BD Rhapsody™ 单细胞联合流式,揭示内脏脂肪组织中的两种调节性T细胞群决定全身代谢

文摘   2024-09-03 12:00   浙江  

内脏脂肪

组织中的两种调节性

T细胞群决定全身代谢

内脏脂肪组织 (VAT) 是一种能量储存和内分泌器官,对代谢稳态至关重要。今天分享一篇2024年2月份发表于《Nature Immunology》期刊标题为“Two regulatory T cell populations in the visceral adipose tissue shape systemic metabolism”的文章。研究定义了两种分子和发育上不同的内脏脂肪组织Treg细胞类型,它们具有独特的环境和性别特异性功能。

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文章背景

内脏脂肪组织(VAT)有大量免疫细胞,可调节炎症。饮食或衰老会影响VAT功能、导致高血糖等疾病;

特殊的VAT Treg细胞能抑制炎症、维稳糖代谢,但VAT Treg细胞的发育途径和功能仍存争议;

在不同的生理环境下,VAT Treg发育动力学如何,还不清楚。


02

应用

BD Rhapsody™ 单细胞WTA+SMK,流式分析、分选,Bulk ATAC,Bulk RNA


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单细胞测序样本

C57BL/6小鼠,22周龄雄性和雌性内脏脂肪组织CD4+T细胞,ND(正常饮食)和HFD(高脂饮食)的小鼠内脏脂肪组织CD4+T细胞


04

文章概要

单细胞测序分析出两种主要的成熟Treg细胞,雄鼠中以ST2+ VAT Treg细胞为主,雌鼠以CXCR3+ VAT Treg细胞为主。

重新定义了VAT Treg细胞的发育途径。

转录因子GATA3等驱动ST2+ VAT Treg细胞分化,而限制CXCR3+ VAT Treg细胞的形成;而CXCR3+ VAT Treg的分化受IFN-γ和转录因子T-bet驱动。

在VAT中至少有两种不同的Treg细胞群以性别特异性的方式抑制炎症,保持机体代谢和功能。



结论

一、VAT Treg的异质性分析

作者首先通过BD Rhapsody™ 单细胞RNA-seq,对22周龄雄性和雌性小鼠VAT中分选的CD4+ T细胞进行聚类分

析,得到TH1、TH2、Foxp3+Treg等细胞亚群 (图1a)。对Foxp3+ Treg细胞进行重聚类分析得到5个cluster(图1b),cluster3、4和5都表达典型VAT Treg细胞转录本Il1rl1,被Gzmb、Il10、Areg的表达分开,代表先前报道的ST2+ VAT Treg细胞的不同激活状态,cluster1、2缺乏典型VAT Treg细胞转录本, cluster2高表达CXCR3,cluster1为双阴性细胞群(ST2-CXCR3-)。整体来讲,ST2+ VAT Treg(cluster3、4、5)在雄性小鼠中占主导地位,而CXCR3+ Treg细胞在雌性小鼠中占主导地位(扩展图1d)。


接下来作者借助流式和Bulk RNA方法验证,结论与单细胞测序一致(图1c-e)。


二、ST2+和CXCR3+ VAT Treg细胞的分化模式

为了解ST2+和CXCR3+ Treg在不同生理条件下的发育动力学,作者对不同周龄和不同喂养方式的小鼠进行了研究。


01

周龄与主导细胞亚群(至40周,自然进程):

7周龄雄雌鼠具有相似比例的ST2+和CXCR3+VAT Treg细胞(扩展2a),但随着雄鼠衰老,VAT Treg细胞积累(扩展2b), 主要是ST2+ Treg(图2a上)。相比雄鼠,雌鼠VAT CXCR3+ Treg始终占主导(图2a下)。


02

体重、肥胖与细胞亚群比例:

体重和肥胖,与ST2+ Treg细胞的数量呈正相关(图2b),但与CXCR3+ Treg呈负相关(图2b-c)。在高脂饮食雄鼠中,VAT Treg细胞频率下降,同时ST2+ VAT Treg细胞数量减少,这与上述的自然进程结果相反,但雌鼠增加(图2d左)。CXCR3+ Treg细胞数量未受高脂饮食影响(图2d右)。


03

VAT Treg细胞前体的问题

因为前期文献中对于ST2+ VAT Treg细胞起源的观点不同,所以作者在此也在重点研究了VAT Treg细胞前体的问题,更新了此前的结论。scRNAseq的轨迹分析发现,细胞分化始于cluster1(CXCR3- ST2-) Treg细胞(DN),并分叉为ST2+和CXCR3+ VAT Treg(图2e),DN表达CD62L。流式验证发现,很大部分DN Treg细胞表达CD62L和转录因子TCF1(图2g),通常与增殖和自我更新相关,表明是两类成熟VAT Treg细胞的前体。所以最终确认CXCR3+和ST2+ VAT Treg细胞是从一个共同的CD62L+TCF1+ Treg(DN)细胞前体发育而来,并能对高脂饮食或生态位变化做出动态反应。


三、GATA3是ST2+ VAT Treg细胞的关键调节因子

转录因子GATA3是皮肤和肠道中Treg细胞分化所必需的,可调节ST2表达。然而GATA3在VAT Treg细胞分化和功能中的作用尚未得到研究。


作者首先通过流式分析发现GATA3在ST2+ VAT Treg细胞中特异性表达(图4a),与scRNAseq数据一致。为了研究GATA3的作用,构建Gata3fl/flFoxp3Cre小鼠(在Treg细胞中特异性消融GATA3),发现ST2+ VAT Treg细胞均显著减少(图4c)。Bulk RNA分析发现,GATA3缺失的VAT Treg细胞缺乏ST2+ Treg细胞特征,但获得CXCR3+ VAT Treg基因特征(图4i、j)。

同时作者发现ST2+ VAT Treg关键功能分子(GzmB、CD25、Areg)的表达需要GATA3(图4k),这表明它对ST2+ VAT Treg的功能非常重要。接下来作者利用Bulk ATAC分析发现,在ST2+富集的VAT Treg细胞可及染色质区域中,GATA3结合位点被富集(扩展图4c),有验证的Tbx21 (T-bet)基因座上的GATA3结合位点(图4l),表明GATA3通过抑制Tbx21,直接促进ST2+ Treg细胞的分化,同时抑制CXCR3+ VAT Treg细胞分化。


最后,作者通过scRNA分析了ND和HFD喂养小鼠的VAT CD4+T细胞,与对照组相比,HFD小鼠ST2+ Treg cluster3中的Gata3表达显著下调(图4O)。表明HFD通过驱动GATA3下调来驱动ST2+Treg细胞丰度和功能的丧失。

所以GATA3是ST2+VAT Treg分化和CXCR3+ Treg抑制的命运所需要的,并且在促进ST2+VAT Treg细胞维持和功能所需基因的表达方面具有重要作用。此外,由Tbx21编码的T-bet是Cxcr3的关键调控因子,经过类似的实验内容(敲除模型小鼠)表明,T-bet是CXCR3+VAT Treg细胞分化所特异性需要的,并限制了ST2+Treg细胞的分化。


四、ST2+和CXCR3+ Treg细胞调节VAT生理和代谢

鉴于ST2+和CXCR3+ Treg细胞之间的显著差异及其在VAT中的性别特异性分布,作者假设这两个亚群以独特的性别特异性方式促进VAT炎症抑制和代谢维持。为了验证这一观点,比较了缺乏ST2+(Ppargfl/flFoxp3Cre)或CXCR3+ VAT (Tbx21fl/flFoxp3Cre)Treg细胞的小鼠的VAT免疫细胞组成和葡萄糖耐量。

综上,表明ST2+和CXCR3+ VAT Treg细胞以饮食和性别依赖的方式合作控制VAT炎症和葡萄糖耐量。


#总结#



文章通过单细胞测序和流式等方法,鉴定到内脏脂肪组织中有两种调节性T细胞亚群shape系统代谢,对他们的发育起源进行了重新定义。转录因子GATA3等促进ST2+ VAT Treg细胞的分化,但抑制CXCR3+ Treg细胞。相反,CXCR3+ Treg细胞的分化是由转录因子T-bet等介导的,能拮抗ST2+ Treg细胞。证明了ST2+ Treg细胞维持葡萄糖稳态,而CXCR3+ Treg细胞防止高脂肪饮食条件下的葡萄糖耐受不良。总的来说,这项研究定义了两种分子上和发育上不同的VAT Treg细胞类型,具有独特的环境和性别特异性功能,然而不同的VAT Treg细胞亚群的功能及其确切的作用模式需要进一步研究。



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