO 检验、留一法分析和漏斗图进行敏感性分析。我们进一步进行了一项荟萃分析,以总结目前可用的 MR 分析。
研究结果:前向 MR 研究结果显示,ADHD 和 AS(任何中风)之间存在显着的因果关系 (p(AS)= 0.001,或 (95% CI) =1.118 (1.047-1.195)),任何缺血性卒中 (AIS) (p(美国证券及安全局)= 0.004,或 (95% CI) =1.118(1.035-1.206)) 和大动脉卒中 (LAS) (p(洛杉矶)= 0.026,或 (95% CI):1.206(1.023-1.422))。在敏感性分析中未发现异质性、多效性和异常值。反向 MR 研究显示 IA(颅内动脉瘤)(p(IA)= 0.033,或 (95%CI) = 1.123(1.009-1.249)) 和 UIA(未破裂颅内动脉瘤)(p(国际航空公司)= 0.015,或 (95% CI) =1.040(1.008-1.074)) 是精神分裂症的危险因素。敏感性分析显示没有多效性,但存在异质性。排除异常值后,MR 分析显示 IA 和 UIA 仍然是精神分裂症的危险因素。我们的荟萃分析发现 ADHD 和 LAS (OR (95%CI) =1.18 (1.06-1.32),p = 0.003)、IA 和精神分裂症 (OR (95%CI) =1.05 (1.02-1.08),p = 0.002) 以及 UIA 和精神分裂症 (OR (95%CI) =1.03 (1.01-1.06),p = 0.010)之间的因果关系具有统计学意义。
结论:MR 研究和荟萃分析表明,遗传预测的 ADHD 是 LAS 的危险因素,IA 和 UIA 会增加精神分裂症的风险。该结果对未来可行的预防策略的制定具有重要意义。


7.国学者文章介绍(七)

文章题目:结合单细胞 RNA 测序和孟德尔随机化,以确定与椎间盘退化中坏死性细胞凋亡相关的生物标志物
研究目的: 椎间盘退化 (IDD) 与背痛有关;背痛是导致生活质量差的全球性因素,而坏死性凋亡具有坏死性凋亡和细胞凋亡的特征,然而,它在 IDD 中的作用仍不清楚。因此,本研究的目的是确定与 IDD 坏死性凋亡相关的生物标志物。 探讨与 IDD 坏死性凋亡相关的生物标志物,揭示 IDD 的发病机制,并为该病的诊断和治疗提供新的方向。
研究方法: 回顾性队列研究。我们的研究采用 scRNA-seq 结合 MR 分析来研究坏死性凋亡与 IDD 之间的因果关系,为揭示这种情况的复杂致病机制奠定了基础。GSE205535,在单细胞数据集中执行数据质量控制和归一化。然后,通过标记基因的细胞注释获得不同的细胞类型。随后,采用卡方检验评估 IDD 和对照之间不同细胞类型的分布差异,以筛选关键细胞。应用 AUCell 计算所有细胞类型的坏死性凋亡相关基因 (NRGs) 评分,进一步根据不同细胞类型的中位 AUC 评分将关键细胞分为高 NRGs 组和低 NRGs 组。然后,筛选 2 个评分组中的差异表达基因 (DEGs)。然后,通过单因素和多因素孟德尔随机化 (MR) 分析选择与 IDD 有因果关系的基因作为生物标志物。最后,分别分析不同细胞类型中生物标志物的表达和伪时间分析。
研究结果: 在 GSE205535 中,通过 UMAP 聚类分析鉴定的 16 个不同细胞群使用制造者基因进一步注释为 8 种细胞类型。之后,在高 NRGs 组和低 NRGs 组之间筛选出 53 例 DEGs。此外,通过单因素 MR 分析获得 9 个与 IDD 有因果关系的基因,进一步的多因素 MR 分析证明 NT5E 和 TMEM158 与 IDD 有直接的因果关系,作为本研究的生物标志物。本研究不仅发现 IDD 组 NT5E 和 TMEM158 表达水平较高,还发现纤维软骨细胞和炎性软骨细胞分别是 NT5E 和 TMEM158 的关键细胞。最后,生物标志物在准时间序列中具有相同的表达趋势,均由高到低再增加。
结论:NT5E 和 TMEM158 作为坏死性凋亡性凋亡性 IDD 的生物标志物,与 IDD 有因果关系。 将软骨细胞理解为关键细胞为更深入阐明 IDD 的发病机制、改进诊断方法和开发更有效的治疗方法提供了新的视角。这些发现有望为临床诊断和治疗提供更准确和个性化的方法,从而改善 IDD 患者的预后和生活质量。


8.国学者文章介绍(八)

文章题目:焦虑障碍、抑郁和双相情感障碍与自身免疫性甲状腺炎的相关性:一项双向双样本孟德尔随机研究
研究目的:焦虑障碍、抑郁症和双相情感障碍是常见的精神疾病,它们与自身免疫性甲状腺炎 (AIT) 的相关性一直备受关注。本研究旨在探讨这些精神疾病与 AIT 之间的潜在因果关系。
研究方法: 我们使用来自大规模全基因组关联研究的公开汇总统计数据来选择、质量控制和与焦虑症、抑郁症、双相情感障碍和 AIT 相关的聚类遗传变异位点作为工具变量 (IV)。孟德尔随机化 (MR) 研究主要使用逆方差加权 (IVW) 结合 MR-egger 回归和加权中位数估计 (WME) 来估计精神障碍与 AIT 之间的双向因果关系。此外,我们进行了异质性和多变量测试以验证 IVW 的有效性。
研究结果: 双样本双向 MR 分析揭示了抑郁症和 AIT 之间的正因果关系。IVW (OR 1.614,95 % CI 1.104-2.358,P = 0.013) 和 WME (OR 2.314,95 % CI 1.315-4.074,P = 0.004) 的正向 MR 分析表明,抑郁症可能会增加 AIT 发展的风险,而我们的调查并未发现焦虑症、双相情感障碍和 AIT 之间的因果关系。反向 MR 分析结果显示,AIT 与焦虑障碍、抑郁和双相情感障碍之间没有显着的因果关系 (P > 0.05)。
结论:正向 MR 分析的结果表明,抑郁症与 AIT 风险之间存在正相关,而根据当前数据,不支持焦虑障碍或双相情感障碍与 AIT 风险之间存在因果关系。随后的研究对于阐明这些关联的生物学机制和潜在混杂因素至关重要。


9.国学者文章介绍(九)

文章题目:精神疾病对神经胶质瘤风险的影响:孟德尔随机化和生物学注释
研究目的: 关于某些精神疾病与神经胶质瘤之间关系的相互矛盾的结果已在以前的研究中报道。此外,人们对精神症状和神经胶质瘤之间的常见致病机制知之甚少。本研究旨在找出神经胶质瘤的精神障碍相关病因并解释潜在的生物学机制。
研究方法: 一组与八种精神疾病 (ADHD 、 SCZ 、 失眠、 NEU、 MDD、MI 、 BIP 和 SWB) 显著相关的 SNP 被确定为暴露相关的遗传工具。总结 神经胶质瘤的 GWAS 数据来自八个独立的数据集。两个样本孟德尔随机化研究由 IVW、RAPS、MR.Corr 和 BWMR 方法。本研究纳入了神经胶质瘤相关 CGGA 队列和 Rembrandt 队列。进行 ssGSEA 、 方差表达和 KEGG 分析神经胶质瘤患者精神疾病相关基因表达谱和相关功能富集。
研究结果:ADHD 对所有神经胶质瘤均具有提示性风险影响 (OR = 1.15,95%CI = 1.01--1.29,P = 0.028),对非 GBM 神经胶质瘤有显著的因果影响 (OR = 1.33,95%CI = 1.12--1.58,P = 0.001)。同样,SCZ 与所有神经胶质瘤均呈因果关系 (OR = 1.09,95%CI = 1.04-1.14,P = 3.47 × 10-4)和非 GBM 神经胶质瘤 (OR = 1.14,95%CI = 1.08-1.21,P = 7.37 × 10-6).此外,失眠与非 GBM 胶质瘤的风险相关 (OR = 1.49,95%CI = 1.03-2.17,P = 0.036)。胶质瘤患者 ADHD/SCZ/失眠相关 DEGs 富含神经递质信号通路、免疫反应、粘附、侵袭和转移,调节干细胞的多能性、聚糖、脂质和氨基酸的代谢。
结论:本研究提供的遗传证据表明 ADHD 、 SCZ 和失眠是神经胶质瘤的原因以及 ADHD / 失眠 / SCZ 与神经胶质瘤之间的常见致病过程。


10.国学者文章介绍(十)

文章题目:多种血清代谢物对情绪不稳定性的因果关系:一项双样本孟德尔随机化研究
研究目的: 情绪不稳定 (EL) - 一种以快速情绪转变为特征的跨诊断特征 - 对抑郁症、双相情感障碍和精神分裂症等精神疾病的功能障碍有重大影响。尽管其临床意义,但其病因仍然知之甚少,阻碍了有效的筛查和干预。越来越多的证据表明,代谢改变可能在精神疾病的病理生理学中起关键作用。
研究方法: 全面的孟德尔随机化 (MR) 设计结合了来自血清代谢物 (8299 名欧洲参与者) 和 EL (3268 名欧洲样本) 的广泛全基因组关联研究 (GWAS) 的摘要数据,以研究遗传确定的代谢物水平与 EL 之间的因果关系。工具变量、异质性、水平多效性和方向性的假设与敏感性分析一起评估。
研究结果: 在分析的 1400 种代谢物和比率中,根据逆方差加权法,30 种代谢物表现出与 EL 风险增加的因果关系。敏感性分析确定了三种潜在的致病代谢物:氢化肉桂酸盐 (OR:1.277, CI:1.071-1.522, P = 0.0063),它与风险增加相关,而糖石胆酸盐 (OR:0.779,CI:0.667-0.911,P = 0.0017) 和 3β-羟基-5-胆汁酸 (OR:0.857,CI:0.756-0.971,P = 0.015) 与风险降低相关。
结论: 这项 MR 研究支持氢化肉桂酸、糖石胆酸盐和 3β-羟基-5-胆烯酸水平与 EL 发病率之间的因果关系,为 EL 在精神疾病中提供潜在的代谢生物标志物和治疗靶点。


11.国学者文章介绍(十一)

文章题目:吸烟、遗传易感性和更年期提前:揭示生物学机制和潜在的治疗靶点
研究目的:探讨吸烟、遗传易感性和早期更年期 (EM) 之间的关联,并阐明这种关系的潜在机制。
研究方法: 一项观察性和转录组范围的关联分析 (TWAS) 研究。英国生物样本库和公共摘要统计数据。人群:139 869 名女性,拥有完整的基线和更年期数据,无妇科手术史。开发了调整后的改良泊松回归模型以确定吸烟和遗传风险对 EM 的影响。TWAS 用于识别吸烟和 EM 之间的基因表达,并使用孟德尔随机化 (MR) 推断因果关系。富集分析探讨了转录因子、 microRNAs 和潜在治疗靶点的调节网络。使用药物-基因相互作用分析预测小分子药物。EM 患病率和常见基因表达模式。
研究结果:吸烟超过 30 包年的女性 EM 风险高出约 1.5 倍,RR 为 1.39 (95% CI,1.23-1.56)、1.45 (1.33-1.59) 和 1.45 (1.36-1.55) 在低、中和高遗传风险组中。TWAS 鉴定了 IMMP2L 、 BMPR2 和 HMGN1 等枢纽基因。MR 证实每日吸烟是更年期早期的致病因素。确定了几个潜在的治疗靶点 (例如,SP600125、INCB18424 和 ruxolitinib)。
结论:减少吸烟显着降低了 EM 的风险。确定的枢纽基因和治疗靶点为减轻吸烟的有害影响提供了新的途径。


12.国学者文章介绍(十二)

文章题目:肠道菌群、代谢产物、免疫细胞、脂质体和炎症蛋白对神经性厌食症的因果关系:中介联合多组学孟德尔随机化分析
研究目的:神经性厌食症 (AN) 是一种受环境和遗传因素影响的重要心理障碍。新兴研究强调了肠道微生物组在不同心理健康状况发展中的关键作用。本研究旨在通过中介和多组学孟德尔随机化 (MR) 分析,探讨肠道微生物组、代谢物、免疫细胞、脂质和炎症蛋白对神经性厌食症风险的因果效应和相互作用。
研究方法: 本研究使用了 AN (N = 402,625) 的 FinnGen 全基因组关联研究 (GWAS) 的数据,并整合了 473 个肠道微生物群 (N = 5959)、233 种代谢物 (N = 136,016)、731 个免疫细胞 (N = 3757)、179 种脂质 (N = 7174) 和 91 种炎症蛋白 (N = 14,824) 的 GWAS 数据。本研究使用单变量 MR (UVMR) 、中介 MR 分析和敏感性分析来评估这些生物标志物与 AN 之间的潜在因果关系。
研究结果: 厚壁菌门 E (OR:0.294, 95 % CI:0.107-0.806, P = 0.017), RUG147 (OR:0.386, 95 % CI:0.151-0.990, P = 0.048), CAG-977 (OR:0.562, 95 % CI:0.378-0.837, P = 0.005), 脱硫杆菌 A (OR:0.651, 95 % CI:0.466-0.909, P = 0.012), CAG-269 sp002372935 (OR:0.673, 95 % CI:0.483-0.937,P = 0.019)、克雷伯氏菌(OR:0.0.) 684, 95 % CI:0.566-0.827, P = 0.00009), 脱硫纤维菌 (OR:0.706, 95 % CI:0.538-0.926, P = 0.012), 肺炎克雷伯菌 (OR:0.737, 95 % CI:0.600-0.906, P = 0.004), 脱硫纤维菌 (OR:0.786, 95 % CI:0.631-0.979, P = 0.031), CAG-776 (OR:0.787, 95 % CI:0.632-0.980, P = 0.032), 脱硫纤维菌科 (OR:0.788, 95 % CI:0.635-0.978, P = 0.030)。13 个肠道菌群是 AN 的危险因素,包括副衣原体 (OR:3. 134,95%CI:1.185-8.287,P = 0.021)、Paenibacillus J (OR:2.366,95%CI:1.305-4.29, P = 0.005), 吉利菌属 (OR:1.947,95%CI:1.135-3.339, P = 0.016), UBA1191 (OR:1.856,95%CI:1.221-2.822, P = 0.004), UBA7703 (OR:1.843,95%CI:1.032-3.289, P = 0.039), 粪菌属 sp002161355 (OR:1.788,95%CI:1.114-2.870, P = 0.016), 伊格纳瓦约翰逊氏菌 (OR:1.742,95%CI:1.031-2.944,P = 0.0.038)、金黄色葡萄球菌(OR:1.614,95%CI:1.007-2.588,P = 0.047)、昏迷菌(OR:1.522,95%CI:1.004-2.307,P = 0.048)、瘤胃球菌 D(OR:1.24,95%CI:1.050-1.464,P = 0.011)、CAG-349(OR:1.198,95%CI:1.048-1.370,P = 0.008)、瘤胃球菌 D 双环(OR:1.175,95%CI:1.001-1.379,P = 0.048)、CAG-177(OR:1.272,95%CI:1.077-1.503,P = 0.005)。反向 MR 分析显示,AN 对 18 种肠道微生物群的因果影响,但程度较小。12 代谢物对 AN 有因果影响。有 7 个保护因素,包括葡萄糖水平 (OR:0.700, 95%CI:0.550-0.893, P = 0.004), 异亮氨酸水平 (OR:0.769, 95% CI:0.602-0.983, P = 0.036), 大 VLDL 中的磷脂 (OR:0.856, 95%CI:0.736-0.996, P = 0.044), 大 VLDL 中的总脂质 (OR:0.860, 95%CI:0.740-0.999, P = 0.049), 小 VLDL 中的总脂质 (OR:0.863, 95%CI:0.751-0.992,P = 0.038),小 VLDL 中的游离胆固醇(OR:0.86,95%CI:0.752-0.996,P = 0.044)和中等 VLDL 中的游离胆固醇(OR:0.866,95%CI:0.752-0.998,P = 0.047)。有 5 个危险因素,包括估计的不饱和度(OR:1.174,95%CI:1.009-1.367,P = 0.039)、小 VLDL 中的游离胆固醇与总脂质比值(OR:1.199,95%CI:1.017-1.414,P = 0.031)、小 VLDL 中的磷脂与总脂质比值(OR:1.216,95%CI:1.008-1.467,P = 0.041)、小 HDL 中的总胆固醇水平(OR:1.241,P = 0.041) 95% CI:1.008-1.530,P = 0.042),以及培养基 VLDL 中的磷脂与总脂质比率 (OR:1.280,95%CI:1.055-1.553,P = 0.012)。反向 MR 分析显示 AN 对 15 种代谢物有致病影响。介导分析显示,估计的不饱和度介导了肺炎克雷伯菌对 AN 影响的 0.69 %。小 VLDL 中的总脂质介导了 CAG-177 对 AN 影响的 0.358 %,介导比例为 1.490 %。小 VLDL 中估计的不饱和度和总脂质的中介比例相对较小。36 个免疫细胞对 AN 有致病作用。有 7 个保护因素,包括记忆转换 B 细胞 %B 细胞 (OR:0.892,95%CI:0.801-0.994, P = 0.038), CD127-CD8+ T 细胞绝对计数 (OR:0.888,95%CI:0.789-1.000, P = 0.049), IgD + CD24- B 细胞 (OR:0.917,95%CI:0.862-0.975, P = 0.006), HVEM+ T cell (OR:0.945,95%CI:0.945% CI:0.0. 894-0.999,P = 0.045),CD40 + CD14 + CD16- 单核细胞(OR:0.937,95%CI:0.882-0.996,P = 0.038),CD64 + CD14 + CD16- 单核细胞(OR:0.966,95%CI:0.939-0.993,P = 0.016),CD8+ 自然杀伤 T 细胞(OR:0.911,95%CI:0.836-0.992,P = 0.032),HLA-DR+ T 细胞(OR:0.921,95%CI:0.866-0.980,P = 0.010),CD28-CD8+ T 细胞(OR:0.886,95%CI:0.792-0.991,P = 0.034)。有 26 个风险因素。反向 MR 分析显示,AN 对 31 个免疫细胞有致病作用。AN 增加五种免疫细胞的表达水平,包括 CD40 + CD14-CD16+ 单核细胞(OR:1.087,95%CI:1.004-1.177,P = 0.041)、PDL-1+ CD14-CD16+ 单核细胞(OR:1.082,95%CI:1.002-1.168,P = 0.046)、CD45+ CD33dim HLA-DR+ 细胞(OR:1.145,95%CI:1.019-1.287,P = 0.023)、CD45+ 嗜碱性粒细胞(OR:1.164,95%CI:1.036-1.307,P = 0.011)、CD8+ 自然杀伤 T 细胞(OR:1.102,95%CI:1.015-1.196,P = 0.020),并且还降低了 26 个免疫细胞的表达水平。6 种脂质体对 AN 表现出保护作用,包括磷脂酰胆碱 (18:0_20:3) 水平 (OR:0.852, 95%CI:0.740-0.981, P = 0.026), 磷脂酰胆碱 (O-18:2_18:1) 水平 (OR:0.800, 95%CI:0.672-0.952, P = 0.012), 磷脂酰肌醇 (18:0_18:1) 水平 (OR:0.873, 95% CI:0.773-0.986, P = 0.029), 磷脂酰肌醇 (18:1_18:2) 水平 (OR:0.844, 95% CI:0.734-0.971, P = 0.018), 鞘磷脂 (d38:1) 水平 (OR:0.903,95%CI:0.820-0.995,P = 0.039)和三酰甘油 (56:4) 水平 (OR:0.786,95%CI:0.660-0.936,P = 0.007)。有 3 个危险因素,包括甘油二酯 (16:1_18:1) 水平 (OR:1.208, 95%CI:1.040-1.404, P = 0.014), 磷脂酰胆碱 (18:1_18:3) 水平 (OR:1.237, 95% CI:1.003-1.526, P = 0.047) 和磷脂酰肌醇 (16:0_20:4) 水平 (OR:1.148, 95%CI:1.003-1.314, P = 0.045)。反向 MR 分析显示,AN 对 3 种磷脂酰胆碱 (15:0_18:2) 水平 (OR:1.075, 95%CI:1.001-1.154, P = 0.048)、磷脂酰胆碱 (O-16:2_18:0) 水平 (OR:1.078, 95%CI:1.002-1.159, P = 0.043) 和三酰甘油 (51:1) 水平 (OR:0.919, 95%CI:0.850-0.994, P = 0.035) 有因果关系。6 种炎症蛋白对 AN 有因果影响,保护因素包括神经胶质细胞系衍生的神经营养因子水平 (OR:0.822,95%CI:0.692-0.978, P = 0.027) 和白细胞介素-15 受体亚基 α 水平 (OR:0.886,95%CI:0.789-0.995,P = 0.041) 和危险因素,包括 CC 基序趋化因子 4 水平 (OR:1.126,95% CI:1.011-1.254,P = 0.031)、白细胞介素 12 亚基 β 水平 (OR:1.135,95%CI:1.033-1.248,P = 0.008),单核细胞趋化蛋白-1 水平 (OR:1.152,95%CI:1.010-1.314,P = 0.035) 和磺基转移酶 1A1 水平 (OR:1.166,95%CI:1.006-1.351,P = 0.042)。反向 MR 分析显示 AN 对转化生长因子-α 有因果效应 (OR:1.054,95%CI:1.010-1.101,P = 0.016)。
结论:本研究使用大规模和新颖的 GWAS 数据,首次通过中介分析和多组学 MR 分析揭示了肠道菌群、代谢物、免疫细胞、脂质和炎症蛋白在 AN 发病机制中的作用。这些发现为进一步的预防和治疗策略提供了新的生物标志物和靶点。


13.国学者文章介绍(十三)

文章题目:维生素 C 和自杀意念:一项横断面和孟德尔随机化研究
研究目的:研究表明,自杀未遂史与抗氧化维生素水平低有关。然而,维生素 C 与自杀意念之间的具体关系仍然知之甚少。本研究的目的是调查维生素 C 对自杀意念发展的影响,并使用孟德尔随机化 (MR) 进一步探索因果关系。
研究方法: 使用 2005-2018 年全国健康与营养检查调查 (NHANES) 数据集,对 28,623 名 20 岁及以上的参与者进行了全面的横断面分层调查。使用患者健康问卷 9 (PHQ-9) 项目的第 9 项评估自杀意念。通过加权多元线性回归、平滑曲线拟合、分层分析和交互测试揭示维生素 C 与自杀意念之间的关系。为了确定因果关系,对维生素 C 和自杀意念进行了 MR。
研究结果:  在横断面研究中,所有模型都显示维生素 C 与自杀意念之间存在负相关,在完全调整的模型中,维生素 C 每增加一个单位,自杀意念的风险就会降低 37%。亚组分析的结果显示,维生素 C 与自杀意念之间的关联在性别、年龄、教育程度、吸烟状况和婚姻状况方面是稳定的。在 MR 研究中,我们的双变量模型显示维生素 C 与自杀意念的发展之间没有显着的因果关系。
结论: 膳食维生素 C 摄入量与自杀意念的发展呈负相关。然而,遗传证据不支持这些关联的因果关系。


14.国学者文章介绍(十四)

文章题目:心房颤动与窦房结功能障碍之间的遗传基础和因果关系:来自综合遗传分析的证据
研究目的:心房颤动 (AF) 和窦房结功能障碍 (SND) 在临床上通常一起观察到。然而,人们对两者之间的遗传背景和因果关系知之甚少。
研究方法: 首先,我们使用 LDSC 和 HESS 研究了 AF 和 SND 之间的全局和局部遗传相关性。然后,我们通过两个互补的交叉性状荟萃分析确定了 AF 和 SND 之间共享的“新 SNP”,并绘制了这些 SNP 背后的“多效性基因”,并通过共定位分析进行了验证。此外,我们使用 LDSC-SEG 和 MAGMA 探索了特定组织中 SNP 的遗传富集程度,并使用基于汇总数据的孟德尔随机化 (SMR) 确定了组织中的潜在功能基因。最后,采用双样本孟德尔随机化 (TSMR) 和多变量孟德尔随机化 (MVMR) 探讨 AF 和 SND 之间的因果关系。
研究结果:全局和局部遗传相关性分析均显示 AF 和 SND 之间存在高度的正遗传相关性。HESS 鉴定出 9 个共享位点,其中 chr4 (q25-q26) 和 chr11 (p11.12-q11) 突出。交叉性状荟萃分析和共定位分析确定 ENPEP 和 PITX2 为新的多效性基因。MAGMA 揭示了“心脏左心室”和“心脏心耳”组织中 AF 和 SND SNP 的遗传富集,其中 CEP68 和 BEST3 通过 SMR 被鉴定为潜在的功能基因。MR 分析表明,即使在调整了混杂因素后,AF 也会增加 SND 的风险。
结论:  本研究为与 AF 相关的 SND 风险增加提供了遗传证据,确定了多个共享风险位点和富集组织,并发现了 2 个新的多效性基因和 2 个新的功能基因。


15.国学者文章介绍(十五)

文章题目:无肾病危重老年患者血尿素氮与谵妄的相关性:一项回顾性研究和孟德尔随机化分析
研究目的:本研究调查了血尿素氮 (BUN) 水平与无肾病的危重老年患者谵妄风险之间的关联。
研究方法: 使用来自 MIMIC-IV 数据库的数据进行回顾性分析。通过限制性三次样条法 (RCS) 方法说明了 BUN 与谵妄风险之间的关系。按 BUN 水平对患者进行分层,并使用 logistic 回归、亚组分析和敏感性分析检查谵妄发生率。采用孟德尔随机化 (MR) 来探索潜在的因果关系。
研究结果:最大 BUN 水平与谵妄几率表现出最强的非线性正相关。与 Q1 组相比,Q3 (23-31 mg/dL) 和 Q4 (> 31 mg/dL) 组始终显示发生谵妄的几率增加。亚组分析发现 BUN 和咪达唑仑之间存在显着相互作用,这种关联仅在未暴露于咪达唑仑的患者中明显。在调整基线特征后,发现 BUN 水平超过 23 mg/dL 的患者谵妄的比值比在 1.35 至 1.39 之间。然而,MR 分析未揭示任何显着的因果关系 (均 p > 0.05)。
结论: 总之,BUN 升高可能是无肾功能不全的危重老年患者谵妄的危险因素,这种潜在联系可能受到咪达唑仑暴露的调节。


16.国学者文章介绍(十六)

文章题目:综合孟德尔随机化和单细胞转录组学分析确定癫痫的关键血液生物标志物和潜在机制
研究目的:癫痫具有遗传易感性,但癫痫的致病因素和免疫环境动力学尚不完全清楚。
研究方法: 我们分析了癫痫患者的外周血样本,使用 eQTLGen 和全基因组关联研究,通过孟德尔随机化鉴定与癫痫风险相关的关键基因。使用 CIBERSORT 探索癫痫外周免疫环境的组成。建立了癫痫小鼠模型,通过单细胞分析验证关键基因在转录组和蛋白质组水平的表达。验证了相关途径。最后,我们开发了癫痫患者抗癫痫药物反应的预测模型。
研究结果: 我们发现 CDC25B 、 DNMT1 、 GZMA 、 MTX1 和 SSH2 表达降低癫痫风险,而 FGD3 、 RAF1 和 SH3BP5L 表达增加癫痫风险。癫痫患者表现出外周免疫特征改变,尤其是活化肥大细胞增加,CD4 记忆活化 T 细胞和 γδ T 细胞减少。8 个基因与这种免疫环境显著相关。在动物模型中,FGD3 、 SSH2 和 DNMT1 在海马 mRNA 和蛋白水平上均上调。FGD3 和 SSH2 在小胶质细胞中特异性升高,主要与肌动蛋白调节有关。经过训练的预测模型部署在在线平台上。
结论:本研究阐明了与癫痫相关的关键基因,描绘了癫痫免疫景观,并强调了这些领域之间的相互作用,为潜在的癫痫机制和治疗提供了见解。


17.国学者文章介绍(十七)

文章题目:建立稳健的三角测量框架以探索听力损失与帕金森病之间的关系
研究目的:听力损失 (HL) 和帕金森病 (PD) 之间的关系尚不清楚。
研究方法: 使用来自英国生物样本库和最大的全基因组关联研究的个体水平和摘要水平数据,我们通过观察性、孟德尔随机化和遗传多效性分析来检查这种联系。在 158,229 名参与者中,PD 风险随着 HL 的严重程度而增加,尤其是在老年人和男性中,助听器显著降低了男性的 PD 风险。尽管我们的结果不支持因果关系,但遗传相关性分析表明局部遗传重叠 (17q21.31)。
研究结果: 我们鉴定了 1545 个 SNP 和 63 个对 HL 和 PD 具有多效性作用的基因,包括 6 个位点的 79 个新 SNP,其中 3 个表现出很强的共定位。这些基因座在脑、心脏、肝脏和胰腺等关键组织中富集,与二氢硫辛酰脱氢酶复合物通路有关,并被华法林和 Phenprocoumon 等药物靶向。
结论:总体而言,本研究揭示了连接 HL 和 PD 的风险关联、遗传基础和多效性位点。


外国学者

1.国学者文章介绍(一)

文章题目:遗传分析指出,免疫相关途径的改变是精神疾病与 COVID-19 之间关联的基础
研究内容: 目前的文献表明,患有精神疾病的人感染 COVID-19 的风险更高,并且该疾病的预后更差。
研究方法:我们旨在研究七种精神疾病以及一般精神病理学因素 (P 因子) 对这些关联的遗传贡献,并使用统计遗传技术确定这些是独特的还是在精神疾病中共享的。
研究结果:使用最大的可用全基因组关联研究 (GWAS),我们发现抑郁症、 ADHD 、 PTSD 和 P 因子与 COVID-19 感染和住院之间以及焦虑和 COVID-19 住院之间存在显着的遗传重叠。我们使用成对 GWAS 在细粒度尺度上检查这种重叠,并确定了几种精神疾病、P 因子和 COVID-19 之间共享的基因组特定区域。这些基因组区域中基于基因的分析表明可能与免疫相关途径有关,例如甲状腺稳态、炎症和应激反应。最后,我们使用孟德尔随机化和潜在因果变量方法展示了抑郁症、 ADHD、PTSD 和 P 因子与较高的 COVID-19 感染和住院率之间存在因果关系的初步证据。
研究结论:我们的结果支持这样一个假设,即精神疾病与 COVID-19 风险之间的关系可能是由于免疫相关途径的共同改变,而不仅仅是环境因素的结果,从而阐明了潜在可行的治疗靶点。


2.国学者文章介绍(二)


文章题目:抑制一氧化氮合酶将颈动脉闭塞介导的良性少尿转化为新发大脑梗死
研究内容: 目前尚不清楚为什么单侧近端颈动脉闭塞 (UCAO) 会导致小鼠良性少尿,但会导致人类的各种结局 (无症状至死亡)。我们假设一氧化氮合酶 (NOS) 的抑制既将 UCAO 介导的少尿转化为完全梗死,又扩大了先前存在的梗死
研究方法:使用 900 只小鼠,我们 i) 研究了 UCAO 有/没有腹膜内给药 NOS 抑制剂 (NOSi) N 的中风相关影响ω-硝基-L-精氨酸甲酯(L-NAME,400 mg/kg);ii) 检查了 NO 供体 molsidomine (200 mg/kg 在 30 分钟内) 的救援效果;iii) 测试抗血小板药物的影响。为了证实临床前发现,我们进行了临床研究。
研究结果:单独使用 UCAO 分别在 C57BL/6 和 BALB/c 小鼠中很少 (~2%) 或偶尔 (~14%) 诱导梗死。然而,L-NAME + UCAO 诱导了 ~75% 的 C57BL/6 和 BALB/c 小鼠的大动脉梗死。6 小时激光散斑成像检测到 24 小时内 ~40% 的 C57BL/6 和 BALB/c 小鼠出现弥散性缺血 (相比之下,没有)。与活体显微镜检查显示的血管收缩/微血栓形成一致,molsidomine 和内皮 NOS 激活抗血小板西洛他唑减轻/防止进展为梗死。此外,没有 L-NAME 的 UCAO 导致 ~22% C57BL/6 和 ~31% ApoE 基因敲除小鼠发生高血糖/高脂血症,这与对称二甲基精氨酸 (SDMA,一种内源性 NOSi) 水平增加 ~60% 相关。此外,在 438 例 UCAO 中风患者中,葡萄糖和胆固醇水平升高与显着增加的梗死体积相关。最后,孟德尔随机化确定了 NOS 抑制 (SDMA 浓度升高) 在缺血性卒中风险中的致病作用 (OR = 1.24;95% CI,1.11-1.38;P = 7.69×10-5).
研究结论: NOS 活动决定了急性 UCAO 后低灌注脑的命运,其中 SDMA 可能是一个潜在的风险预测因子。



3.国学者文章介绍(三)


文章题目:塑造儿童和青少年血浆脂质组的遗传因素及其与心脏代谢风险的关系
研究内容:  脂质种类正在成为成人和儿童心脏代谢风险的生物标志物。脂质种类的遗传调控及其对生命早期心脏代谢风险的影响仍未得到探索。
研究方法: 使用基于质谱的脂质组学,我们测量了 1149 名儿童和青少年 (44.8% 为男孩) 的 227 种血浆脂质,中位年龄为 11.2 岁。我们进行了全基因组关联分析,以确定影响脂质种类的遗传变异。进行共定位和孟德尔随机化 (MR) 分析以推断脂质种类与心脏代谢结局之间的因果关系。
研究结果:我们确定了 52 种脂质的 37 个全基因组重要基因座,其中 9 个以前未报道。共定位分析显示,7 个脂质位点共享与成人心脏代谢结果相关的遗传变异。单样本 MR 分析确定了儿童和青少年神经酰胺与肝酶、鞘磷脂和血红蛋白 A1c (HbA1c) 以及磷脂酰乙醇胺和高敏 C 反应蛋白之间的正因果关系。使用基于成人的汇总统计的双样本 MR 显示了一致的关联方向,并表明额外的因果关系,特别是神经酰胺与 HbA1c 水平升高之间,以及磷脂酰肌醇与肝酶升高之间。
研究结论:这些发现强调了血浆脂质遗传决定因素对心脏代谢风险的潜在长期影响。


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