最近,来自美国佛罗里达大学(University of Florida)的Zhen Fan和Vance M Whitaker在The Plant Cell在线发表了题为Genomic signatures of strawberry domestication and diversification的研究论文,探索了栽培草莓的育种历史和遗传足迹。
栽培草莓源于北美的弗吉尼亚草莓(F. virginiana)和南美的智利草莓(F. chiloensis)的杂交。草莓最初的杂交发生在18世纪的欧洲,是世界上最晚被驯化的作物之一。在过去的五十年里,由加州大学戴维斯分校和佛罗里达大学培育的品种由于其产量和果实质量的改善以及对地中海和亚热带气候的适应性在全球广受欢迎。
最初的杂交和随后草莓品种对不同气候的适应如何塑造了现代育种种群的遗传组成?育种过程中使用了哪些野生种/亚种?我们能否识别出与重要农艺性状相关的基因组区块,以及它们是否受到选择?
通过分析289个草莓品种的全基因组序列,我们确认在现代品种中弗吉尼亚草莓的祖先比例比初始杂交品种增加了20%,而智利草莓太平洋亚种的比例从0增加到了3.4%。地中海(加州)和亚热带(佛罗里达)气候的趋异进化导致两种草莓在28条染色体中的21条上差异选择。我们还发现了16个可能对适应气候重要的基因组区域。自初始杂交以来,草莓育种已经经历了超过20个周期的杂交和选择,但超过一半与产量和果实大小相关的遗传位点仍未受到人工选择。
与果实大小和产量相关的候选基因需要进一步的生物学验证。
参考文献:
Zhen Fan, Vance M Whitaker, Genomic signatures of strawberry domestication and diversification, The Plant Cell, Volume 36, Issue 5, May 2024, Pages 1622–1636, https://doi.org/10.1093/plcell/koad314
原文:Zhen Fan and Vance M. Whitaker
译者:Baiying Li, TPC Assistant Features Editor
编辑:Xiaowen Shi, TPC Special Content Editor