生物技术通报 | 黄三文/张春芝—基因组学研究助力马铃薯育种方式的变革

文摘   科学   2024-10-29 17:24   北京  

基因组学研究助力马铃薯育种方式的变革

张春芝,周倩,吴瑶瑶,尚轶,黄三文

DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2024-0695

马铃薯(Solanum tuberosum)营养全面,是继小麦和水稻之后的世界第三大主食作物。我国是世界上最大的马铃薯生产国,产量约占世界总产量的1/4。但是和主要谷物类粮食作物不同,栽培马铃薯是同源四倍体物种,基因组杂合度更高,遗传分析也更困难。过去马铃薯的基础研究以四倍体为主,重要生物学问题研究较为落后,对育种的支撑不足,育种技术也相对落后。传统马铃薯育种就像“开盲盒”,将两个高度杂合的四倍体进行杂交,后代表型难以预测,在保持原有优良性状的基础上,增加优异性状的概率极低,一旦筛选到优良品系便通过克隆繁殖进行固定。国际上把育种分为4个阶段,而马铃薯传统育种仍然停留在2.0阶段,即遗传育种阶段,更多的是依靠育种家的经验进行选择,选育突破性品种的难度很大。因此,马铃薯的品种更新换代很慢,一些上百年历史的老品种仍在大面积种植。20世纪五六十年代的“绿色革命”促进了水稻和小麦产量的急剧增长,而马铃薯并没有经历这样的育种突破,究其原因还是同源多倍体基因组的复杂性导致的。另外,现有的薯块繁殖方式也存在用种量大、易感染病虫害等问题。
在这种背景下,国内外科学家纷纷提出开展杂交马铃薯育种,即用二倍体替代同源四倍体进行育种,用杂交种子替代薯块进行繁殖,变革马铃薯的育种和繁殖方式。自然界中70%以上的马铃薯种质资源都是二倍体,包括大量的野生种和农家种,具有丰富的遗传变异,为杂交马铃薯育种提供了资源基础。相对于四倍体,二倍体马铃薯遗传分析也更简单,这为开展杂交马铃薯育种提供保障。另外,二倍体马铃薯可以通过杂交种子进行繁殖,克服了薯块繁殖用种成本高、易传播病虫害等问题。过去十多年来,以二倍体为主要研究对象的马铃薯基因组学快速发展,进一步推动了马铃薯育种技术的提升。
近日,《生物技术通报》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文/张春芝团队题为基因组学研究助力马铃薯育种方式的变革的文章本文总结了基因组学研究如何推动马铃薯育种和繁殖方式的变革,助力马铃薯育种迈入4.0时代。

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本文主要包括以下几部分内容:    

1 马铃薯基因组学研究蓬勃发展

1.1 不同倍性马铃薯基因组解析
1.2 马铃薯的遗传多样性

2 克服自交不亲和为二倍体杂交育种提供了可能性

3 有害突变的鉴定为育种提供利器

4 杂交马铃薯基因组设计育种体系构建

5 展望




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目前,二倍体杂交马铃薯育种仍然处于起步阶段,一些关键技术取得突破,但是二倍体杂交种同商业化四倍体商品品种相比,在产量、抗性、适应性等方面仍然存在一些差距。过去马铃薯的基础研究相对落后,控制很多重要农艺性状的关键基因仍不清楚,限制了马铃薯分子育种的进程。未来的研究重点应集中在具有育种应用价值的功能基因挖掘和前沿育种技术研发。此外,将马铃薯的无性繁殖方式改造为有性生殖之后,一些原本很少关注的科学问题也浮现出来,例如马铃薯雌雄配子的发育、种子的形成和萌发等。因此,有必要对马铃薯有性生殖相关的生物学问题进行研究,为平衡营养生长和生殖生长的关系以及通过人工调控有性生殖实现特定育种目标提供基础。例如,在马铃薯杂交种子生产过程中为了避免人工去雄,可以参考水稻等作物培育细胞质雄性不育系,但是马铃薯收获的产品器官不是种子而是地下的薯块,因此不需要培育恢复系,制种体系更加简单;由于父本中没有恢复基因,杂交种也是雄性不育的,抑制了地上部分坐果,反而会进一步增加地下薯块的产量。二倍体育种最大的优势是可以开展基于自交系的回交育种,在保持原有遗传背景的基础上不断导入新的有益性状、清除有害突变,从而实现品种的快速更新迭代。例如晚疫病是马铃薯的“头号”病害,来自野生种的抗晚疫病基因很难直接转育到四倍体栽培种中并进行聚合,而利用二倍体育种体系可以快速地实现野生抗病基因的渐渗和聚合,选育突破性的高抗品种。经过十多年的发展,杂交优势利用已经成为马铃薯育种的前沿阵地,越来越多的企业、大学和科研单位在该领域布局,相信不远的未来马铃薯产业将迎来自己的“绿色革命”













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