水产养殖已成为全球农业增长最快的领域，水产食品对保障世界粮食安全和营养做出了日益重要的贡献。中国是世界第一水产养殖大国，鱼类是水产养殖的支柱产业之一，然而种质退化、病害频发、生长缓慢等问题严重制约了鱼类养殖业的可持续发展。2014年1月，陈松林院士团队率先完成了重要海水养殖鱼类——半滑舌鳎的全基因组测序和解析，论文在Nature Genetics发表，这不仅是我国发表的首个鱼类基因组，也是世界上第一个比目鱼类的基因组序列，标志着中国鱼类及育种技术研究进入基因组时代。截止2023年底，我国已完成并发表了60多种鱼类的基因组测序和精细图谱绘制论文，并基于这些基因组信息，开展了基因组进化、比较基因组学以及功能基因组学研究，发现了dmrt1等性别决定基因，解析了鱼类生长发育、性别决定、抗病抗逆、变态、品质等重要经济性状的遗传基础。在此基础上，研制了“鱼芯1号”等鱼类抗病育种基因芯片，建立了基因组选择和基因编辑育种技术，推动了鱼类良种培育进程。
图1 2014-2023年中国发表的鱼类基因论文数目（图中显示每年发表的代表性物种）。
该综述总结了中国鱼类全基因组精细图谱绘制、重要性状的组学分析和基因组育种技术的研究现状、进展和未来发展方向，为水产研究学者、鱼类育种学家和养殖从业人员提供了鱼类基因组学研究和育种技术的综合信息，有助于促进鱼类重要经济性状的遗传选育和良种创制，支撑鱼类养殖产业的可持续发展。
该综述通讯作者为陈松林院士。综述的撰写和发表得到了国家自然科学基金重点项目、国家农业生物育种重大专项、山东省重点研发计划等项目的支持。
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https://doi.org/10.1007/s11427-023-2670-5
