生信分析为什么要使用服务器?
文摘
科技
2024-09-11 09:05
江苏
一、升级配置
这一点可以说是刚需,公众号内的粉丝大都是研究单细胞测序的,现在动辄就百万细胞的数据集,拿自己的8G内存笔记本显然配置够不上需求。以下为各档位服务器的配置,起步256GB、20线程的配置足够为你的大数据集保驾护航:
● 真的≈独享,机器中当前账号中没有计算任务时配置全空,无需与他人共享计算资源:
● 当然,记得合理分配计算资源,并不是调用的资源越多计算速度就越快:二、技术支持
做生信分析难免会遇到环境配置和软件安装的问题,自己一个个去搜软件安装办法和依赖环境效率过低,而作为专业的生信服务器,西柚云的生信技术人员已经在服务器中预装了上千款生信软件/R包:
三、不用关机
这点我想大家深有体会,很多软件或函数任务运行时可能会花费数天时间,在本地电脑运行期间若自己的电脑若遇到断电、断网等问题,运行中的任务则会付之一炬。而服务器在机房稳定运行、永不关机,在服务器中执行任务时,无论是挂载在Linux还是用Rstudio-server运行,即使本地的电脑掉线或关机,服务器依然可以继续执行任务,完全不用守着自己的电脑。
四、网速快
相较于大家的塑料校园网,服务器每台接入1000M的专线,且我们具有正规备案,即使访问境外的数据库依旧可以达到相同的速度,即使是使用最简单的wget命令也能达到极高的下载速度,即使是用作一个网盘,似乎也比百度云更有优势。
五、性价比高
如上,一年服务器的费用差不多与一年的百度云会员、一个16GB内存条、1T的固态硬盘价格相当,但功能却多了许多。与其花重金升级自己的电脑,倒不如低价租用一台服务器,现在通过联名页面注册即送200¥优惠券,填写优惠码[biomamba]立减。
另外,可咨询文末微信号领取返现福利(200¥粉丝专属优惠券与返现可叠加),注册链接:https://biomamba.xiyoucloud.net/
六、损耗低
电脑的工作是有损耗的,相信大家在用自己的电脑计算时已经感受到机器的风扇在嗡嗡作响,倘若电脑不堪重负出现故障,随便换哪个零件想来也比服务器的租金要高。
七、数据存储有保障
相较于传统的硬盘直储,服务器的存储方式为超融合集群存储,具体优点为高可靠性、高性能高可用,并且具有在线更换硬件、恢复数据的优势。这些优点我们之前专门花推送去说过(大家的宝贝数据怎么存储才最安全)。
八、正经Linux系统
无论是windows下的子系统、双系统,还是虚拟机,与真正的Linux环境还是有所区别。而服务器原汁原味的Linux可以帮助大家在真正的Linux环境中学习生信。没有Linux基础的小伙伴也不用担心,我们已经为大家准备好了系列教程:
生信Linux课程合辑
首先,我们这个服务器价格优势很明显了,西柚云基本只需要1/4的价格就能买到4~5倍的配置,给大家看看某大厂的报价,64GB内存一个月就要两千了:
另外,新旧两代服务器最大的差别是内存变成了完完全全的独享,每个用户都单独拥有全部的内存,CPU也变成了半独享(打个比方,原先是22人共享48核、768GB内存,现在升级为100个用户共享每台96核、3T内存的10台计算节点,每当用户觉得当前计算节点拥堵时可选择一键迁移至其它资源闲置节点,真真正正解决了当前共享服务器领域资源分配不均的情况)。并且还具有root权限,可以安装许多需要root的软件,这样私密性也更强。由于是半独享,总体配置比以前更空旷,以下是我的实时配置空余情况,没有程序运行时服务器基本处于空载状态:
具体配置的服务器每年的租用价格,需要购买的可以文末加客服微信先联系一下,目前谈下来最终的方案是标价-200¥,填写优惠码[biomamba]立减,且有额外返现(购买后加微信Biomamba返现)。https://biomamba.xiyoucloud.net/(粘贴至浏览器打开,不要从微信中跳转)
为了大家学习体验需要,免费版依然在运行(128GB,可免费使用1h,大家可以申请免费版或试用版学习我的教程,有大量运算需求时再购买)。试用版也是可以访问Rstudio-server的,这样大家就不用总在命令行里操作啦。1、价格优势上面已经给大家说过了,何况还有免费版供大家学习2、第二个好处是大家的设备、R语言、Rstudio的版本与我有所出入,有相当一部分同学运行我的代码时由于版本的问题会遇到报错,综合这两个问题,初步有一个解决的办法——共享服务器。使用这个服务器,我们都可以在同样的环境下进行操作,每台服务器已经预先安装了我使用过的全部R包,直接加载即可,排除版本问题并拥有足够的配置。以后我们的课程都会在西柚云中进行录制。
3、网速方面也比较给力我下载文件时最大速度可以超过100M/S。就我个人来说,就当买个网盘用来高速传输也是很划算的。没有梯子的同学也可以试试用西柚云下一些墙外的东西。
下面演示一下基本操作流程和优势!没有用过服务器、不会安装与连接的同学也不用担心,会有客服手把手教学!http://www.hostbuf.com/downloads/finalshell_install.exe这一步应该不用多说,下载后双击运行按默认参数点下一步直至完成安装即可。
第一次创建连接的时候可能有点麻烦,需要按以下1、2、3号箭头依次点击。
在弹出的窗口中依次填入购买成功页面显示的以下信息后点击确定。关闭finalshell并重启后即可通过双击快速连接访问服务器,以上的信息填写一次就好啦,以后直接点击这个快速连接即可:
可以看出服务器的中还有722GB的内存处于可获取状态,这个配置对大家来说肯定绰绰有余,无论运行什么样的单细胞数据应当都不在话下。
4、使用R语言
(1)R
用过Linux的都知道,在命令行敲一个R即可进入R环境,但是这种方式不太好操作。不推荐。
(2)Rstudio
购买产品后的页面会提供一个网页版Rstudio的链接,复制到浏览器打开即可,下面的红色箭头即可上传文件,用起来比较方便