近日，我校生命健康信息学院、大数据生物智能重庆市重点实验室白明泽教授团队与其他团队合作的最新研究成果“quantms: a cloud-based pipeline for quantitative proteomics enables the reanalysis of public proteomics data”（量谱云：面向公共蛋白质组学重分析的定量蛋白质组学云分析管道）在国际顶级学术期刊《Nature Methods》（《自然方法》）上发表。这是该团队继2021年在《Nature Communications》上发文后的又一重大突破，标志着我校在面向人民生命健康的大数据智能分析领域又取得重大基础研究进展。
据悉，目前在数据量级已达到百亿的公共蛋白质组学大数据中存在许多尚未被发现的知识亟待挖掘，进行下一步数据挖掘的首要任务是对这些质谱大数据进行系统化、标准化地重分析，然而过去的方法与工具却无法应对如此大规模的计算。针对这一现实问题，论文作者们发展了基于云的蛋白质组学大规模数据重分析管道quantms。它实现了自动化、标准化、可扩展的蛋白质组学深度和精准定量分析，解决了在百亿级蛋白质组学公共大数据领域缺乏定量分析流程的难题，提升了海量公共蛋白质组学大数据的使用价值，为蛋白质组学大数据的整合分析和知识挖掘奠定了基础，使蛋白质组学大数据的重分析工作成为在蛋白质组学领域的生物医学知识发现的重要支撑力量。
《Nature Methods》是Nature杂志的系列期刊，创刊于2004年，致力于发表生命科学领域新方法和经过验证的重大研究技术改进、为生命科学领域研究人员提供科研新工具。该期刊高度重视工具的实用价值和推进新的生物应用的能力，最新影响因子为36.1。
quantms由重庆邮电大学白明泽团队、欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）Yasset Perez-Riverol团队和德国图宾根大学医学院（University Hospital Tübingen）Oliver Kohlbacher团队合作完成。重庆邮电大学、大数据生物智能重庆市重点实验室为本论文的第一署名单位，我校生命健康信息科学与工程学院2023届硕士研究生代承新为第一作者。
原文链接：https://www.nature.com/articles/s41592-024-02343-1
quantms自动化分析流程和分析结果
声明：重庆邮电大学融媒体中心推送稿件除注明原创内容外，其余稿件文字及图片均来自网络及各大主流媒体。版权归原作者所有。如认为内容侵权，请后台留言，联系我们删除。
来源 / 科技处
推荐阅读
▲重庆日报“党员读党报”活动走进重邮
▲重邮冬天里的“一团火”
▲我校粤港澳大湾区校友2024年年会举行
