Seminar｜AI辅助从头酶设计
主讲人
华辰清（McGill & Mila研究所硕士）
时间:
2024年12月08日，周日晚 21:00-22:30
腾讯会议: 369-773-633
https://meeting.tencent.com/dm/mWtIWOEyTnTm
关键词
蛋白设计｜酶｜从头设计｜AI｜筛选
摘要
本次报告Will将谈及以下的一些内容：
酶-反应数据集 使用无模拟生成模型设计活性位点 AI驱动的酶设计模型 用于酶检索和功能预测的计算筛选方法 正在进行的工作和展望。
以及他开发的一系列AI酶蛋白设计工具：
ReactZyme：数据集与筛选，
https://github.com/WillHua127/ReactZymeEnzymeFlow：活性位点设计方法，
https://github.com/WillHua127/EnzymeFlowGENzyme：酶设计，
https://github.com/WillHua127/GENzymeEnzymeCAGE：筛选，
https://github.com/GENTEL-lab/EnzymeCAGE
主讲人简介
华辰清（Will Hua）在McGill & Mila研究所获得了计算机学士学位，导师为William Hamilton。
他也是McGill & Mila研究所的硕士研究生，主攻人工智能在生物学的应用，导师为Doina Precup和Guy Wolf。
为了推广算法在AI4S领域应用，Will致力于蛋白设计的人工智能研究。他的研究重点在于利用人工智能进行酶蛋白的从头设计。
目前他正在积极寻找博士职位，旨在使得AI蛋白设计在现实世界中发挥更大的影响力。
个人主页：https://willhua127.github.io/
参考文献
[1]. Hua, Chenqing, et al. "Reactzyme: A benchmark for enzyme-reaction prediction." arXiv preprint arXiv:2408.13659 (2024).
[2]. Hua, Chenqing, et al. "Enzymeflow: Generating reaction-specific enzyme catalytic pockets through flow matching and co-evolutionary dynamics." arXiv preprint arXiv:2410.00327 (2024).
[3]. Reaction-conditioned De Novo Enzyme Design with GENzyme
[4]. EnzymeCAGE: A Geometric Foundation Model for Enzyme Retrieval with Evolutionary Insights
