SCENIC转录因子调控网络图

文摘   2024-08-19 09:06   江苏  


学习手册

SCENIC全称Single Cell rEgulatory Network Inference and Clustering,就像字面意思那样,功能是单细胞调控网络的推断与聚类。SCENIC能够完成许多转录因子相关的分析与可视化功能,我们此前也做过详细的教程:SCENIC单细胞转录因子预测|学习手册,有自学能力的同学也可以访问官网学习:https://github.com/aertslab/SCENIC。这里我们整合了在SCENIC完成标准分析后输出得TFTarget Gene信息,最终生成调控网络图的可视化。

本教程可视化集锦:

       -Biomamba

所见即所得


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