Vitessce:多模态和空间分辨单细胞数据的综合可视化

学术   2024-09-30 03:33   法国  

Keller MS, et al. (2024). Vitessce: integrative visualization of multimodal and spatially resolved single-cell data. Nature Methods, doi: 10.1038/s41592-024-02436-x.


(2024年9月27日发表)


摘要参考翻译:具有单细胞和空间分辨率的多组学技术使测量数百万个细胞的数千个特征成为可能。然而,同时对高维转录组学、蛋白质组学、基因组图谱和成像数据类型进行可视化分析仍然是一项挑战。在这里,我们介绍了Vitessce,这是一个基于网络的交互式可视化框架,用于探索多模态和空间分辨单细胞数据。我们展示了数百万个数据点的综合可视化,包括跨多个协调视图的细胞类型注释、基因表达量、空间解析转录本和细胞分割。该开源软件可在http://vitessce.io上获取。


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