Williams TA, et al. (2024). Phylogenetic reconciliation: making the most of genomes to understand microbial ecology and evolution. The ISME Journal, wrae129.
（2024年7月13日发表）
摘要参考翻译：近年来，系统发育调和（phylogenetic reconciliation）已成为研究微生物生态学和进化的很有前景的方法。其核心思想是模拟基因树如何沿着物种树进化，并通过解释基因重复、转移和丢失等进化事件来解释它们之间的差异。本文描述了系统发育调和如何提供研究基因组进化的自然框架，并重点介绍了包括祖先基因内容推断、物种树的定根以及它们在代谢进化和生态过渡中所揭示的见解等最新应用。整合分析阐明了从衣原体（Chlamydiae）到阿斯加德古菌（Asgard archaea）等多样微生物谱系的进化，揭示了生态适应、宿主-微生物相互作用和共生关系。然而，该方法在微生物学中还有许多更广泛的应用机会。通过不断改进，使整合模型更加现实和可扩展，并整合生境、pH、温度、氧气利用等生态元数据，为理解丰富的微生物生命图谱提供了巨大潜力。
通过调和分析推断微生物进化过程
点击下方“阅读原文”可跳转至文章页面，下载PDF文件查看英文全文。
声明：本内容未向其他微信公众号投稿。
