近日，中国科学院上海药物研究所郑明月团队开发了一种基于生成式AI的蛋白-配体复合物结构预测方法SurfDock。该方法通过利用蛋白质表面信息构建几何扩散神经网络，高精度自动生成配体结合构象，并已成功应用于基于结构的虚拟筛选。相关研究论文"SurfDock is a surface-informed diffusion generative model for reliable and accurate protein–ligand complex prediction"于2024年11月27日在Nature Methods在线发表。
浙江大学与上海药物研究所联合培养博士研究生曹端华，上海科技大学与临港实验室联合培养博士研究生陈铭安和上海药物所硕士研究生张润泽为本文的共同第一作者。上海药物所郑明月研究员为本文通讯作者。本研究得到了国家自然科学基金、国家重点研发计划、上海药物所与上海中医药大学中医药创新团队联合研究项目、中国科学院青年创新促进会会员项目、上海市科技重大专项等项目的资助。
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