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2023第4期
研究背景
APX 能高效地清除植物中主要的非生物应激活性氧（ROS），在植物抗逆性中发挥着重要作用，但关于甘蓝型油菜中该基因家族的报道较少。本研究系统地对甘蓝型油菜的APX基因家族进行了鉴定，并对其序列特征进行深入分析。最后通过其在甘蓝型油菜L9低温胁迫下转录组和蛋白质表达，研究APX基因家族对不同低温胁迫时期的响应。
研究策略
通过BLAST比对已公开的拟南芥APX基因序列与甘蓝型油菜基因组，获得甘蓝型油菜基因家族。接着对APX基因家族序列的理化参数、外显子-内含子结构、启动子顺式作用元件、基因重复、共线性分析和系统发育树构建等进行了生物信息学分析。最后对APX基因家族在低温胁迫下转录组和蛋白组表达谱分析。
研究结果
1. 甘蓝型油菜L9基因组中共有有18个包含3种不同保守结构域的APX基因。
2. 这些APX基因在系统发育树上分为三支，其中11个APX基因具有低温响应组分（LTR）。
3. APX2、APX4、APX12和APX18在低温胁迫转录组中表达上调，APX2、APX4、APX8、APX12、APX17和APX18在蛋白组中有表达。
图3 APX基因家族的系统发育树、保守基序、结构域和外显子/内含子结构
作者介绍
通讯作者 杜春芳，女，农学博士，现为山西农业大学棉花研究所研究员，主要从事油菜遗传育种与推广工作。目前主持或参与多项省市级课题，以第一或通讯作者发表国内外论文30余篇，是山西农业大学硕士生导师，山西省学术技术带头人。
END
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原文链接
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2096242823000520
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