一、写在前面
二、主要内容
Figure 1
Figure 2
3、造血轨迹显示高危 MDS 组的粒细胞发生异常
已有人或小鼠BM细胞的数据证明HSPC到成熟中性粒细胞和单核细胞的发育轨迹,当使用基于扩散图的算法Palantir模拟MDS细胞的拟时序时,作者观察到HSPCs和GMP细胞的伪时间状态在高风险和低风险MDS组中都发生了显着改变(图3B)。单核细胞发育看起来正常。然而,在中性粒细胞原和中性粒细胞发育过程中观察到拖延状态,这与高危MDS组中这两种细胞类型的产生减少一致。造血中公认的标志物或转录因子的表达也与预期一致:HSPC标记物CD34在两个MDS组中的表达过活化,GMP维持标志物MS4A3和MPO的表达受到抑制,包括SPI-1、CEBPD、FOS、S100A8在内的成熟中性粒细胞标志物的表达也降低,成熟单核细胞标志物 CD14 的表达似乎正常(Figure 3C)。巨核细胞-红系祖细胞 (MEP) 标记物 EGR1 的表达在 MDS 组中似乎受到抑制(Figure 3C)。这与贫血和血小板减少症普遍见于MDS患者的观点一致。在分析改变的通路时,作者还发现高风险 MDS 组具有典型的干扰素 α 和 γ 信号传导和炎症通路上调,这在低风险 MDS 组中没有观察到。
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4、染色质表观遗传调节因子 HMGA1 及其调节子在高危 MDS 患者中过度激活
Figure 4
Figure S1
5、T 细胞微环境在高危 MDS 中作用
在诊断过程中,作者注意到几个克隆性造血相关基因发生了突变(见表1)。在基于SComatic的体突变检测中,未观察到显著的体细胞突变负荷(Figure 5B)。然后,作者探究了MDS患者的细胞间通讯(教程可参考:《细胞通讯》CellChat学习手册)是否发生了变化。如图所示,高危MDS组在BM环境中表现出更强的细胞通讯强度(Figure 5C),特别是在计算HSPCs和GMPs时。在对MDS组的T细胞活性进行评分时,作者观察到高危MDS组对CD8T和DNT细胞的炎症水平、耗竭活性、细胞毒性活性和免疫监视水平增加(图5D-G)。基于这些使用构成 scRNA-seq 数据集的 T 细胞的比较,作者们得出结论,高风险 MDS 组的 T 细胞比低风险 MDS 组的 T 细胞活化程度更高。
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三、最后聊聊
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