直播预告|去噪蛋白语言模型DePLM助力蛋白进化

文摘   2024-11-28 23:03   广东  

直播预告|去噪蛋白语言模型DePLM助力蛋白进化


「Meet AI4S」系列直播第五期将于12 月 10 日 19:00 准时开播,邀请到了浙江大学知识引擎实验室的博士研究生王泽元,他本次分享的主题是「借助扩散去噪过程助力大模型对蛋白质的优化」。

浙江大学陈华钧教授、张强研究员、王泽元博士等人提出的全新去噪蛋白语言模型 (DePLM) ,可以将蛋白语言模型捕捉到的进化信息视为与目标特性相关和无关的混合体,其中无关信息被视为「噪音」并消除,进而预测蛋白质适应性景观,帮助蛋白质优化。

研究表明,DePLM 在预测蛋白突变效应方面超过了现有方法,并且对新蛋白具有很强的泛化能力,该成果已经入选顶会 NeurIPS 2024。

本次直播,王泽元博士将为大家详解这篇论文的创新思路。

嘉宾

王泽元(浙江大学知识引擎实验室,博士研究生)

主题

借助扩散去噪过程助力大模型对蛋白进行优化

时间

2024年12月10日,周二晚 19:00

直播

关键词

蛋白语言模型|蛋白突变|Fitness

文献

Wang, Z., Ding, K., Qin, M., Li, X., Zhuang, X., Zhao, Y., ... & Chen, H.DePLM: Denoising Protein Language Models for Property Optimization. NeurIPS, 2024.

进群交流

进群请认真填问卷!

广告勿扰,广告勿扰

往期合集

干货文章线上报告蛋白设计综述BinderCo-designBenchmarkAF3David BakerESMMaSIF结构预测语言模型骨架生成逆向折叠抗体设计多肽设计酶设计稳定性药物设计

关注我们

死磕自己,愉悦大家

专注于AI蛋白相关的论文解读&学术速运


历史文章

  1. AlphaFold3 图解

  2. AlphaFold3 万字长文解读

  3. AlphaFold3 预测蛋白突变亲和力变化?

  4. 一文看懂 Binder 设计

  5. 蛋白结构和序列的共同设计

  6. 深度学习如何助力抗体设计

  7. 蛋白计算海内外课题组汇总

  8. Meta AI 蛋白语言模型ESM系列

  9. COMPSS 酶蛋白从头设计的筛选方法

  10. 简述酶的定向进化

  11. Cell 综述:从头蛋白设计之结构到功能

  12. CSH 综述文章:结构预测与蛋白设计

  13. CSH 综述文章:蛋白质序列的生成模型

  14. Nat. Biotech. 蛋白设计专刊

  15. Nat. Biotech. 深度学习与功能蛋白设计

  16. Nat. Biotech. 功能蛋白从头设计的星火

  17. ProteinBench 蛋白设计最全的Benchmark

  18. ProteinGym 蛋白突变最好的Benchmark

  19. DiG 预测蛋白构象分布

  20. MaSIF 基于表面指纹的蛋白从头设计

  21. SaProt 结构感知的蛋白质语言模型

  22. InstructPLM 语言模型与逆向折叠的结合

  23. CRISPR-GPT 基因编辑的大模型智能体

AI4Protein
读书破万卷juǎn,专注于AI蛋白相关的学术搬运。
 最新文章