感染性疾病是指由细菌、病毒、真菌、支原体等病原体的侵入,引发的身体局部组织发生损伤性病变和全身炎症反应。据2022年 WHO 公布数据,感染性疾病在全球 10 大致死原因中占据重要位置。中等及低收入国家中,30-50% 以上死亡由感染性疾病造成。
感染病原体常规检测方法有分离培养鉴定、免疫学方法,如ELISA、分子生物学方法,如荧光定量PCR等。与传统方法相比,NGS技术显著提高了病原体检测的阳性率。NGS技术以其高通量、高精准度及信息丰富的特点,正逐步成为精准医疗的重要工具。今天,我们就来一起探讨NGS技术在感染领域的应用,揭开其神秘面纱。
NGS又称高通量测序技术或二代测序技术,是一种基于DNA或RNA的测序方法。它通过PCR扩增过程中的化学标志物发出的信号来读取序列信息,实现对基因的精准定位和未知序列的检测。与传统测序技术相比,NGS具有通量大、速度快、成本低的显著优势。
NGS在感染领域的应用
1. 宏基因组测序(mNGS)
宏基因组测序无需预设、无需培养,能够直接对临床样本中的DNA和RNA进行高通量测序,一次性完成细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种病原体的检测。这一技术特别适用于新发、罕见及疑难感染性疾病的诊断,如脑膜炎、肺炎、脓毒血症等。mNGS的广泛应用,极大地提高了病原体的检出率,为临床医师提供了及时、准确的诊断依据。
2. 病原体靶向测序(tNGS)
与mNGS不同,病原体靶向测序(tNGS)主要目标是鉴定患者样本中的一种或多种特定微生物病原体。通过设计特定的引物或探针,tNGS能够实现对特定病原体的精准检测,尤其适用于已知病原体的快速鉴定。
3. 精准诊断与个性化治疗
NGS技术不仅限于病原体的检测,还能为感染性疾病的精准治疗提供有力支持。通过检测病原体的基因序列,可以明确其致病性、耐药性等特征,指导临床医师选择合适的抗菌药物,实现个体化治疗。这不仅有助于提高治疗效果,还能减少耐药菌的产生,保护公共卫生安全。
星齐NGS方案
mNGS:
可检测近3万种病原体及近3000种耐药基因。覆盖细菌、真菌、病毒、寄生虫、支/衣原体、螺旋体等主要感染病原体,让感染性疾病的诊断迈向更为广阔空间,也为疑难危重感染快速精准诊断提供了新希望。
病原体tNGS检测panel:
该panel基于30万份临床mNGS结果统计高发数据筛选设计而来,可检测临床近300种病原体及近50种耐药基因,可覆盖临床上 95%以上的常见病原体。Panel基于大数据筛选方法更符合临床实际情况,并具有更高的准确性和可靠性。
妇科生殖感染tNGS检测panel:
对 97 种生殖道相关的病原微生物进行检测, 覆盖临床95%妇科感染常见病原体,包括细菌、病毒、真菌、支原体、衣原体及寄生虫等,可实现对包括细菌性阴道病、宫颈炎、龟头炎和性传播疾病等在内的多种生殖道感染性疾病的精确诊断,还可检测出导致微生态失调的致病菌,为后续的个性化治疗提供依据。
星齐NGS检测平台,为感染性疾病的精准诊断与治疗提供了强有力的支持,推动了个性化治疗的发展,为临床医师提供了更加全面、准确的诊断依据。