Pallatom｜一种全原子蛋白质生成模型
力文所生物科技算法团队开发的创新的蛋白质生成模型Pallatom，通过直接学习和建模联合分布专注于 P(all-atom)，能够端到端生成具有全原子坐标的蛋白质结构。
基于创新的全原子蛋白质生成的新型网络架构。该模型采用双轨框架，将蛋白质分解为残基级和原子级表示，并通过多层解码过程中的“穿梭”表示和recycling机制进行信息交互实现高效去噪。
引入了atom14表示方法，统一描述未知侧链坐标，确保生成的全原子构象与其物理结构之间具有高保真度。
测评结果显示，Pallatom在蛋白质设计的关键指标（包括可设计性、多样性和新颖性）方面表现卓越，各项指标均有显著提升。模型不仅提高了蛋白质生成的准确性，还展示了优异的训练效率，为未来在更大规模和更复杂系统中的应用提出了新的方向。
报告人
吴炜坤（力文所首席信息官）
关键词
蛋白设计、全原子模型、联合设计、Atom14
时间
2024年10月24日，周四晚 19:30-21:30
腾讯会议ID
378-9505-4267
代码仓库
https://github.com/levinthal/Pallatom
The original article is from PSI蛋白质结构计算讨论班.
