基因合成:加速mRNA技术发展与应用
文摘
科学
2024-07-18 16:59
天津
信使RNA(mRNA)通过转录从DNA中获取遗传信息,并在翻译过程中在核糖体上指导蛋白质的合成。理论上mRNA可以表达任何蛋白质,mRNA在基因编辑、疫苗开发、疾病治疗、细胞工程等方面具有巨大的潜力和应用前景。图1.中心法则
1961年,François Jacob和Jacques Monod首次提出并证实了mRNA的存在。1980-1990年代,合成mRNA技术取得重大进展。研究人员开发出体外转录系统(IVT),可以体外合成高质量的mRNA。因裸露的mRNA在体内极易被降解,有效的递送系统来保护和传递mRNA是mRNA疗法成功的关键。从早期的脂质体和阳离子脂质发展到现代的脂质纳米颗粒(LNPs)、聚合物纳米颗粒、外泌体和微针贴片,不断提高其稳定性、效率和安全性,使其在疫苗和基因治疗中的应用更加广泛和有效。2018年首个基于LNP递送的药物上市。2020年,因COVID-19,mRNA疫苗技术迅速成为焦点。全球首个商业化mRNA疫苗(mRNA-1273)上市。目前,各个领域的mRNA疫苗研究进展迅速,如针对呼吸道合胞病毒(RSV)mRNA疫苗和癌症的mRNA疫苗。今年5月和6月研究人员相继在《Science》《Nature》报道了癌症mRNA疫苗、HIV mRNA疫苗新突破[1][2]。研发生产周期短:设计和生产速度快,制备工艺简单,只需合成相应DNA序列,通过体外转录生产,易于规模化批量生产。灵活性和可调性:mRNA序列可以快速更换以应对病原体的变异,从而保持疫苗的有效性。
安全性高:mRNA疫苗不含病原体成分,且mRNA不进入细胞核,不整合到基因组中。但由于mRNA极易降解,需借助特殊载体送达体内,并且对运输和储存要求也非常严格。mRNA序列是由5个部分组成的单链RNA,从5ʹ到3ʹ分别为5ʹ帽结构(5ʹcap),5ʹ非翻译区(UTR ),编码抗原的开放阅读框(ORF),3ʹ非翻译区(UTR )和多聚腺苷酸尾(Poly A尾)。图2.mRNA序列结构示意图
mRNA技术主要流程是从DNA到mRNA的转录过程,以及后续的修饰、纯化和应用步骤。以mRNA疫苗为例,主要流程分为以下步骤:
通过基因合成或传统载体构建方式将目标基因序列连接到带有RNA聚合酶启动子序列的载体中。使用限制性内切酶对连接成功且纯化好的质粒进行线性化,以作为体外转录过程的模板。如果需要共转录方式添加Poly(A),则需先合成含有poly(A)尾序列的模板DNA,或者在体外转录后通过Poly(A)聚合酶添加Poly(A)。
加帽途径主要为2种,共转录加帽和转录后加帽。共转录加帽,一步纯化,容易放大,成本低,工艺稳定,加帽率较高。转录后加帽,加帽率接近100%,但加帽酶成本较高,且需两步纯化,难放大生产。
加尾途径主要为2种,通过基因合成直接在DNA序列末端添加poly(A)尾巴或者设计并合成包含长poly(A)尾巴序列的反向引物,然后使用PCR扩增成功将其加入到DNA模板的末端。通过基因合成直接添加poly(A)尾在模板序列中的方式,在高效性、精准性和高质量上具有显著优势。
mRNA疫苗的生产过程中,常采用模板直接引入poly(A)尾和共转录加帽,这样既能简化流程,又能保证mRNA的高效生成和一致性,适合大规模生产。使用重组RNA聚合酶(T7、T3或SP6)在体外合成mRNA,反应混合物包括线性化的DNA模板、核苷三磷酸(NTPs,包括修饰/未修饰的核苷酸)、适当的缓冲液、重组RNA聚合酶及帽子类似物(如果采用共转录加帽)。
体外转录完成后,使用DNase酶去除残留的DNA模板。经纯化去除反应混合物中的蛋白质、未反应的NTPs和其他杂质,得到mRNA原液。
包括定量分析(使用紫外分光光度计或荧光定量PCR)、纯度分析(如凝胶电泳或高效液相色谱)、以及生物活性测试(在细胞培养实验中验证翻译效率和功能)。
目前主要的递送系统采用脂质纳米颗粒(LNP)。通过微流控或射流等技术,将mRNA包裹在LNP中,形成稳定的纳米颗粒。这些LNP能够保护mRNA免受降解,并促进其有效地进入靶细胞,提高疫苗的输送效率和生物利用度。
mRNA技术为现代生物医学研究提供了重要工具和平台。未来,随着对mRNA技术的深入理解和技术的进一步革新,相信其在医学和生物技术领域的作用将会更加突出和广泛。擎科生物提供mRNA Poly(A)基因合成服务,能够合成长达120 bp的Poly(A)结构,为mRNA疫苗,mRNA疗法提供高效、精确的支持。
[1]Zhenfei Xie et al. mRNA-LNP HIV-1 trimer boosters elicit precursors to broad neutralizing antibodies.Science384,eadk0582(2024).[2]E Dolgin et al.How personalized cancer vaccines could keep tumours from coming back.Nature 630, 290-292 (2024)