计算蛋白海内外课题组汇总
Protein Design Labs
🤩 欢迎来到计算蛋白设计研究实验室列表！
✌️ 这个列表是对计算蛋白设计研究的实验室的汇总。虽然我们已经尽力做到全面，但我们的知识可能有限（主要限于美国和中国的实验室）。如果我们遗漏了您的实验室或您熟悉的实验室，我们深表歉意。欢迎提出增加建议，或在留言区留言补充。
📝 注意：这个列表是基于Zuricho在知乎的中文帖子，并由Leo-T-Zang同学协助格式化。
原文链接
知乎：https://zhuanlan.zhihu.com/p/710644612 仓库：https://github.com/Zuricho/ProteinDesignLabs
中国 (China Mainland)
北京大学 (Peking University)
来鲁华 (Luhua Lai)
http://mdl.ipc.pku.edu.cn/
高毅勤 (Yi Qin Gao)
https://www.chem.pku.edu.cn/gaoyq/
王初 (Chu Wang)
https://www.chem.pku.edu.cn/wangchulab/
张文涛 (Wentao Zhang)
https://zwt233.github.io/ 清华大学 (Tsinghua University)
龚海鹏 (Haipeng Gong)
https://structpred.life.tsinghua.edu.cn/
徐纯福 (Chunfu Xu)
https://www.timbr.tsinghua.edu.cn/info/1752/3158.htm
马剑竹 (Jianzhu Ma)
https://majianzhu.com/
刘洋 (Yang Liu)
https://nlp.csai.tsinghua.edu.cn/~ly/
兰艳艳 (Yanyan Lan)
https://zhouh.github.io/
周浩 (Hao Zhou)
https://zhouh.github.io/ 中国科学院计算技术研究所 (CAS ICT)
卜东波 (Dongbo Bu)
https://people.ucas.edu.cn/~dbu
张海仓 (Haicang Zhang)
https://people.ucas.ac.cn/~0032113 中国科学院生物物理研究所 (CAS IBP)
张先恩 (Xianen Zhang)
https://ibp.cas.cn/kydw_157813/xrktzz/xsszmZ/201912/t20191202_5447225.html
王殿冰 (Dianbing Wang)
No website provided 中国人民大学 (Renmin University of China)
黄文炳 (Wenbing Huang)
https://gsai.ruc.edu.cn/wenbing_huang 上海交通大学 (Shanghai Jiao Tong University)
洪亮 (Liang Hong)
https://ins.sjtu.edu.cn/people/lhong/index.html
陈海峰 (Haifeng Cheng)
https://cbb.sjtu.edu.cn/~hfchen/
郑双佳 (Shuangjia Zheng)
https://prokia.github.io/
杨旸 (Yang Yang)
https://compbio.sjtu.edu.cn/
沈红斌 (Hongbin Shen)
http://www.csbio.sjtu.edu.cn/
庆睿 (Rui Qing)
https://life.sjtu.edu.cn/teacher/ruiqing
王宇光 (Yuguang Wang)
https://yuguangwang.github.io/ 复旦大学 (Fudan University)
孙思琦 (Siqi Sun)
https://intersun.github.io/
马剑鹏 (Jianpeng Ma)
https://mrics.fudan.edu.cn/info/1021/1110.htm 上海科技大学 (ShanghaiTech University)
豆佳宜 (Jiayi Dou)
https://slst.shanghaitech.edu.cn/djy/
白芳 (Fang Bai)
https://sist.shanghaitech.edu.cn/bf/list.htm 中国科学院上海药物研究所 (CAS SIMM)
郑明月 (Mingyue Zheng)
https://people.ucas.ac.cn/~0010379 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 (CAS CEMCS)
张少庆 (Shaoqing Zhang)
http://zhanglab.sibcb.ac.cn/zhanglab/ 浙江大学 (Zhejiang University)
侯廷军 (Tingjun Hou)
http://cadd.zju.edu.cn/ 西湖大学 (Westlake University)
原发杰 (Fajie Yuan)
https://fajieyuan.github.io/
曹龙兴 (Longxin Cao)
https://www.westlake.edu.cn/faculty/longxing-cao.html
陈子博 (Zibo Chen)
https://chenlab.org/
卢培龙 (Peilong Lu)
https://www.labxing.com/lab/693/home
曾坚阳 (Jianyang Zeng)
https://aicb.lab.westlake.edu.cn/
李子青 (Stan Z. Li)
https://www.westlake.edu.cn/faculty/stan-zq-li.html 浙江工业大学 (Zhejiang University of Technology)
张贵军 (Guijun Zhang)
http://zhanglab-bioinf.com/people/guijunz/ 中山大学 (Sun Yat-sen University)
杨跃东 (Yuedong Yang)
https://cse.sysu.edu.cn/content/2951 中国科学院深圳先进技术研究院 (CAS SIAT)
罗小舟 (Xiaozhou Luo)
https://people.ucas.ac.cn/~luoxiaozhou 清华大学深圳国际研究生院 (Tsinghua SIGS)
李斐然 (Feiran Li)
https://www.sigs.tsinghua.edu.cn/lfr/main.htm 南方科技大学 (SUSTech)
李喆 (Zhe Li)
https://sustech.edu.cn/zh/faculties/lizhe.html 中国科学技术大学 (USTC)
刘海燕 (Haiyan Liu)
https://biocomp.ustc.edu.cn/
刘淇 (Qi Liu)
http://staff.ustc.edu.cn/~qiliuql/ 厦门大学 (Xiamen University)
闵小平 (Xiaoping Min)
https://informatics.xmu.edu.cn/info/1425/25349.htm 山东大学 (Shandong University)
杨建益 (Jianyi Yang)
https://yanglab.qd.sdu.edu.cn/ 中国科学院天津工业生物技术研究所 (CAS TIB)
江会锋 (Huifeng Jiang)
http://www.tib.cas.cn/sourcedb_tib_cas/cn/expert/rckyjy/201212/t20121212_3704580.html
美国 (United States)
麻省理工学院 (MIT)
Bonnie Berger
https://people.csail.mit.edu/bab/
Tommi S. Jaakkola
https://people.csail.mit.edu/tommi/
Regina Barzilay
https://www.regina.csail.mit.edu/
Tess E. Smidt
https://blondegeek.github.io/
Sergey Ovchinnikov
https://www.solab.org/
Alexandre Rives
No website provided
Amy E. Keating
https://biology.mit.edu/profile/amy-e-keating/
James J. Collins
https://www.collinslab.mit.edu/ 哈佛大学 (Harvard University)
Debora Marks
https://www.deboramarkslab.com/
Chris Sander
https://www.sanderlab.org/
Nicholas F. Polizzi
https://www.polizzilab.org/
Marinka Zitnik
https://zitniklab.hms.harvard.edu/bio/
George Church
https://wyss.harvard.edu/team/core-faculty/george-church/
Yilun Du
https://yilundu.github.io/
Omar Abudayyeh & Jonathan Gootenberg
https://www.abugootlab.org/ 斯坦福大学 (Stanford University)
Possu Huang
http://www.proteindesign.org/
Jure Leskovec
https://cs.stanford.edu/people/jure/
Rhiju Das
https://profiles.stanford.edu/rhiju-das
Brian Trippe
https://briantrippe.com/
Brian Hie
https://evodesign.org/
Ron Dror
https://drorlab.stanford.edu/
James Zou
https://www.james-zou.com/ 华盛顿大学 (University of Washington)
David Baker
https://www.bakerlab.org
Neil King
https://kinglab.ipd.uw.edu/
Gaurav Bhardwaj
https://peptidedesign.org/
Frank Dimaio
https://dimaiolab.ipd.uw.edu/ 加州大学旧金山分校 (UCSF)
William DeGrado
https://pharm.ucsf.edu/degrado
Tanja Kortemme
https://kortemmelab.ucsf.edu/ 加州大学伯克利分校 (UC Berkeley)
Jennifer Doudna
https://doudnalab.org/
Yun S. Song
https://people.eecs.berkeley.edu/~yss/
Jennifer Listgarten
http://www.jennifer.listgarten.com/
Pieter Abbeel
https://people.eecs.berkeley.edu/~pabbeel/ 加州大学洛杉矶分校 (UCLA)
Quanquan Gu
https://web.cs.ucla.edu/~qgu/
Lin Jiang
https://eastonad.ucla.edu/people/lin-jiang-phd 加州理工学院 (Caltech)
Frances Arnold
http://fhalab.caltech.edu/
Steve Mayo
https://www.mayo.caltech.edu/
Yisong Yue
http://www.yisongyue.com/ 芝加哥大学 (University of Chicago)
Rama Ranganathan
http://ranganathanlab.org/
Andrew Ferguson
https://www.ferglab.com
Huimin Zhao
https://zhaogroup.chbe.illinois.edu/index.html
Ge Liu
https://www.mit.edu/~geliu/ 斯克里普斯研究所 (Scripps Research Institute)
William E. Balch
https://www.webalchlab.com/
Marco Mravic
https://mmravic314.github.io/ 普林斯顿大学 (Princeton University)
Mengdi Wang
https://ece.princeton.edu/people/mengdi-wang
Ellen D. Zhong
https://www.cs.princeton.edu/~zhonge/ 杜克大学 (Duke University)
Bruce Donald
https://users.cs.duke.edu/~brd/
Pranam D. Chatterjee
https://www.chatterjeelab.com/
Alexander Tong
https://www.alextong.net/
Philip A. Romero
https://pratt.duke.edu/people/philip-romero/
Rohit Singh
https://singhlab.net/ 约翰霍普金斯大学 (John Hopkins University)
Jeffrey J. Gray
https://graylab.jhu.edu/ 卡内基梅隆大学 (Carnegie Mellon University)
Lei Li
https://lileicc.github.io/ 西北大学 (Northwestern University)
Gabriel J. Rocklin
http://www.rocklinlab.org/
Neha P. Kamat
https://www.nehakamat.com/ 伊利诺伊大学香槟分校 (UIUC)
Huimin Zhao
https://zhaogroup.chbe.illinois.edu/index.html
Ge Liu
https://www.mit.edu/~geliu/
英国 (United Kingdom)
剑桥大学 (University of Cambridge)
Pietro Liò
https://www.cl.cam.ac.uk/~pl219/ 牛津大学 (University of Oxford）
Michael Bronstein
https://www.cs.ox.ac.uk/people
Charlotte Deane
https://opig.stats.ox.ac.uk/
Yarin Gal
https://www.cs.ox.ac.uk/people/yarin.gal/website/ 帝国理工学院 (Imperial College London)
Guang Yang
https://profiles.imperial.ac.uk/g.yang 伦敦大学学院 (UCL)
David T. Jones
http://www0.cs.ucl.ac.uk/staff/d.jones/ 爱丁堡大学 (University of Edinburgh)
Chris Wells Wood
https://www.wellswoodresearchgroup.com/
Lynne Regan
https://regan.bio.ed.ac.uk/ 布里斯托大学 (University of Bristol)
Dek Woolfson
https://woolfsonlab.wordpress.com/
Ross Anderson
https://theandersonlab.com/ 卡迪夫大学 (Cardiff University)
Fabio Parmeggiani
https://profiles.cardiff.ac.uk/staff/parmeggianif
德国 (Germany)
慕尼黑工业大学 (TUM)
Rost Burkhard
https://www.rostlab.org/ 柏林自由大学 (FU Berlin)
Frank Noé
https://www.mi.fu-berlin.de/en/math/groups/ai4s/staff/noe/index.html 莱比锡大学 (Leipzig University)
Clara T. Schoeder
https://www.schoederlab.org 拜罗伊特大学 (University of Bayreuth)
Birte Höcker
https://www.proteindesign.uni-bayreuth.de/en/index.html
法国 (France)
综合理工学院 (Ecole Polytechnique)
Thomas Simonson
https://bioc.polytechnique.fr/biocomputing/ 法国国家农业科学院 (INRAE MIAT)
Thomas Schiex
https://miat.inrae.fr/schiex/research.shtml 图卢兹生物技术研究所 (Toulouse Biotechnology Institute)
Sophie Barbe
No website provided
瑞士 (Switzerland)
苏黎世联邦理工学院 (ETH Zurich)
Donald Hilvert
https://protein.ethz.ch/ 洛桑联邦理工学院 (EPFL)
Bruno E. Correia
https://www.epfl.ch/labs/lpdi/
Anne-Florence Bitbol
https://www.epfl.ch/labs/bitbol-lab/
加拿大 (Canada)
蒙特利尔大学 (Mila - Quebec AI Institute)
Yoshua Bengio
https://yoshuabengio.org/fr/profil/
Jian Tang
https://jian-tang.com/ 多伦多大学 (University of Toronto)
Philip M. Kim
https://www.kimlab.org/
瑞典 (Sweden)
斯德哥尔摩大学 (Stockholm University)
Patrick Bryant
https://patrickbryantlab.github.io/
丹麦 (Denmark)
哥本哈根大学 (University of Copenhagen)
Kresten Lindorff-Larsen
https://www1.bio.ku.dk/english/research/bms/pbg/mw/
Martin Willemoës
https://www1.bio.ku.dk/english/research/bms/sbinlab/kll/
以色列 (Israel)
魏茨曼科学研究所 (Weizmann Institute of Science)
Sarel J Fleishman
https://www.fleishmanlab.org/ 特拉维夫大学 (Tel Aviv University)
Jérôme Tubiana
https://jertubiana.github.io/research/
沙特阿拉伯 (Saudi Arabia)
阿卜杜拉国王科技大学 (KAUST)
Xin Gao
https://cemse.kaust.edu.sa/sfb
新加坡 (Singapore)
新加坡国立大学 (National University of Singapore)
Yang Zhang
https://zhanggroup.org/
日本 (Japan)
东京大学 (Tokyo University)
Kotaro Tsuboyama
https://sites.google.com/view/tsubo-lab/home
韩国 (South Korea)
首尔国立大学 (Seoul National University)
Martin Steinegger
https://steineggerlab.com/en/
Minkyung Baek
https://biosci.snu.ac.kr/en/people/faculty?mode=view&profidx=101 韩国科学技术院 (KAIST)
Ji-Joon Song
https://www.song-kaist.org
Byung-Ha Oh
https://sites.google.com/view/tpdsb/home?authuser=0 浦项科技大学 (POSTECH)
Sangmin Lee
https://sites.google.com/view/pdl-postech 基础科学研究所 (IBS)
Ho Min Kim
https://protein.ibs.re.kr/people/chief-investigator
香港 (Hong Kong)
香港中文大学 (Chinese University of Hong Kong)
Yu Li
https://liyu95.com/ 香港科技大学 (HKUST)
Danqing Zhu
https://www.danqing-zhu.com/
奥地利 (Austria)
格拉茨工业大学 (TU Graz)
Gustav Oberdorfer
https://www.tugraz.at/institute/ibc/research/research-groups/protein-design
Anne-Florence Bitbol
https://www.epfl.ch/labs/bitbol-lab/
比利时 (Belgium)
自由大学布鲁塞尔 (Vrije Universiteit Brussel)
Anastassia A. Vorobieva
https://vorobievalab.sites.vib.be/en
西班牙 (Spain)
基因调控中心 (Centre for Genomic Regulation)
Noelia Ferruz
https://www.aiproteindesign.com/ IBMB CSIC
Enrique Marcos
https://ibmb.csic.es/en/department-of-structural-and-molecular-biology/protein-design-and-modeling/#lab-presentation
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